PITCHER (Heterogeneidad de Carcinomatosis Peritoneal)

Se conoce poco cómo la desregulación epigenética afecta los patrones de expresión génica en subclones del mismo tumor. La Carcinomatosis Peritoneal (CP) es una condición en la que se desarrollan múltiples metástasis de un mismo tumor abdominal en la cavidad peritoneal y órganos intraperitoneales, definiendo así diferentes ecosistemas de un mismo cáncer. PITCHER aborda las variaciones en la expresión génica regulada epigenéticamente entre diferentes subclones de PC en relación con las mecanorrespuestas celulares, proporcionando información sobre cómo evolucionan los paisajes epigenéticos del cáncer bajo presiones ambientales y sobre las estrategias utilizadas por las células cancerosas para adaptarse a la transición de un ecosistema a otro.

PITCHER es una red de 10 equipos de Lyon, Grenoble y Marsella, basada en datos y recogida de muestras de pacientes que se han sometido a una cirugía de carcinomatosis peritoneal de origen ovárico o colorrectal. Las lesiones de PC y, eventualmente, las muestras coincidentes de tumores primarios se recolectarán en los mismos pacientes en el momento de la cirugía o, eventualmente, se recuperarán de muestras ya existentes. Los paisajes epigenéticos se analizarán mediante una tubería de bioinformática que combina la secuenciación del exoma, el transcriptoma y el metiloma para identificar "puntos críticos epigenéticos", y se evaluarán sus variaciones entre las lesiones. Estos análisis se realizarán en muestras frescas (cuando estén disponibles) o preexistentes. Cuando sea posible, los cultivos de organoides y los modelos animales se derivarán de estructuras multicelulares en los fluidos peritoneales y la membrana, las mecanorrespuestas citoesqueléticas y nucleoesqueléticas se caracterizarán mediante microscopía de fuerza atómica. Se abordará el papel de la axonogénesis tumoral, un proceso de neoformación de fibras axónicas en los tumores. Se realizarán estudios experimentales de las respuestas celulares a la terapia para derivar modelos predictivos matemáticos. Todos los componentes se integrarán en un mapa de biología de sistemas de PC.