MISC COVID-19 -tutkimus lapsiväestöstä (COVID-19)

Tieteellinen tausta:

COVID-19 on maailmanlaajuinen terveyskriisi. Kliiniset ominaisuudet, taudin eteneminen ja lopputulos lapsilla ja nuorilla aikuisilla näyttävät huomattavasti lievemmiltä kuin vanhemmilla henkilöillä. Sen jälkeen, kun COVID-19 ilmoitettiin ensimmäisen kerran Wuhanissa, Kiinassa joulukuussa 2019, se on levinnyt nopeasti ja vaikuttaa yli 200 maahan maailmanlaajuisesti. Lapset ovat 1–5 % diagnosoiduista COVID-19-tapauksista; vaikka monet tartunnan saaneet lapset voivat olla oireettomia, eikä niitä siksi diagnosoida ilman väestöseulontaa. Suurin osa tartunnan saaneista lapsista on todennäköisesti toissijaisia ​​tapauksia ja saa tartunnan altistuttuaan COVID-19-positiiviselle aikuiselle, vaikka tämän vahvistamiseksi ei ole vielä pitkittäistietoja. Perheensisäinen tartunta voi olla tärkeää, koska määrittämätön osa COVID-19-tautia sairastavista lapsista on oireellisia ja voi edistää tartuntaa. Useat raportit ovat osoittaneet, että lapsilla ja nuorilla aikuisilla tauti on lievempi kuin aikuisilla. Oireettomia, lieviä ja kohtalaisia ​​infektioita on yli 90 % kaikista lapsista, joiden COVID-19-testi on positiivinen, ja vakavia ja kriittisiä tapauksia on vähemmän (5,9 %) verrattuna aikuisiin (18,5 %). Koska vaikea COVID-19 vaikuttaa hyvin harvinaiselta lapsilla, tärkeä osa tätä arviointia on selvittää, onko SARS-CoV-2:n positiivinen RT-PCR kliinisesti tärkeä tekijä lapsen tilan selittämisessä vai voiko kyseessä olla enemmän piilevä patologia. vastuussa.

Kun COVID-19-pandemia ilmoitettiin ensimmäisen kerran Aasiassa ja levisi alun perin kaikkialle maailmaan, lastenlääkärit olivat kiitollisia siitä, että lapset näyttivät olevan useimmissa tapauksissa vain lieviä oireita. Sitten Englannin kansallinen terveyspalvelu tuli huhtikuussa 2020 hälyttävän varoituksen tapauksista, joissa vanhemmilla kouluikäisillä lapsilla ja nuorilla oli kuumetta, hypotensiota, vaikeaa vatsakipua ja sydämen vajaatoimintaa ja joiden SARS-CoV-2-infektio oli positiivinen joko nenänielun RT-PCR-testillä tai vasta-ainetestillä. Näillä lapsilla oli laboratoriolöydöksiä sytokiinimyrskystä, mukaan lukien korkeat seerumin IL-6-tasot, ja he tarvitsivat yleensä inotrooppista tukea sydämen minuuttitilavuuden lisäämiseksi ja harvoin kehonulkoisen kalvon hapetuksen tarpeessa. Lähes kaikki nämä lapset eivät enää tarvinneet tehohoitoa vain muutaman päivän jälkeen ja toipuivat täysin, vaikka harvinaiset kuolemat johtuivat kehonulkoisen kalvon hapetuksen komplikaatioista. Tapaussarjoja lapsista, joilla on tämä sairaus, on nyt raportoitu Isosta-Britanniasta, Italiasta, Espanjasta, Ranskasta ja Sveitsistä sekä Yhdysvalloista. Centers for Disease Control and Prevention (CDC) on kehittänyt tapausmääritelmän käytettäväksi Yhdysvalloissa ja on nimennyt tilan multisystem inflammatorinen oireyhtymä lapsille (MIS-C). Jos MIS-C todella liittyy SARS-CoV-2-infektioon, taudin patofysiologinen mekanismi on epäselvä.

Hyvin harvat tutkimukset ovat käsitelleet immuunivasteita SARS-CoV2:lle (joko humoraalinen tai soluvälitteinen immuniteetti) lapsilla. Siksi on tarpeen tutkia immuunivasteita oireettomissa infektioissa, aiemmissa infektioissa ja MIS-C:ssä taudin patogeneesin ymmärtämiseksi.

Patogeenien, erityisesti virusten, koko genomin sekvensointi on tehokas työkalu nopean tiedon tuottamiseen taudinpurkauksista, mikä johtaa tehokkaaseen ymmärrykseen tartunnan leviämisestä, leviämisen dynamiikasta ja tietoon perustuvien tautipesäkkeiden torjuntapäätösten vaikutuksista. Itse asiassa genomidataa voidaan käyttää tunnistamaan patogeenigeenit, jotka ovat vuorovaikutuksessa isännän kanssa, ja se mahdollistaa patogeenin genomin evoluutiorajoitteisten alueiden karakterisoinnin, jotka tulisi ensisijaisesti kohdistaa, jotta vältetään nopeat lääkkeiden ja rokotteiden mutantit. (1). Koska SARS-CoV-2-virus kilpailee ympäri maailmaa eri väestöryhmissä, on ponnisteltava yhtenäisesti demografisesti jakautuneiden kantojen erojen ymmärtämiseksi. Koska SARS-CoV-2:n leviäminen riippuu ihmisten vuorovaikutuksen laajuudesta, geneettisen monimuotoisuuden korrelaatiosta saadut oivallukset antaisivat elintärkeää tietoa tartunnan torjumiseksi.

Äskettäin julkaistut tutkimukset ovat raportoineet, että verrattaessa 305 intialaista SARS-CoV-2-genomia tunnistetaan useita nukleotidivariantteja tai erottuvia kohtia. Viimeaikainen kirjallisuus raportoi, että Intiassa on useita SARS-CoV-2-sukupolkuja eri maantieteellisillä alueilla. 20A ja 20B yhdessä (jotka kuuluvat entiseen A2a:n haplotyyppiin) ovat hallitsevia haplotyyppejä koko Intian tasolla ja kullakin alueella. Mielenkiintoista on, että haplotyypit olivat jakautuneet eri tavalla eri alueilla. Vaikka 20A oli runsain Pohjois- ja Itä-Intiassa, 20B:n havaittiin olevan runsain haplotyyppi Länsi- ja Etelä-Intiassa. Esi-isän haplotyypit 19A ja 19B löydettiin enimmäkseen Pohjois- ja Itä-Intiassa, ja 19B oli runsain jälkimmäisellä alueella. Vaikka useita haplotyyppejä otettiin käyttöön epidemian alkuvaiheessa maalis-toukokuussa 2020, 20A-, B- ja C-haplotyypeistä (A2a) tuli hallitsevia haplotyyppejä kaikilla alueilla kesäkuuhun 2020 mennessä. Ei kuitenkaan ole olemassa tutkimuksia, jotka olisivat luonnehtineet virusten monimuotoisuutta tässä lapsiväestössä ja sen yhteyttä immunologiseen vasteeseen ja taudin vaikeusasteeseen SARS-CoV-2-tartunnan saaneilla lapsilla.

Opintojen tavoitteet:

• Suorittaa SARS-CoV2-infektion, COVID-19-taudin ja MIS-C:n järjestelmäimmunologiaa lapsille
• Tunnistaa SARS-CoV2-viruksen monimuotoisuus lapsiväestössä ja korreloida immuunivasteiden ja taudin vaikeusasteen kanssa.