MISC COVID-19-studie i pediatrisk population (COVID-19)

Vetenskaplig bakgrund:

Covid-19 är en global hälsokris. De kliniska egenskaperna, sjukdomsprogressionen och resultatet hos barn och unga vuxna verkar betydligt mildare jämfört med äldre individer. Sedan det först rapporterades i Wuhan, Kina i december 2019, har covid-19 spridits snabbt och påverkat över 200 länder över hela världen. Barn står för 1–5 % av diagnostiserade fall av covid-19; även om många infekterade barn kan vara asymtomatiska och därför inte diagnostiseras utan befolkningsscreening. De flesta infekterade barn är sannolikt sekundära fall och får infektionen efter exponering för en covid-19-positiv vuxen, även om det inte finns några longitudinella data som bekräftar detta ännu. Smitta inom familjen kan vara viktig eftersom en okvantifierad andel barn med covid-19 är symtomatisk och kan bidra till överföring. Flera rapporter har visat att barn och unga vuxna har en mildare form av sjukdomen jämfört med vuxna. Asymtomatiska, lindriga och måttliga infektioner utgör över 90 % av alla barn som har testat positivt för covid-19 med färre allvarliga och kritiska fall (5,9 %) jämfört med vuxna (18,5 %). Med tanke på att allvarlig covid-19 förefaller mycket sällsynt hos barn, är en viktig del av denna bedömning att fastställa om en positiv RT-PCR för SARS-CoV-2 är en kliniskt viktig faktor för att förklara barnets tillstånd, eller om mer ockult patologi kan vara ansvarig.

När covid-19-pandemin första gången rapporterades i Asien och till en början spreds över hela världen, var barnläkare tacksamma för att barn i de flesta fall verkade vara lätt symtomatiska med infektionen. Sedan kom en alarmerande varning från National Health Service i England i april 2020 om fall av äldre barn och ungdomar i skolåldern med feber, hypotoni, svår buksmärta och hjärtdysfunktion som testade positivt för SARS-CoV-2-infektion antingen nasofaryngeal RT-PCR-analys eller genom antikroppstestning. Dessa barn hade laboratoriefynd av cytokinstorm, inklusive höga IL-6-nivåer i serum, och krävde i allmänhet inotropt stöd för att öka hjärtminutvolymen med sällsynt behov av extrakorporeal membransyresättning. Nästan alla dessa barn behövde inte längre intensivvård efter bara några dagar och blev helt återställda, även om sällsynta dödsfall berodde på komplikationer av extrakorporeal membransyresättning. Fallserier av barn med detta tillstånd har nu rapporterats från Storbritannien, Italien, Spanien, Frankrike och Schweiz och USA. Centers for Disease Control and Prevention (CDC) har utvecklat en falldefinition för användning i USA och har kallat tillståndet multisystem inflammatory syndrome in children (MIS-C). Om MIS-C verkligen är relaterat till infektion med SARS-CoV-2, är den patofysiologiska mekanismen för sjukdomen oklar.

Mycket få studier har behandlat immunsvaret mot SARS-CoV2 (antingen humoral eller cellmedierad immunitet) hos barn. Det är därför nödvändigt att studera immunsvaret vid asymtomatiska infektioner, tidigare infektioner och MIS-C för att förstå sjukdomens patogenes.

Helgenomsekvensering av patogener, särskilt virus, är ett kraftfullt verktyg för att generera snabb information om utbrott, vilket resulterar i effektiv förståelse för införandet av infektionen, överföringsdynamiken och inverkan av informerade beslut om utbrottskontroll. Faktum är att genomiska data kan användas för att identifiera patogengener som interagerar med värden och möjliggör karakterisering av de mer evolutionära begränsade regionerna av ett patogengenom, som företrädesvis bör riktas in för att undvika snabba läkemedels- och vaccinflyktsmutanter. (1). När SARS-CoV-2-viruset rasar runt om i världen över den olika befolkningen, måste det göras en konsoliderad ansträngning för att förstå skillnaderna mellan demografiskt fördelade stammar. Eftersom överföringen av SARS-CoV-2 är föremål för omfattningen av mänsklig interaktion, skulle insikterna från korrelationen av genetisk mångfald ge viktig information för att hantera denna överföring.

Nyligen publicerade studier har rapporterat att när man jämför de 305 indiska SARS-CoV-2-genomen, identifieras ett antal nukleotidvarianter eller segregerande platser. Den senaste litteraturen rapporterar att det finns flera härkomster av SARS-CoV-2 i Indien i olika geografiska regioner. 20A och 20B tillsammans (tillhör den tidigare haplotypen av A2a) är de dominerande haplotyperna på pan-Indisk nivå och i varje region. Intressant nog var haplotyperna differentiellt fördelade i olika regioner. Medan 20A var vanligast i norra och östra Indien, visade sig 20B vara den vanligaste haplotypen i västra och södra Indien. De förfäders haplotyper av 19A och 19B hittades mestadels i norra och östra Indien, med 19B som den vanligaste i den senare regionen. Medan flera haplotyper introducerades under den tidiga delen av utbrottet i mars-maj 2020, blev 20A, B och C haplotyperna (A2a) de dominerande haplotyperna i alla regioner i juni 2020. Det finns dock inga studier som har karakteriserat den virala mångfalden i denna pediatriska population och dess samband med immunologiskt svar och sjukdomens svårighetsgrad hos SARS-CoV-2-infekterade barn.

Studiemål:

• För att utföra systemimmunologi av SARS-CoV2-infektion, COVID-19-sjukdom och MIS-C hos barn
• Att identifiera SARS-CoV2 virala mångfald i den pediatriska populationen och korrelera med immunsvar och sjukdomens svårighetsgrad.