MISC studie COVID-19 u pediatrické populace (COVID-19)

Vědecké pozadí:

COVID-19 je celosvětová zdravotní krize. Klinické charakteristiky, progrese onemocnění a výsledek u dětí a mladých dospělých se zdají být výrazně mírnější ve srovnání se staršími jedinci. Od prvního nahlášení ve Wu-chanu v Číně v prosinci 2019 se COVID-19 rychle rozšířil a zasáhl více než 200 zemí po celém světě. Děti tvoří 1–5 % diagnostikovaných případů COVID-19; ačkoli mnoho infikovaných dětí může být asymptomatických, a proto nejsou diagnostikovány bez populačního screeningu. Většina infikovaných dětí jsou pravděpodobně sekundární případy a získají infekci po expozici dospělému pozitivnímu na COVID-19, ačkoli zatím neexistují žádné dlouhodobé údaje, které by to potvrdily. Přenos v rámci rodiny může být důležitý, protože nekvantifikovaný podíl dětí s COVID-19 v oblasti symptomů a může přispívat k přenosu. Několik zpráv prokázalo, že děti a mladí dospělí mají mírnější formu onemocnění ve srovnání s dospělými. Asymptomatické, mírné a středně těžké infekce zahrnují více než 90 % všech dětí, které byly pozitivně testovány na COVID-19, s menším počtem závažných a kritických případů (5,9 %) ve srovnání s dospělými (18,5 %). Vzhledem k tomu, že závažný COVID-19 se u dětí objevuje velmi vzácně, je důležitou součástí tohoto hodnocení zjištění, zda je pozitivní RT-PCR pro SARS-CoV-2 klinicky důležitým faktorem pro vysvětlení stavu dítěte, nebo zda může jít o skrytější patologii. odpovědný.

Když byla pandemie COVID-19 poprvé hlášena v Asii a zpočátku se rozšířila po celém světě, pediatři byli vděční za to, že se zdálo, že děti mají infekci ve většině případů jen mírně. Poté přišlo v dubnu 2020 od Národní zdravotní služby v Anglii alarmující varování o případech starších dětí a dospívajících ve školním věku s horečkou, hypotenzí, silnou bolestí břicha a srdeční dysfunkcí, kteří byli pozitivně testováni na infekci SARS-CoV-2 buď nasofaryngeální RT-PCR test nebo testováním protilátek. Tyto děti měly laboratorní nálezy cytokinové bouře, včetně vysokých hladin IL-6 v séru, a obecně vyžadovaly inotropní podporu ke zvýšení srdečního výdeje se vzácnou potřebou mimotělní membránové oxygenace. Téměř všechny tyto děti již po několika dnech nevyžadovaly intenzivní péči a zcela se zotavily, ačkoli vzácná úmrtí byla způsobena komplikacemi mimotělní membránové oxygenace. Série případů dětí s tímto onemocněním byly nyní hlášeny z Velké Británie, Itálie, Španělska, Francie a Švýcarska a Spojených států. Centra pro kontrolu a prevenci nemocí (CDC) vyvinula definici případu pro použití ve Spojených státech a nazvala stav multisystémový zánětlivý syndrom u dětí (MIS-C). Pokud MIS-C skutečně souvisí s infekcí SARS-CoV-2, patofyziologický mechanismus onemocnění není jasný.

Velmi málo studií se zabývalo imunitními reakcemi na SARS-CoV2 (buď humorální nebo buňkami zprostředkovaná imunita) u dětí. Je proto nezbytné studovat imunitní odpovědi u asymptomatických infekcí, předchozích infekcí a MIS-C, abychom pochopili patogenezi onemocnění.

Celogenomové sekvenování patogenů, zejména virů, je mocným nástrojem pro vytváření rychlých informací o ohniscích, což vede k efektivnímu pochopení zavlečení infekce, dynamiky přenosu a dopadu informovaných rozhodnutí o kontrole ohniska. Genomická data mohou být skutečně použita k identifikaci patogenních genů interagujících s hostitelem a umožňují charakterizaci evolučně omezenějších oblastí genomu patogenu, na které by měly být přednostně zacíleny, aby se zabránilo rychlému úniku z léků a vakcín. (1). Vzhledem k tomu, že virus SARS-CoV-2 závodí po celém světě v různých populacích, je třeba vyvinout konsolidované úsilí o pochopení rozdílnosti demograficky distribuovaných kmenů. Vzhledem k tomu, že přenos SARS-CoV-2 podléhá rozsahu lidské interakce, poznatky z korelace genetické diverzity by poskytly zásadní informace pro řešení tohoto přenosu.

Nedávné publikované studie uvádějí, že při srovnání 305 indických genomů SARS-CoV-2 bylo identifikováno množství nukleotidových variant nebo segregačních míst. Nedávná literatura uvádí, že v Indii existuje několik linií SARS-CoV-2 v různých geografických oblastech. 20A a 20B společně (patřící k bývalému haplotypu A2a) jsou převládajícími haplotypy na úrovni celé Indie a v každé oblasti. Je zajímavé, že haplotypy byly rozdílně distribuovány v různých oblastech. Zatímco 20A byly nejhojnější v severní a východní Indii, bylo zjištěno, že 20B je nejhojnějším haplotypem v západní a jižní Indii. Haplotypy předků 19A a 19B byly většinou nalezeny v severní a východní Indii, přičemž 19B je nejhojnější v této oblasti. Zatímco během rané fáze vypuknutí v březnu až květnu 2020 bylo zavedeno více haplotypů, haplotypy 20A, B a C (A2a) se do června 2020 staly převládajícími haplotypy ve všech regionech. Neexistují však žádné studie, které by charakterizovaly virovou diverzitu v této dětské populaci a její souvislost s imunologickou odpovědí a závažností onemocnění u dětí infikovaných SARS-CoV-2.

Studijní cíle:

• Provádět systémovou imunologii infekce SARS-CoV2, onemocnění COVID-19 a MIS-C u dětí
• Identifikovat diverzitu viru SARS-CoV2 v dětské populaci a korelovat s imunitními reakcemi a závažností onemocnění.