Étude MISC COVID-19 dans la population pédiatrique (COVID-19)

Contexte scientifique :

Le COVID-19 est une crise sanitaire mondiale. Les caractéristiques cliniques, la progression de la maladie et les résultats chez les enfants et les jeunes adultes semblent significativement plus doux par rapport aux personnes plus âgées. Depuis qu'il a été signalé pour la première fois à Wuhan, en Chine, en décembre 2019, le COVID-19 s'est rapidement propagé, touchant plus de 200 pays dans le monde. Les enfants représentent 1 à 5 % des cas de COVID-19 diagnostiqués ; cependant, de nombreux enfants infectés peuvent être asymptomatiques et donc ne pas être diagnostiqués sans dépistage de la population. La plupart des enfants infectés sont susceptibles d'être des cas secondaires et de contracter l'infection après avoir été exposés à un adulte positif au COVID-19, bien qu'il n'existe pas encore de données longitudinales pour le confirmer. La transmission intrafamiliale peut être importante car une proportion non quantifiée d'enfants atteints de COVID-19 est symptomatique et peut contribuer à la transmission. Plusieurs rapports ont démontré que les enfants et les jeunes adultes ont une forme plus bénigne de la maladie par rapport aux adultes. Les infections asymptomatiques, légères et modérées représentent plus de 90 % de tous les enfants qui ont été testés positifs pour le COVID-19 avec moins de cas graves et critiques (5,9 %) par rapport aux adultes (18,5 %). Étant donné que le COVID-19 grave semble très rare chez les enfants, une partie importante de cette évaluation consiste à déterminer si une RT-PCR positive pour le SRAS-CoV-2 est un facteur cliniquement important pour expliquer l'état de l'enfant, ou si une pathologie plus occulte peut être responsable.

Lorsque la pandémie de COVID-19 a été signalée pour la première fois en Asie et s'est initialement propagée dans le monde entier, les pédiatres étaient reconnaissants que les enfants ne semblaient être que légèrement symptomatiques de l'infection dans la plupart des cas. Ensuite, un avertissement alarmant est venu du National Health Service en Angleterre en avril 2020 concernant des cas d'enfants et d'adolescents d'âge scolaire plus âgés présentant de la fièvre, de l'hypotension, des douleurs abdominales sévères et un dysfonctionnement cardiaque qui ont été testés positifs pour l'infection par le SRAS-CoV-2 soit par test RT-PCR nasopharyngé ou par test d'anticorps. Ces enfants présentaient des résultats de laboratoire de tempête de cytokines, y compris des taux sériques élevés d'IL-6, et nécessitaient généralement un soutien inotrope pour augmenter le débit cardiaque avec un besoin rare d'oxygénation de la membrane extracorporelle. Presque tous ces enfants n'ont plus eu besoin de soins intensifs après seulement quelques jours et se sont complètement rétablis, bien que de rares décès aient résulté de complications de l'oxygénation extracorporelle de la membrane. Des séries de cas d'enfants présentant cette condition ont maintenant été signalées au Royaume-Uni, en Italie, en Espagne, en France et en Suisse, ainsi qu'aux États-Unis. Les Centers for Disease Control and Prevention (CDC) ont élaboré une définition de cas à utiliser aux États-Unis et ont appelé la condition syndrome inflammatoire multisystémique chez les enfants (MIS-C). Si le MIS-C est effectivement lié à une infection par le SRAS-CoV-2, le mécanisme physiopathologique de la maladie n'est pas clair.

Très peu d'études ont porté sur les réponses immunitaires au SRAS-CoV2 (immunité humorale ou à médiation cellulaire) chez les enfants. Il est donc nécessaire d'étudier les réponses immunitaires dans les infections asymptomatiques, les infections antérieures et le MIS-C pour comprendre la pathogenèse de la maladie.

Le séquençage du génome entier des agents pathogènes, en particulier des virus, est un outil puissant pour générer rapidement des informations sur les épidémies, ce qui permet une compréhension efficace de l'introduction de l'infection, de la dynamique de transmission et de l'impact des décisions éclairées de contrôle des épidémies. En effet, les données génomiques peuvent être utilisées pour identifier les gènes pathogènes interagissant avec l'hôte et permettent de caractériser les régions les plus évolutives d'un génome pathogène, qui doivent être ciblées de manière préférentielle pour éviter les mutants d'échappement rapide des médicaments et des vaccins. (1). Alors que le virus du SRAS-CoV-2 fait le tour du monde à travers les différentes populations, il doit y avoir un effort consolidé pour comprendre la divergence des souches démographiquement distribuées. Étant donné que la transmission du SRAS-CoV-2 est soumise à l'étendue de l'interaction humaine, les informations tirées de la corrélation de la diversité génétique fourniraient des informations vitales pour lutter contre cette transmission.

Des études récentes publiées ont rapporté que lors de la comparaison des 305 génomes indiens du SRAS-CoV-2, un certain nombre de variantes de nucléotides ou de sites de ségrégation ont été identifiés. La littérature récente rapporte qu'il y a la présence de plusieurs lignées de SARS-CoV-2 en Inde dans différentes régions géographiques. 20A et 20B ensemble (appartenant à l'ancien haplotype de A2a) sont les haplotypes prédominants au niveau pan indien et dans chaque région. Fait intéressant, les haplotypes étaient distribués de manière différentielle dans différentes régions. Alors que les 20A étaient les plus abondants dans le nord et l'est de l'Inde, 20B s'est avéré être l'haplotype le plus abondant dans l'ouest et le sud de l'Inde. Les haplotypes ancestraux de 19A et 19B ont été principalement trouvés dans le nord et l'est de l'Inde, 19B étant le plus abondant dans cette dernière région. Alors que plusieurs haplotypes ont été introduits au début de l'épidémie en mars-mai 2020, les haplotypes 20A, B et C (A2a) sont devenus les haplotypes prédominants dans toutes les régions en juin 2020. Cependant, aucune étude n'a caractérisé la diversité virale dans cette population pédiatrique et son association avec la réponse immunologique et la gravité de la maladie, chez les enfants infectés par le SRAS-CoV-2.

Objectifs de l'étude :

• Pour effectuer l'immunologie systémique de l'infection par le SRAS-CoV2, la maladie COVID-19 et le MIS-C chez les enfants
• Identifier la diversité virale du SRAS-CoV2 dans la population pédiatrique et établir une corrélation avec les réponses immunitaires et la gravité de la maladie.