Badanie MISC COVID-19 w populacji pediatrycznej (COVID-19)

Tło naukowe:

COVID-19 to globalny kryzys zdrowotny. Charakterystyka kliniczna, postęp choroby i wyniki u dzieci i młodych dorosłych wydają się znacznie łagodniejsze w porównaniu z osobami starszymi. Od czasu pierwszego zgłoszenia w Wuhan w Chinach w grudniu 2019 r. COVID-19 szybko się rozprzestrzenił, dotykając ponad 200 krajów na całym świecie. Dzieci stanowią 1-5% zdiagnozowanych przypadków COVID-19; chociaż wiele zakażonych dzieci może przebiegać bezobjawowo i dlatego nie można ich zdiagnozować bez badań przesiewowych populacji. Większość zarażonych dzieci jest prawdopodobnie przypadkami wtórnymi i zaraża się po kontakcie z osobą dorosłą z pozytywnym wynikiem na COVID-19, chociaż nie ma jeszcze danych podłużnych, które by to potwierdziły. Transmisja wewnątrzrodzinna może być ważna, ponieważ nieokreślony ilościowo odsetek dzieci z obszarami COVID-19 ma objawy i może przyczyniać się do transmisji. Wiele doniesień wykazało, że dzieci i młodzi dorośli mają łagodniejszą postać choroby w porównaniu z dorosłymi. Bezobjawowe, łagodne i umiarkowane infekcje obejmują ponad 90% wszystkich dzieci, które uzyskały pozytywny wynik testu na obecność COVID-19, z mniejszą liczbą ciężkich i krytycznych przypadków (5,9%) w porównaniu z dorosłymi (18,5%). Biorąc pod uwagę, że ciężki COVID-19 pojawia się bardzo rzadko u dzieci, ważną częścią tej oceny jest ustalenie, czy pozytywny wynik RT-PCR dla SARS-CoV-2 jest klinicznie ważnym czynnikiem wyjaśniającym stan dziecka, czy też może być więcej ukrytych patologii odpowiedzialny.

Kiedy pandemia COVID-19 została po raz pierwszy zgłoszona w Azji i początkowo rozprzestrzeniła się na cały świat, pediatrzy byli wdzięczni, że w większości przypadków dzieci wydawały się mieć tylko łagodne objawy infekcji. Następnie w kwietniu 2020 r. Narodowa Służba Zdrowia w Anglii nadeszła alarmujące ostrzeżenie o przypadkach starszych dzieci i młodzieży w wieku szkolnym z gorączką, niedociśnieniem, silnym bólem brzucha i dysfunkcją serca, u których wynik testu na obecność SARS-CoV-2 był dodatni albo przez test RT-PCR nosowo-gardłowy lub test na obecność przeciwciał. U tych dzieci stwierdzono laboratoryjnie burzę cytokinową, w tym wysoki poziom IL-6 w surowicy, i ogólnie wymagały one wsparcia inotropowego w celu zwiększenia pojemności minutowej serca z rzadką potrzebą pozaustrojowego utlenowania błony. Prawie wszystkie z tych dzieci nie wymagały już intensywnej opieki już po kilku dniach i całkowicie wyzdrowiały, chociaż rzadkie zgony wynikały z powikłań pozaustrojowego utlenowania błon. Seria przypadków dzieci z tą chorobą została zgłoszona z Wielkiej Brytanii, Włoch, Hiszpanii, Francji i Szwajcarii oraz Stanów Zjednoczonych. Centrum Kontroli i Zapobiegania Chorobom (CDC) opracowało definicję przypadku do stosowania w Stanach Zjednoczonych i nazwało stan wieloukładowy zespół zapalny u dzieci (MIS-C). Jeśli MIS-C jest rzeczywiście związany z zakażeniem SARS-CoV-2, mechanizm patofizjologiczny choroby jest niejasny.

Bardzo niewiele badań dotyczyło odpowiedzi immunologicznych na SARS-CoV2 (odporność humoralna lub komórkowa) u dzieci. Dlatego konieczne jest zbadanie odpowiedzi immunologicznej w bezobjawowych infekcjach, wcześniejszych infekcjach i MIS-C, aby zrozumieć patogenezę choroby.

Sekwencjonowanie całego genomu patogenów, zwłaszcza wirusów, jest potężnym narzędziem do generowania szybkich informacji o epidemiach, co skutkuje skutecznym zrozumieniem wprowadzenia infekcji, dynamiki przenoszenia i wpływu świadomych decyzji dotyczących kontroli epidemii. Rzeczywiście, dane genomowe mogą być wykorzystane do identyfikacji genów patogenu oddziałujących z gospodarzem i pozwalają na scharakteryzowanie bardziej ograniczonych ewolucyjnie regionów genomu patogenu, które powinny być preferencyjnie ukierunkowane, aby uniknąć szybkich mutantów uciekających przed lekami i szczepionkami. (1). Ponieważ wirus SARS-CoV-2 ściga się po całym świecie w różnych populacjach, należy podjąć skonsolidowane wysiłki, aby zrozumieć rozbieżności szczepów rozłożonych demograficznie. Ponieważ przenoszenie SARS-CoV-2 zależy od zakresu interakcji międzyludzkich, spostrzeżenia wynikające z korelacji różnorodności genetycznej dostarczyłyby istotnych informacji, aby poradzić sobie z tą transmisją.

Niedawno opublikowane badania wykazały, że porównując 305 indyjskich genomów SARS-CoV-2, zidentyfikowano szereg wariantów nukleotydów lub miejsc segregacji. Najnowsze piśmiennictwo podaje, że w Indiach występuje wiele linii SARS-CoV-2 w różnych regionach geograficznych. 20A i 20B razem (należące do poprzedniego haplotypu A2a) są dominującymi haplotypami na poziomie ogólnoindyjskim iw każdym regionie. Co ciekawe, haplotypy były różnie rozmieszczone w różnych regionach. Podczas gdy 20A występowało najliczniej w północnych i wschodnich Indiach, stwierdzono, że 20B jest najliczniejszym haplotypem w zachodnich i południowych Indiach. Haplotypy przodków 19A i 19B występowały głównie w północnych i wschodnich Indiach, przy czym 19B był najliczniejszy w tym ostatnim regionie. Podczas gdy wiele haplotypów zostało wprowadzonych na początku epidemii w marcu-maju 2020 r., haplotypy 20A, B i C (A2a) stały się dominującymi haplotypami we wszystkich regionach do czerwca 2020 r. Nie ma jednak badań, które charakteryzowałyby różnorodność wirusową w tej populacji pediatrycznej i jej związek z odpowiedzią immunologiczną i ciężkością choroby u dzieci zakażonych SARS-CoV-2.

Cele studiów:

• Wykonanie immunologii systemowej zakażenia SARS-CoV2, choroby COVID-19 oraz MIS-C u dzieci
• Identyfikacja różnorodności wirusa SARS-CoV2 w populacji pediatrycznej i korelacja z odpowiedziami immunologicznymi i ciężkością choroby.