NGS sappirakon syövässä ja hoitovasteet
Geneettiset mutaatiot ja vaste hoitoon sappirakon syövässä: sairaalapohjainen kohorttitutkimus
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Ehdot
Interventio / Hoito
Yksityiskohtainen kuvaus
Sappirakon karsinooma (GBC) on yleisin sappitiesyöpätyyppi ja kolmanneksi yleisin ruoansulatuskanavan pahanlaatuinen syöpä Intiassa. GBC syntyy kroonisen tulehduksen yhteydessä, ja yleisin lähde on kolesterolisappikivet (yli 75 %:lla potilaista). Muita kroonisen tulehduksen syitä ovat primaarinen sklerosoiva kolangiitti, haavainen paksusuolitulehdus, maksalamput, krooniset Salmonella typhi- ja paratyphi-infektiot sekä helikobakteeri-infektio. Myös monia muita tekijöitä on tunnistettu, kuten tiettyjen kemikaalien nauttiminen, altistuminen vesien saastumiselle, raskasmetallit ja säteilyaltistus. Vain pieni osa GBC:stä liittyy perinnöllisiin oireyhtymiin, kuten Gardnerin oireyhtymään, tyypin I neurofibromatoosiin ja perinnölliseen ei-polypoosiseen paksusuolensyöpään.
GBC:ssä havaituista monista molekyylimuutoksista ei ole vielä ollut mahdollista määrittää, mitkä ovat neoplastisen prosessin "kuljettajageenejä" tai ohjaajia, ja erottaa niitä "matkustajageeneistä", joita havaitaan pääasiassa satunnaisissa pahanlaatuisissa kasvaimissa, kuten GBC, jossa epigeneettiset muutokset hallitsevat. GBC:n yleisimmin mutatoituneet geenit ovat: TP53 (41 %), CDKN2A (28 %) KRAS (19 %), TERT (8 %), CTNNB1 (8 %) ja PI3K (7 %). ERBB-perheen signalointireitti on yksi GBC:n yleisimmin mutatoituneista. Nämä reseptorit osallistuvat solujen lisääntymisen, erilaistumisen ja eloonjäämisen säätelyyn. Niiden monistuminen muuttuu pääasiassa proteiinin yliekspressioksi. Reseptori HER2/NEU aktivoi dimerisoitumisen jälkeen suuren määrän alavirran reittejä, kuten RAS-RAF-MEK-ERK1/2 tai PI3k-AKT-MTOR, joilla on suuri vaikutus solujen lisääntymiseen. Toisaalta PTEN (fosfataasi- ja tensiinihomologi) on kasvainsuppressorigeeni, joka koodaa proteiinia, jolla on fosfataasitoiminto ja joka inaktivoi substraatteja, kuten PI3K:n. Toiminnallisen PTEN-proteiinin puuttuminen mahdollistaa PI3k:n aktivoitumisen vielä voimakkaammalla intensiteetillä kuin aktivoiva mutaatio. itse PI3K:sta. PIP3:n hallitsematon tuotanto on yksi tärkeimmistä PI3K/AKT-reitin vaikuttajista mTOR:n kanssa, joka stimuloi apoptoosia säätelevää proteiinisynteesiä. PTEN-proteiinin immunohistokemiallista ilmentymistä pidetään hyvänä tapana arvioida geenin toiminnallista tilaa.
- Potilaiden kattava historia ja fyysinen tutkimus sekä kaikki yksityiskohdat kirjataan esiasetettuun esikuvaan. Kaikki ohjeiden mukaiset rutiinitutkimukset, mukaan lukien biopsia diagnoosin vahvistamiseksi ja vatsan CT/MRI/MRCP kasvaimen mittaamiseksi ja taudin vaiheen määrittämiseksi ennen hoidon aloittamista, kirjataan.
- Arkistokudosta tutkitaan geenimutaation ilmentymisen varalta molekyylianalyysillä käyttäen Next Generation Sequencing -menetelmää. Myös potilaat, joita hoidettiin vuosina 2017-2020, joissa NGS-tietoja on saatavilla, otetaan mukaan myös jälkikäteen. Heidän tietonsa poimitaan potilastiedot, ja heihin yritetään ottaa yhteyttä seurantaa varten.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: Manoj Pandey, MS, PhD
- Puhelinnumero: 2361014
- Sähköposti: mpandey66@bhu.ac.in
Tutki yhteystietojen varmuuskopiointi
- Nimi: S K Singh, MD, DM
- Puhelinnumero: 2361014
- Sähköposti: mdean.ims@gmail.com
Opiskelupaikat
-
-
UP
-
Varanasi, UP, Intia, 221005
- Rekrytointi
- Banaras Hindu University
-
Ottaa yhteyttä:
- Manoj Pandey, MS, PhD
- Sähköposti: mpandey66@bhu.ac.in
-
Ottaa yhteyttä:
- Manoj Pandey, MS, PhD
- Puhelinnumero: 2361014
- Sähköposti: mpandey66@bhu.ac.in
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Aiemmin hoitamattomat potilaat, joilla on histologisesti todistettu sappirakon karsinooma.
Poissulkemiskriteerit:
- Ei histologisia todisteita pahanlaatuisuudesta
- Raskaana olevat ja imettävät naiset
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Sappirakon syöpä
Potilaat, joilla on vahvistettu sappirakon syövän diagnoosi
|
NGS suoritetaan DNA:lle, joka on eristetty parafiiniin upotetusta kudoksesta
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Reaktio hoitoon
Aikaikkuna: 1 vuosi
|
Hoitovaste kemoterapian suhteen
|
1 vuosi
|
|
Kokonaisselviytyminen
Aikaikkuna: 5 vuotta
|
Potilaiden eloonjääminen diagnoosipäivästä tutkimuksen päättymiseen tai kuolemaan, kumpi on aikaisempi
|
5 vuotta
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
PFS
Aikaikkuna: 5 vuotta
|
Etenemisvapaa eloonjääminen diagnoosipäivästä taudin etenemiseen
|
5 vuotta
|
|
RFS
Aikaikkuna: 5 vuotta
|
Uusiutumisvapaa Eloonjääminen diagnoosipäivästä uusiutumisen tai metastaasin esiintymiseen
|
5 vuotta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Tutkijat
- Päätutkija: Manoj Pandey, MS, PhD, Banaras Hindu University
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Yleiset julkaisut
- Begnami MD, Fukuda E, Fregnani JH, Nonogaki S, Montagnini AL, da Costa WL Jr, Soares FA. Prognostic implications of altered human epidermal growth factor receptors (HERs) in gastric carcinomas: HER2 and HER3 are predictors of poor outcome. J Clin Oncol. 2011 Aug 1;29(22):3030-6. doi: 10.1200/JCO.2010.33.6313. Epub 2011 Jun 27.
- Sanders G, Kingsnorth AN. Gallstones. BMJ. 2007 Aug 11;335(7614):295-9. doi: 10.1136/bmj.39267.452257.AD. No abstract available.
- Hsing AW, Gao YT, Han TQ, Rashid A, Sakoda LC, Wang BS, Shen MC, Zhang BH, Niwa S, Chen J, Fraumeni JF Jr. Gallstones and the risk of biliary tract cancer: a population-based study in China. Br J Cancer. 2007 Dec 3;97(11):1577-82. doi: 10.1038/sj.bjc.6604047. Epub 2007 Nov 13.
- Ishiguro S, Inoue M, Kurahashi N, Iwasaki M, Sasazuki S, Tsugane S. Risk factors of biliary tract cancer in a large-scale population-based cohort study in Japan (JPHC study); with special focus on cholelithiasis, body mass index, and their effect modification. Cancer Causes Control. 2008 Feb;19(1):33-41. doi: 10.1007/s10552-007-9067-8. Epub 2007 Sep 30.
- Trajber HJ, Szego T, de Camargo HS Jr, Mester M, Marujo WC, Roll S. Adenocarcinoma of the gallbladder in two siblings. Cancer. 1982 Sep 15;50(6):1200-3. doi: 10.1002/1097-0142(19820915)50:63.0.co;2-a.
- Weiss KM, Ferrell RE, Hanis CL, Styne PN. Genetics and epidemiology of gallbladder disease in New World native peoples. Am J Hum Genet. 1984 Nov;36(6):1259-78.
- Tafe LJ, Tsongalis GJ. The human epidermal growth factor receptor 2 (HER2). Clin Chem Lab Med. 2011 Sep 15;50(1):23-30. doi: 10.1515/CCLM.2011.707.
- Ocana A, Vera-Badillo F, Al-Mubarak M, Templeton AJ, Corrales-Sanchez V, Diez-Gonzalez L, Cuenca-Lopez MD, Seruga B, Pandiella A, Amir E. Activation of the PI3K/mTOR/AKT pathway and survival in solid tumors: systematic review and meta-analysis. PLoS One. 2014 Apr 28;9(4):e95219. doi: 10.1371/journal.pone.0095219. eCollection 2014.
- Lavorato-Rocha AM, Anjos LG, Cunha IW, Vassallo J, Soares FA, Rocha RM. Immunohistochemical assessment of PTEN in vulvar cancer: best practices for tissue staining, evaluation, and clinical association. Methods. 2015 May;77-78:20-4. doi: 10.1016/j.ymeth.2014.12.017. Epub 2015 Jan 3.
- Sakr RA, Barbashina V, Morrogh M, Chandarlapaty S, Andrade VP, Arroyo CD, Olvera N, King TA. Protocol for PTEN expression by immunohistochemistry in formalin-fixed paraffin-embedded human breast carcinoma. Appl Immunohistochem Mol Morphol. 2010 Jul;18(4):371-4. doi: 10.1097/PAI.0b013e3181d50bd5.
- Djordjevic B, Hennessy BT, Li J, Barkoh BA, Luthra R, Mills GB, Broaddus RR. Clinical assessment of PTEN loss in endometrial carcinoma: immunohistochemistry outperforms gene sequencing. Mod Pathol. 2012 May;25(5):699-708. doi: 10.1038/modpathol.2011.208. Epub 2012 Feb 3.
- Rajput M, Chigurupati S, Purwar R, Shukla M, Pandey M. MAP kinase and mammalian target of rapamycin are main pathways of gallbladder carcinogenesis: results from bioinformatic analysis of next generation sequencing data from a hospital-based cohort (NCT05404347). Mol Biol Rep. 2022 Nov;49(11):10153-10163. doi: 10.1007/s11033-022-07874-4. Epub 2022 Aug 26.
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- NGSGB1
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
IPD-suunnitelman kuvaus
IPD-jaon aikakehys
IPD-jaon käyttöoikeuskriteerit
IPD-jakamista tukeva tietotyyppi
- STUDY_PROTOCOL
- MAHLA
- ICF
- ANALYTIC_CODE
- CSR
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .