NGS dans le cancer de la vésicule biliaire et réponse au traitement

Le carcinome de la vésicule biliaire (GBC) est le type le plus courant de carcinome des voies biliaires et la troisième tumeur maligne du tube digestif la plus courante en Inde. Le GBC survient dans le cadre d'une inflammation chronique et la source la plus courante est les calculs biliaires de cholestérol (chez plus de 75 % des patients). Les autres causes d'inflammation chronique comprennent la cholangite sclérosante primitive, la colite ulcéreuse, les douves du foie, les infections chroniques à Salmonella typhi et paratyphi et l'infection à Helicobacter. De nombreux autres facteurs ont également été identifiés tels que l'ingestion de certains produits chimiques, les expositions par la pollution de l'eau, les métaux lourds et l'exposition aux radiations. Seule une petite fraction des GBC est associée à des syndromes héréditaires comme le syndrome de Gardner, la neurofibromatose de type I et le cancer du côlon héréditaire sans polypose.

Parmi les multiples altérations moléculaires observées dans les GBC, il n'a pas encore été possible de déterminer lesquels sont les gènes « conducteurs » ou contrôleurs du processus néoplasique et de les différencier des gènes « passagers », ceux observés principalement dans les tumeurs malignes sporadiques comme GBC dans lequel les altérations épigénétiques prédominent. Les gènes les plus fréquemment mutés dans le GBC sont : TP53 (41 %), CDKN2A (28 %), KRAS (19 %), TERT (8 %), CTNNB1 (8 %) et PI3K (7 %). La voie de signalisation de la famille ERBB est l'une des plus fréquemment mutée dans le GBC. Ces récepteurs participent à la régulation de la prolifération, de la différenciation et de la survie des cellules. Leur amplification se traduit principalement par une surexpression de protéines. Le récepteur HER2/NEU, après dimérisation, active une grande variété de voies en aval telles que RAS-RAF-MEK-ERK1/2 ou PI3k-AKT-MTOR avec une grande influence sur la prolifération cellulaire. D'autre part, PTEN (homologue de la phosphatase et de la tensine) est un gène suppresseur de tumeur qui code pour une protéine à fonction phosphatase qui inactive les substrats comme PI3K L'absence de la protéine fonctionnelle PTEN permet l'activation de PI3k avec une intensité encore plus grande que la mutation activatrice de PI3K lui-même. La production incontrôlée de PIP3 est l'un des effecteurs les plus importants de la voie PI3K/AKT avec mTOR stimulant la synthèse des protéines qui régulent l'apoptose. L'expression immunohistochimique de la protéine PTEN est considérée comme un bon moyen d'évaluer l'état fonctionnel du gène.

1. L'historique complet et l'examen physique des patients et tous les détails seront enregistrés dans le formulaire prédéfini. Toutes les investigations de routine indiquées, y compris une biopsie pour établir un diagnostic et un scanner/IRM/MRCP de l'abdomen pour mesurer les dimensions de la tumeur et le stade de la maladie avant le début du traitement, seront enregistrées.
2. Le tissu d'archives sera étudié pour l'expression de la mutation génique par analyse moléculaire à l'aide du séquençage de nouvelle génération. Les patients traités entre 2017 et 2020 pour lesquels des informations NGS sont disponibles seront également inclus rétrospectivement. Leurs données seront extraites des dossiers médicaux et des tentatives seront faites pour les contacter pour un suivi.