NGS i galdeblærekræft og respons på behandling

Galdeblærekarcinom (GBC) er den mest almindelige type galdevejscarcinom og den tredje hyppigste malignitet i fordøjelseskanalen i Indien. GBC opstår i forbindelse med kronisk inflammation, og den mest almindelige kilde er kolesterolgaldesten (hos mere end 75 % af patienterne). Andre årsager til kronisk betændelse omfatter primær skleroserende cholangitis, ulcerøs colitis, leverskader, kroniske Salmonella typhi og paratyphi-infektioner og Helicobacter-infektion. Mange andre faktorer er også blevet identificeret såsom indtagelse af visse kemikalier, eksponeringer gennem vandforurening, tungmetaller og strålingseksponering. Kun en lille del af GBC er forbundet med arvelige syndromer som Gardners syndrom, neurofibromatose type I og arvelig non-polypose tyktarmskræft.

Af de mange molekylære ændringer, der er observeret i GBC, har det endnu ikke været muligt at udpege, hvilke der er "driver"-gener eller kontroller af den neoplastiske proces og at differentiere dem fra "passager"-gener, dem, der hovedsageligt observeres i sporadiske maligne tumorer som f.eks. GBC, hvor epigenetiske ændringer dominerer. De hyppigst muterede gener i GBC er: TP53 (41%), CDKN2A (28%) KRAS (19%), TERT (8%), CTNNB1 (8%) og PI3K (7%). ERBB-familiens signalvej er en af ​​de hyppigst muterede i GBC. Disse receptorer deltager i regulering af celleproliferation, differentiering og overlevelse. Deres amplifikation oversættes hovedsageligt til proteinoverekspression. Receptoren HER2/NEU aktiverer efter dimerisering en lang række downstream-veje såsom RAS-RAF-MEK-ERK1/2 eller PI3k-AKT-MTOR med stor indflydelse på celleproliferation. På den anden side er PTEN (phosphatase og tensin homolog) et tumorsuppressorgen, der koder for et protein med fosfatasefunktion, der inaktiverer substrater som PI3K. Fraværet af det PTEN funktionelle protein tillader aktivering af PI3k med en endnu større intensitet end den aktiverende mutation af selve PI3K. Den ukontrollerede produktion af PIP3 er en af ​​de vigtigste effektorer af PI3K/AKT-vejen med mTOR-stimulerende proteinsyntese, der regulerer apoptose. Den immunhistokemiske ekspression af PTEN-proteinet anses for at være en god måde at evaluere genets funktionelle tilstand.

1. Omfattende historie og fysisk undersøgelse af patienterne og alle detaljer vil blive registreret i den forudindstillede proforma. Alle rutineundersøgelser som angivet, herunder en biopsi for at etablere en diagnose og CT/MRI/MRCP af abdomen for at måle tumordimensionerne og iscenesætte sygdommen før påbegyndelse af behandling, vil blive registreret.
2. Arkivvævet vil blive undersøgt for ekspression af genmutation ved molekylær analyse ved brug af Next Generation Sequencing. Patienter behandlet mellem 2017-2020, hvor NGS-information er tilgængelig, vil også blive inddraget i retrospekt. Deres data vil blive udtrukket fra lægejournalerne, og det vil blive forsøgt at kontakte dem med henblik på opfølgning.