NGS i gallblåscancer och svar på behandling

Gallblåsecancer (GBC) är den vanligaste typen av gallvägskarcinom och den tredje vanligaste maligniteten i mag-tarmkanalen i Indien. GBC uppstår i samband med kronisk inflammation och den vanligaste källan är kolesterolgallsten (hos mer än 75 % av patienterna). Andra orsaker till kronisk inflammation inkluderar primär skleroserande kolangit, ulcerös kolit, leversvallar, kroniska Salmonella typhi och paratyphi-infektioner och Helicobacter-infektion. Många andra faktorer har också identifierats såsom intag av vissa kemikalier, exponeringar genom vattenföroreningar, tungmetaller och strålningsexponering. Endast en liten del av GBC är associerade med ärftliga syndrom som Gardners syndrom, neurofibromatos typ I och ärftlig icke-polypos tjocktarmscancer.

Av de multipla molekylära förändringarna som observerats i GBC har det ännu inte varit möjligt att fastställa vilka som är "drivar"-gener eller kontroller av den neoplastiska processen och att skilja dem från "passagerar"-gener, de som observeras främst i sporadiska maligna tumörer som t.ex. GBC där epigenetiska förändringar dominerar. De mest frekvent muterade generna i GBC är: TP53 (41%), CDKN2A (28%) KRAS (19%), TERT (8%), CTNNB1 (8%) och PI3K (7%). ERBB-familjens signalväg är en av de mest muterade i GBC. Dessa receptorer deltar i reglering av cellproliferation, differentiering och överlevnad. Deras amplifiering översätts huvudsakligen till proteinöveruttryck. Receptorn HER2/NEU aktiverar efter dimerisering ett stort antal nedströmsvägar såsom RAS-RAF-MEK-ERK1/2 eller PI3k-AKT-MTOR med stor inverkan på cellproliferation. Å andra sidan är PTEN (fosfatas- och tensinhomolog) en tumörsuppressorgen som kodar för ett protein med fosfatasfunktion som inaktiverar substrat som PI3K. Frånvaron av det funktionella PTEN-proteinet tillåter aktivering av PI3k med en ännu större intensitet än den aktiverande mutationen av PI3K själv. Den okontrollerade produktionen av PIP3 är en av de viktigaste effektorerna av PI3K/AKT-vägen med mTOR-stimulerande proteinsyntes som reglerar apoptos. Det immunhistokemiska uttrycket av PTEN-proteinet anses vara ett bra sätt att utvärdera genens funktionella tillstånd.

1. Omfattande historia och fysisk undersökning av patienterna och alla detaljer kommer att registreras i den förinställda proforma. Alla indikerade rutinundersökningar inklusive en biopsi för att fastställa en diagnos och CT/MRI/MRCP av buken för att mäta tumördimensionerna och stadiera sjukdomen innan behandlingen påbörjas kommer att registreras.
2. Arkivvävnaden kommer att studeras för uttryck av genmutation genom molekylär analys med hjälp av Next Generation Sequencing. Patienter som behandlas mellan 2017-2020 där NGS-information finns kommer också att inkluderas i efterhand. Deras uppgifter kommer att extraheras från journalerna och försök kommer att göras att kontakta dem för uppföljning.