Vastasyntyneiden sekvensointiseulonta Kiinassa
Kohdistetun sekvensoinnin soveltaminen vastasyntyneiden sairauksien seulonnassa
Tutkimuksen yleiskatsaus
Yksityiskohtainen kuvaus
Vastasyntyneiden seulonta (NBS) on viimeinen vaihe synnynnäisten epämuodostumien ehkäisyssä. Tällä hetkellä NBS:ssä käytetään yleisesti biokemiallista ja massaspektrometriaa, mutta sairauksia on rajoitetusti ja tiettyjä vääriä positiivisia/negatiivisia. High-throughput-sekvensointia (NGS) on käytetty laajalti synnytystä edeltävässä diagnoosissa, kasvaimeen kohdistettujen biomarkkerien havaitsemisessa ja patogeenien havaitsemisessa. Vaikka NGS:n soveltamisella uusissa seulonnassa on laajat näkymät ja monet maat ympäri maailmaa ovat alkaneet tutkia sitä, seulontasairauksien, geenikliinisen fenotyyppien, geneettisen neuvonnan ja kliinisen polun valinnassa on edelleen haasteita.
Vuodesta 2019 lähtien tiimimme alkoi tutkia NGS-teknologioiden soveltamista tertiääriehkäisyn kliinisessä sovellutuksessa yhdistettynä Clinva-, HGMD-, OMIM-tietokantaan perustuen tiettyjen tautia aiheuttavien geenien ja mutaatiokohtien seulomiseen kohteena, A NGS-paneeli for Newborns in China (NeoExome), joka kattaa 542 yhden geenin sairautta ja 601 geeniä. NGS-paneelin rationaalisuus ja pätevyys varmistettiin alustavasti 3423 vastasyntyneen verinäytteessä, jotka kerättiin viidestä uudesta seulontakeskuksesta Kiinassa.
Jotta voidaan edelleen optimoida vastasyntyneiden sairauksien geeniseulontaspektriä Kiinan väestössä, arvioida kohdistetun sekvensointitekniikan tehokkuutta vastasyntyneiden sairauksien seulonnassa ja diagnosoinnissa, standardoida kliininen reitti ja luoda perusta Kiinan uuden seulonta-NGS:n muotoilulle. ohjeiden mukaisesti tutkijat optimoivat edelleen kohdennettua sekvensointipakettia (NeoexOME-V2) ensimmäisen vaiheen perusteella. 491 geeniä, jotka kattavat 485 yhden geenin geneettistä sairautta, suunniteltiin käynnistämään "Budding Action". Hankkeessa on tarkoitus kerätä 10 000 näytettä valtakunnallisesti ja toteuttaa monikeskuksen kliininen tutkimus kohdistetun sekvensointiteknologian soveltamisesta vastasyntyneiden sairauksien seulonnassa.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Todellinen)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskelupaikat
-
-
-
Shanghai, Kiina, 200062
- Shanghai Children's Hospital
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- -- Koehenkilöt: kaikki vastasyntyneet (syntymästä 28 päivään);
- -- Kun huoltaja on ymmärtänyt ohjelman täysin, hän allekirjoittaa tietoisen suostumuksen ja suostuu osallistumaan ohjelmaan.
Poissulkemiskriteerit:
- Muita vastaavia kliinisiä tutkimusprojekteja on meneillään tutkituille vastasyntyneille;
- Vastasyntyneet ovat saaneet allogeenisten verituotteiden verensiirron;
- Vastasyntyneet, joiden huoltajat nimenomaisesti kieltäytyvät osallistumasta ohjelmaan lähetystyön saatuaan.
Eliminointikriteerit
- Näytteet, joita ei ole kerätty tai säilytetty asianmukaisesti testausta varten;
- Näytteet, joissa on epätyypillisiä tietueita;
- Näytteet ilman kliinisiä seurantatuloksia;
- Hanke kutsuu takaisin vastasyntyneet, jotka huoltajansa edellyttävät vetäytymistä seurannan aikana.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Kansallinen monikeskusseulonta
NGS suoritettiin tavanomaiseen NBS:ään perustuen.
NGS:n havaitun geenivariaation ja taudin esiintymisen välistä suhdetta tutkittiin seurannan avulla.
|
Nation-monikeskusseulontakohortissa NGS-testaus suoritettiin tavanomaisen NBS:n perusteella geenivariaation ja sairauden esiintymisen välisen suhteen tutkimiseksi;
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Outcome measure
Aikaikkuna: From enrollment to the end of test at 3 years
|
Kappa coefficient to evaluate the agreement strength.
Positive Percent Agreement (PPA) and Negative Percent Agreement (NPA) calculated based on the 2x2 contingency table (True Positive, False Positive, False Negative, True Negative).
|
From enrollment to the end of test at 3 years
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
The consistency of test results of NGS and conventional NBS
Aikaikkuna: From enrollment to the end of testt at 8 weeks
|
Conventional NBS was used as the standard to study the application potential of targeted sequencing technology in neonatal screening and evaluate its consistency: ① Genetic variations in children with positive results from routine NBS screening: Genetic variation rate, genetic variations found in specific genes, population distribution characteristics, etc.; ② Application of gene sequencing technology in the diagnosis of diseases in infants and young children with positive results from routine newborn screening. 50% number of participants with consistency of test results. physiological parameter: Kappa coefficient to evaluate the agreement strength. Positive Percent Agreement (PPA) and Negative Percent Agreement (NPA) calculated based on the 2x2 contingency table (True Positive, False Positive, False Negative, True Negative). McNemar's test for discordant pairs analysis. |
From enrollment to the end of testt at 8 weeks
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Yhteistyökumppanit
Tutkijat
- Päätutkija: Lin Zou, Shanghai Children's Hospital
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Opintojen valmistuminen (Todellinen)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muut tutkimustunnusnumerot
- shercru-20220003
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .