Sequencing-screening bij pasgeborenen in China
De toepassing van gerichte sequencing bij de screening van neonatale ziekten
Studie Overzicht
Gedetailleerde beschrijving
Neonatale screening (NBS) is de laatste stap in de preventie van aangeboren afwijkingen. Momenteel worden biochemische en massaspectrometrie vaak gebruikt voor NBS, maar er zijn beperkte ziekten en bepaalde fout-positieven/negatieven. High-throughput sequencing (NGS) wordt veel gebruikt bij prenatale diagnose, tumorgerichte biomarkersdetectie en pathogeendetectie. Hoewel de toepassing van NGS in nieuwe screening een breed perspectief heeft en veel landen over de hele wereld zijn begonnen het te onderzoeken, zijn er nog steeds uitdagingen bij de selectie van screeningsziekten, genklinische fenotypes, genetische counseling en klinische paden.
Sinds 2019 is ons team begonnen met het onderzoeken van de toepassing van NGS-technologieën in de klinische toepassing van tertiaire preventie, gecombineerd met Clinva, HGMD, OMIM-database, op basis van screening van specifieke ziekteverwekkende genen en mutatieplaatsen als doelwit, een NGS-panel voor pasgeborenen in China (NeoExome) is ontworpen en omvat 542 ziekten met één gen met 601 genen. De rationaliteit en validiteit van het NGS-panel werd voorlopig geverifieerd in 3423 neonatale bloedmonsters die waren verzameld bij 5 nieuwe screeningcentra in China.
Om het genscreeningsspectrum van neonatale ziekten in de Chinese bevolking verder te optimaliseren, de doeltreffendheid van gerichte sequencingtechnologie bij de screening en diagnose van neonatale ziekten te evalueren, het klinische pad te standaardiseren en een basis te leggen voor de formulering van China's nieuwe screening NGS richtlijnen hebben de onderzoekers op basis van de eerste fase het target sequencing pakket (NeoexOME-V2) verder geoptimaliseerd. 491 genen die 485 genetische ziekten met één gen dekken, werden ontworpen om de "Budding Action" te lanceren. Het project is van plan om landelijk 10.000 monsters te verzamelen en het multicenter klinische onderzoek uit te voeren naar de toepassing van gerichte sequencingtechnologie bij de screening van neonatale ziekten.
Studietype
Inschrijving (Werkelijk)
Contacten en locaties
Studie Locaties
-
-
-
Shanghai, China, 200062
- Shanghai Children's Hospital
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
Accepteert gezonde vrijwilligers
Bemonsteringsmethode
Studie Bevolking
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- -- Proefpersonen: alle pasgeborenen (vanaf de geboorte tot 28 dagen);
- -- Nadat hij het programma volledig heeft begrepen, ondertekent de voogd de geïnformeerde toestemming en stemt ermee in om deel te nemen aan het programma.
Uitsluitingscriteria:
- Andere soortgelijke klinische onderzoeksprojecten zijn aan de gang voor de onderzochte neonaten;
- Neonaten hebben een transfusie van allogene bloedproducten gekregen;
- Pasgeborenen van wie de voogd uitdrukkelijk weigert deel te nemen aan het programma na ontvangst van de missie.
Eliminatie criteria
- Monsters die niet correct zijn verzameld of opgeslagen voor testen;
- Monsters met niet-standaard datarecords;
- Monsters zonder klinische follow-up resultaten;
- Het project roept pasgeborenen terug die tijdens de follow-up door hun voogden moeten worden teruggetrokken.
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
Nationale multicenter screening
NGS werd uitgevoerd op basis van conventionele NBS.
De relatie tussen door NGS gedetecteerde genvariatie en het optreden van de ziekte werd bestudeerd door middel van follow-up.
|
In het Nation multicenter screeningcohort werden NGS-testen uitgevoerd op basis van conventionele NBS om de relatie tussen genvariatie en het optreden van ziekten te bestuderen;
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Outcome measure
Tijdsspanne: From enrollment to the end of test at 3 years
|
Kappa coefficient to evaluate the agreement strength.
Positive Percent Agreement (PPA) and Negative Percent Agreement (NPA) calculated based on the 2x2 contingency table (True Positive, False Positive, False Negative, True Negative).
|
From enrollment to the end of test at 3 years
|
Secundaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
The consistency of test results of NGS and conventional NBS
Tijdsspanne: From enrollment to the end of testt at 8 weeks
|
Conventional NBS was used as the standard to study the application potential of targeted sequencing technology in neonatal screening and evaluate its consistency: ① Genetic variations in children with positive results from routine NBS screening: Genetic variation rate, genetic variations found in specific genes, population distribution characteristics, etc.; ② Application of gene sequencing technology in the diagnosis of diseases in infants and young children with positive results from routine newborn screening. 50% number of participants with consistency of test results. physiological parameter: Kappa coefficient to evaluate the agreement strength. Positive Percent Agreement (PPA) and Negative Percent Agreement (NPA) calculated based on the 2x2 contingency table (True Positive, False Positive, False Negative, True Negative). McNemar's test for discordant pairs analysis. |
From enrollment to the end of testt at 8 weeks
|
Medewerkers en onderzoekers
Sponsor
Medewerkers
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Lin Zou, Shanghai Children's Hospital
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
Primaire voltooiing (Werkelijk)
Studie voltooiing (Werkelijk)
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Werkelijk)
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Andere studie-ID-nummers
- shercru-20220003
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .