Tämä sivu käännettiin automaattisesti, eikä käännösten tarkkuutta voida taata. Katso englanninkielinen versio lähdetekstiä varten.

Toiminnalliset testit ratkaisemattomien harvinaisten sairauksien ratkaisemiseksi. Harvinaisia. (RID)

tiistai 20. helmikuuta 2024 päivittänyt: University Hospital, Bordeaux

Ratkaisemattomien harvinaisten sairauksien ratkaiseminen: toiminnalliset testit ja uusi diagnoosistrategia korkean suorituskyvyn sekvensoinnin (RID) geneettisten muunnelmien tutkimiseksi

Harvinaiset sairaudet ovat heterogeeninen ryhmä sairauksia, jotka tarvitsevat tärkeitä työkaluja diagnoosiin.

Korkean suorituskyvyn sekvensoinnin avulla voidaan diagnosoida puolet potilaista. Toisaalta on mahdotonta tehdä johtopäätöksiä tuntemattoman merkityksen varianttien (VOUS) vuoksi. Funktionaalista analyysiä tarvitaan vahvan argumentin saamiseksi muunnelmien luokittelemiseksi uudelleen patogeenisiksi tai hyvänlaatuisiksi. Päätavoitteena on arvioida tämän strategian diagnoosituottoa.

Tutkimuksen yleiskatsaus

Tila

Rekrytointi

Ehdot

Interventio / Hoito

Yksityiskohtainen kuvaus

Päätavoitteena on harvinaisten geneettisten sairauksien diagnosoinnin parantaminen. Tutkijalaboratorio on asiantuntija joidenkin harvinaisten sairauksien, kuten hermoston kehityshäiriön, albinismin, kystisen fibroosin ja synnynnäisten sydänvikojen diagnosoinnissa. Itse asiassa suuren suorituskyvyn sekvensoinnin avulla diagnoosia varten löydetään suuri määrä geneettisiä muunnelmia ja ne on tulkittava. ACMG-luokitusta käytetään muunnelmien luokitteluun muunnelmien esiintymistiheyden, ennustetun vaikutuksen proteiiniin ja in-silico-ennusteen perusteella. Toiminnalliset todisteet ovat vahva argumentti VOUSin luokittelussa. Tutkijat ehdottavat RNA-Seq-, minigeeni- ja lusiferaasimäärityksen käyttöä VOUS-tutkimuksessa perustellakseen niiden luokittelua hyvänlaatuisiksi tai patogeenisiksi.

Opintotyyppi

Interventio

Ilmoittautuminen (Arvioitu)

50

Vaihe

  • Ei sovellettavissa

Yhteystiedot ja paikat

Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.

Opiskeluyhteys

Tutki yhteystietojen varmuuskopiointi

Opiskelupaikat

Osallistumiskriteerit

Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.

Kelpoisuusvaatimukset

Opintokelpoiset iät

  • Lapsi
  • Aikuinen
  • Vanhempi Aikuinen

Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia

Ei

Kuvaus

Sisällyttämiskriteerit:

  • Alaikäinen ja täysi-ikäinen potilas.
  • Rekisteröity sosiaaliturvajärjestelmään.
  • Potilaan tai alaikäisen potilaan vanhemman allekirjoittama tietoinen suostumus.
  • Potilas, jolla on jokin tutkituista harvinaisista sairauksista (albinismi, synnynnäinen sydänvika, kystinen fibroosi, hermoston kehityssairaus)
  • Potilaslaakerimuunnelmat, joiden merkitys on tuntematon (VOUS)

Poissulkemiskriteerit:

  • Kieltäytyminen osallistumasta tutkimuspöytäkirjaan.
  • Potilas hallinnollisen valvonnan alaisena
  • Raskaana olevat tai imettävät naiset

Opintosuunnitelma

Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.

Miten tutkimus on suunniteltu?

Suunnittelun yksityiskohdat

  • Ensisijainen käyttötarkoitus: Diagnostiikka
  • Jako: Ei käytössä
  • Inventiomalli: Yksittäinen ryhmätehtävä
  • Naamiointi: Ei mitään (avoin tarra)

Aseet ja interventiot

Osallistujaryhmä / Arm
Interventio / Hoito
Muut: Ex vivo ja in vitro -lähestymistapa

Ex vivo -lähestymistapa koski 25 potilasta, joilla oli verinäyte PAXgene-putkissa tai ihobiopsia ja RNA-Seq-analyysi.

In vitro -lähestymistapa, joka koskee 25 potilasta, joilla ei tarvita erityisiä näytteitä minigeeni- tai lusiferaasimäärityksen analysointiin
Geneettinen: Ex vivo -lähestymistapa koski 25 potilasta
Ex vivo -lähestymistapa koski 25 potilasta, joilla oli verinäyte PAXgene-putkissa tai ihobiopsia ja RNA-Seq-analyysi
Geneettinen: In vitro -lähestymistapa koski 25 potilasta
In vitro -lähestymistapa, joka koskee 25 potilasta, joilla ei tarvita erityisiä näytteitä minigeeni- tai lusiferaasimäärityksen analysointiin

Mitä tutkimuksessa mitataan?

Ensisijaiset tulostoimenpiteet

Tulosmittaus
Toimenpiteen kuvaus
Aikaikkuna
Patogeeniseksi (luokka 5) tai hyvänlaatuiseksi (luokka 1) uudelleen luokiteltujen VOUS-solujen osuus
Aikaikkuna: Inkluusiokäynti
Se on se osuus VOUS:sta, joka voidaan lopullisesti luokitella patogeeniseksi (luokka 5) tai hyvänlaatuiseksi (luokka 1) ACMG-luokituksen mukaan (Richards et al., 2015 ja liite 1). Itse asiassa tällä hetkellä vain patogeenisiksi tai todennäköisesti patogeenisiksi katsotut variantit mahdollistavat diagnoosin vahvistamisen ja geneettisen geneettisen neuvonnan tarjoamisen perheille ja synnytystä edeltävän diagnoosin suorittamisen. Tämä on arviointi, joka suoritetaan suoritettujen analyysien lopussa
Inkluusiokäynti

Toissijaiset tulostoimenpiteet

Tulosmittaus
Toimenpiteen kuvaus
Aikaikkuna
Esianalyysiprosessi : Näytteen kuljetusaika laboratorioon
Aikaikkuna: Inkluusiokäynti
Kuljetusaika laboratorioon. Tämän ajan laskemiseksi kirjataan keräysaika ja vastaanottoaika molekyyligenetiikan teknikon toimesta ja vastaanottoaika.
Inkluusiokäynti
Esianalyysiprosessi: RNA:n uuton laatu (RNA Integrity Number, RIN)
Aikaikkuna: Inkluusiokäynti
RNA-laadun mittaus RIN:llä (RNA-eheysluku): erittäin hyvä >7, hyvä >/=5, huono <5. Vain RNA, jonka RIN on >5, säilyy.
Inkluusiokäynti
Käytännöllisyys: Prosessorin ominaisuudet ja lukumäärä (keskusyksikkö)
Aikaikkuna: Inkluusiokäynti
Bioinformaattisten resurssien arviointi tarvittavan CPU:n määrän ja tietojen käsittelyn läpimenoajan mukaan
Inkluusiokäynti
Käytännöllisyys: Biologien koulutusaika tulkintaan
Aikaikkuna: Inkluusiokäynti
Tietojen tulkitsemiseen tarvittavan harjoitusajan arviointi
Inkluusiokäynti
Globaalit kustannukset
Aikaikkuna: Inkluusiokäynti
Globaalianalyysin ja kunkin testin kustannusarvio
Inkluusiokäynti

Yhteistyökumppanit ja tutkijat

Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.

Sponsori

University Hospital, Bordeaux

Tutkijat

  • Päätutkija: Vincent MICHAUD, University Hospital, Bordeaux

Opintojen ennätyspäivät

Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan ​​julkisella verkkosivustolla.

Opi tärkeimmät päivämäärät

Opiskelun aloitus (Todellinen)

Maanantai 30. tammikuuta 2023

Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)

Lauantai 1. helmikuuta 2025

Opintojen valmistuminen (Arvioitu)

Lauantai 1. helmikuuta 2025

Opintoihin ilmoittautumispäivät

Ensimmäinen lähetetty

Keskiviikko 7. joulukuuta 2022

Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit

Maanantai 23. tammikuuta 2023

Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)

Keskiviikko 25. tammikuuta 2023

Tutkimustietojen päivitykset

Viimeisin päivitys julkaistu (Arvioitu)

Keskiviikko 21. helmikuuta 2024

Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit

Tiistai 20. helmikuuta 2024

Viimeksi vahvistettu

Torstai 1. helmikuuta 2024

Lisää tietoa

Tähän tutkimukseen liittyvät termit

Avainsanat

Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja

Muut tutkimustunnusnumerot

  • CHU BX 2021/40

Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)

Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?

EI

Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat

Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta

Ei

Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta

Ei

Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .

Tilaa