Deze pagina is automatisch vertaald en de nauwkeurigheid van de vertaling kan niet worden gegarandeerd. Raadpleeg de Engelse versie voor een brontekst.

Functionele tests om onopgeloste zeldzame ziekten op te lossen. Zeldzamen. (RID)

20 februari 2024 bijgewerkt door: University Hospital, Bordeaux

Oplossen van onopgeloste zeldzame ziekten: functionele tests en nieuwe diagnosestrategie om genetische varianten van High-throughput Sequencing (RID) te bestuderen

Zeldzame ziekten zijn een heterogene groep aandoeningen die belangrijke hulpmiddelen voor diagnose nodig hebben.

Het gebruik van high-throughput sequencing kan de helft van de patiënten diagnosticeren. Voor het andere deel is het onmogelijk om conclusies te trekken vanwege de aanwezigheid van varianten van onbekende betekenis (VOUS). Functionele analyse is nodig om sterke argumenten aan te voeren om varianten opnieuw te classificeren als pathogeen of goedaardig. Het belangrijkste doel is om het diagnoserendement van deze strategie te evalueren.

Studie Overzicht

Toestand

Werving

Conditie

Interventie / Behandeling

Gedetailleerde beschrijving

Het hoofddoel is de verbetering van de diagnose van zeldzame genetische ziekten. Het onderzoekslaboratorium is expert voor de diagnose van enkele zeldzame ziekten zoals neurologische ontwikkelingsstoornissen, albinisme, cystische fibrose en aangeboren hartafwijkingen. Met de implementatie van high-throughput sequencing voor diagnose wordt een groot aantal genetische varianten gevonden en moet deze worden geïnterpreteerd. De ACMG-classificatie wordt gebruikt om varianten te classificeren met argument van variantfrequentie, voorspeld effect op eiwit en in-silico-voorspelling. Functioneel bewijs is een sterk argument om VOUS te helpen classificeren. De onderzoekers stellen het gebruik van RNA-Seq, minigene en luciferase-assay voor voor studie van VOUS voor om argumenten aan te voeren om ze als goedaardig of pathogeen te classificeren.

Studietype

Ingrijpend

Inschrijving (Geschat)

50

Fase

  • Niet toepasbaar

Contacten en locaties

In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.

Studiecontact

Studie Contact Back-up

Studie Locaties

Deelname Criteria

Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.

Geschiktheidscriteria

Leeftijden die in aanmerking komen voor studie

  • Kind
  • Volwassen
  • Oudere volwassene

Accepteert gezonde vrijwilligers

Nee

Beschrijving

Inclusiecriteria:

  • Minderjarige en volwassen patiënt.
  • Geregistreerd voor de sociale zekerheid.
  • Geïnformeerde toestemming ondertekend door patiënt of ouder van een minderjarige patiënt.
  • Patiënt getroffen door een van de zeldzame ziekten die zijn bestudeerd (albinisme, aangeboren hartafwijking, cystische fibrose, neurologische ontwikkelingsziekte)
  • Patiëntdragende varianten van onbekende betekenis (VOUS)

Uitsluitingscriteria:

  • Weigering om deel te nemen aan onderzoeksprotocol.
  • Patiënt onder administratief toezicht
  • Zwangere of zogende vrouwen

Studie plan

Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.

Hoe is de studie opgezet?

Ontwerpdetails

  • Primair doel: Diagnostisch
  • Toewijzing: NVT
  • Interventioneel model: Opdracht voor een enkele groep
  • Masker: Geen (open label)

Wapens en interventies

Deelnemersgroep / Arm
Interventie / Behandeling
Ander: Ex-vivo en in-vitro benadering

Ex-vivo benadering van 25 patiënten met bloedmonster in PAXgene-buisjes of huidbiopsie en RNA-Seq-analyse.

In-vitro-benadering bij 25 patiënten zonder specifieke monsters die nodig zijn voor analyse in minigen- of luciferase-assay
Genetisch: Ex-vivo benadering van 25 patiënten
Ex-vivo benadering van 25 patiënten met bloedmonster in PAXgene-buisjes of huidbiopsie en RNA-Seq-analyse
Genetisch: In vitro benadering bij 25 patiënten
In-vitro-benadering bij 25 patiënten zonder specifieke monsters die nodig zijn voor analyse in minigen- of luciferase-assay

Wat meet het onderzoek?

Primaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
Percentage van VOUS opnieuw geclassificeerd als pathogeen (klasse 5) of goedaardig (klasse 1)
Tijdsspanne: Inclusie bezoek
Het is het deel van de VOUS dat definitief opnieuw kan worden geclassificeerd als pathogeen (klasse 5) of goedaardig (klasse 1) volgens de ACMG-classificatie (Richards et al., 2015 en bijlage 1). Momenteel maken alleen varianten die als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen worden beschouwd, het mogelijk om een ​​diagnose te bevestigen en genetische counseling voor te stellen aan families en een prenatale diagnose te stellen. Dit is een evaluatie die zal worden uitgevoerd aan het einde van de uitgevoerde analyses
Inclusie bezoek

Secundaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
Pre-analyseproces: Tijdstip van monstertransport naar het laboratorium
Tijdsspanne: Inclusie bezoek
Tijdstip van vervoer naar het laboratorium. Om deze tijd te berekenen wordt het tijdstip van afhalen en het tijdstip van ontvangst door de en het tijdstip van ontvangst door de technicus moleculaire genetica geregistreerd
Inclusie bezoek
Pre-analyseproces: Kwaliteit van RNA-extractie (RNA Integrity Number, RIN)
Tijdsspanne: Inclusie bezoek
RNA-kwaliteitsmeting door RIN (RNA Integrity Number): zeer goed >7, goed >/=5, slecht <5. Alleen RNA met RIN >5 wordt behouden.
Inclusie bezoek
Uitvoerbaarheid: kenmerken en aantal CPU's (Central Processing Unit)
Tijdsspanne: Inclusie bezoek
Evaluatie van bio-informaticabronnen op basis van het aantal benodigde CPU's en de doorlooptijd voor het verwerken van gegevens
Inclusie bezoek
Uitvoerbaarheid: opleidingstijd van biologen voor interpretatie
Tijdsspanne: Inclusie bezoek
Evaluatie van de trainingstijd die nodig is om de gegevens te interpreteren
Inclusie bezoek
Wereldwijde kosten
Tijdsspanne: Inclusie bezoek
Evaluatie van de kosten van globale analyse en elke test
Inclusie bezoek

Medewerkers en onderzoekers

Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.

Sponsor

University Hospital, Bordeaux

Onderzoekers

  • Hoofdonderzoeker: Vincent MICHAUD, University Hospital, Bordeaux

Studie record data

Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.

Bestudeer belangrijke data

Studie start (Werkelijk)

30 januari 2023

Primaire voltooiing (Geschat)

1 februari 2025

Studie voltooiing (Geschat)

1 februari 2025

Studieregistratiedata

Eerst ingediend

7 december 2022

Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria

23 januari 2023

Eerst geplaatst (Werkelijk)

25 januari 2023

Updates van studierecords

Laatste update geplaatst (Geschat)

21 februari 2024

Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria

20 februari 2024

Laatst geverifieerd

1 februari 2024

Meer informatie

Termen gerelateerd aan deze studie

Trefwoorden

Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden

Andere studie-ID-nummers

  • CHU BX 2021/40

Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)

Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?

NEE

Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel

Nee

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct

Nee

Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .

Zoek naar vergelijkbare onderzoeken

Sponsors en medewerkers

Medische omstandigheden

Geneesmiddelinterventies

CROs by country

CROs in Jordan

Voorwaarden

Zeldzame ziekten

Geneesmiddelinterventies

Voedingssupplementen

Sponsor / medewerkers

Locaties

3
Abonneren