Cobas® Eplex -veriviljelypaneelien kliininen vaikutus bakteremian ja fungemian diagnosointiin

Verenkierron infektiot (BSI) aiheuttavat huomattavan taakan potilaille ja terveydenhuoltojärjestelmille sairaalahoitoon, pidempiaikaisten oleskelujen, lisädiagnostisten testien ja erityisten hoitojen vuoksi. Sopimattoman empiirisen antibioottihoidon saaminen voi lisätä munuais- ja maksatoksisuuden, antibioottiresistenssin, opportunististen infektioiden ja kuolleisuuden riskiä. Siksi taudinaiheuttajien ja niiden vastustuskykymallien varhainen tunnistaminen on äärimmäisen tärkeää.

Kultastandardi BSI:n diagnosoinnissa on veriviljely. Bakteremian tai fungemian havaitsemiseksi potilailta kerätään verta ja inkuboidaan veriviljelypulloissa. Perinteisiä viljelymenetelmiä käytettäessä positiivinen veripullo tutkitaan käyttämällä suoraa mikroskooppista tutkimusta, gramvärjäystä, selektiivisten ja ei-selektiivisten agarien siirrostusta, MALDI-TOF-tunnistusta, nopeaa antimikrobinen herkkyystestiä (AST) ja standardoituja AST-menetelmiä. Nämä menetelmät vaativat useita (manuaalisia) vaiheita ja päivien läpimenoaikaa. Veriviljelmän keräämisen jälkeen tulokseen kuluva aika riippuu useista tekijöistä, kuten veripullojen kuljetukseen ja inkubaattoriin lataamiseen tarvittavasta ajasta, bakteerien tai sienten kasvunopeudesta sekä tunnistuksen ja AST-tuloksen saamiseen kuluvasta ajasta. .

Nopeita diagnostisia testejä on kehitetty lyhentämään sopivaan mikrobihoitoon kuluvaa aikaa. Useimmat testit sisältävät organismin tunnistamisen ja genotyyppisen resistenssiprofiilin. Nopeat molekyylidiagnostiset testaukset, kuten multipleksiset PCR-menetelmät, mahdollistavat bakteerien tai sienten ja niiden mikrobiresistenssigeenien varhaisen tunnistamisen (tulokset alle 2 tunnin sisällä testin aloittamisesta). Tämä auttaa minimoimaan tehokkaan antimikrobisen hoidon aloittamiseen tarvittavan ajan. Kaupallisia diagnostisia järjestelmiä on kehitetty nopeuttamaan BSI:ssä aiheuttavien patogeenien antibioottiresistenssigeenien tunnistamista ja havaitsemista. Esimerkkejä ovat Cepheid® GeneXpert, BioFire® FilmArray®TM ja Roche eplex®. Tässä tutkimuksessa käytetty järjestelmä, eplex-järjestelmä, on hajasaanti-multipleksi-PCR-alusta, jossa yhdistyvät nukleiinihappojen uutto ja nopea RT-PCR. Tautia aiheuttavien organismien tunnistamiseen käytetään kolmea Blood Culture Identification (BCID) -paneelia: grampositiivinen paneeli, gramnegatiivinen paneeli ja sienipatogeenipaneeli. Nämä paneelit on suunniteltu havaitsemaan 56 eri organismia, jotka kattavat 95 % BSI:iin yleisesti liittyvistä patogeeneista ja 10 yleistä antibioottiresistenssigeeniä.

Tämän tutkimuksen tavoitteena on arvioida positiivisten veriviljelmien nopean molekyylitestauksen vaikutus cobas® eplex -järjestelmällä (Roche) antibioottihoitoon ja potilaan tuloksiin.

Tässä tutkimuksessa arvioimme eplex-järjestelmän suorituskykyä patogeenien tunnistamisessa ja resistenssimarkkerien havaitsemisessa verrattuna rutiininomaiseen verenkiertoinfektioiden SOC-järjestelmään. Eplexin mahdollinen vaikutus antimikrobisen hoidon optimointiin (aloitus, lopettaminen, eskalointi tai eskaloinnin vähentäminen) kuluvaan aikaan ja potilaan lopputulokseen arvioidaan.

Yhteenvetona voidaan todeta, että tässä tutkimuksessa arvioidaan CE-IVD-rekisteröityjen verenkierron infektioiden oireyhtymädiagnostiikan käyttöönoton mahdollisia etuja.