A Cobas® Eplex vértenyésztő panelek klinikai hatása a bakteriémia és fungemia diagnosztizálására

A véráramfertőzések (BSI) jelentős terhet rónak a betegekre és az egészségügyi rendszerekre a kórházi felvétel, a hosszabb tartózkodás, a további diagnosztikai vizsgálatok és a speciális kezelések szükségessége miatt. A nem megfelelő empirikus antibiotikum-terápia növelheti a vese- és májtoxicitás, az antibiotikum-rezisztencia, az opportunista fertőzések és a mortalitás kockázatát. Ezért rendkívül fontos a kórokozók korai azonosítása és rezisztencia mintázata.

A BSI-k diagnosztizálásának arany standardja a vérkultúrák. A bakteriémia vagy fungeemia kimutatására a betegek vérét összegyűjtik és vértenyésztő palackokban inkubálják. Hagyományos tenyésztési módszerek alkalmazásakor a pozitív vérpalackot közvetlen mikroszkópos vizsgálattal, gramfestéssel, szelektív és nem szelektív agarok beoltásával, MALDI-TOF azonosítással, gyors antimikrobiális érzékenységi vizsgálattal (AST) és standardizált AST módszerekkel vizsgálják. Ezek a módszerek több (kézi) lépést és napos átfutási időt igényelnek. A vérkultúra levételét követően az eredmény eléréséig eltelt idő számos tényezőtől függ, mint például a vérpalackok szállításához és az inkubátorba való betöltéshez szükséges idő, a baktériumok vagy gombák növekedési sebessége, valamint az azonosítás és az AST eredmény megszerzésének ideje. .

Gyors diagnosztikai teszteket fejlesztettek ki a megfelelő antimikrobiális terápiához szükséges idő javítására. A legtöbb teszt az organizmus azonosítását és a genotípus rezisztencia profilját foglalja magában. A gyors molekuláris diagnosztikai vizsgálatok, mint például a multiplex PCR-módszerek, lehetővé teszik a baktériumok vagy gombák és antimikrobiális rezisztencia génjeik korai azonosítását (az eredmények a vizsgálat megkezdése után kevesebb, mint 2 órán belül). Ez segít minimalizálni a hatékony antimikrobiális terápia megkezdéséhez szükséges időt. Kereskedelmi diagnosztikai rendszereket fejlesztettek ki a BSI-ben kiváltó kórokozók antibiotikum-rezisztencia génjeinek azonosításának és kimutatásának felgyorsítására. Ilyen például a Cepheid® GeneXpert, a BioFire® FilmArray®TM és a Roche eplex®. A tanulmányban használt rendszer, az eplex rendszer, egy véletlen hozzáférésű multiplex PCR-platform, amely egyesíti a nukleinsavak extrakcióját és a gyors RT-PCR-t. Három vérkultúra-azonosító (BCID) panelt használnak a betegséget okozó szervezetek azonosítására: Gram-pozitív panel, Gram-negatív panel és Gombás kórokozó panel. Ezeket a paneleket 56 különböző organizmus kimutatására tervezték, amelyek lefedik a BSI-kkel gyakran összefüggő kórokozók 95%-át és 10 általános antibiotikum-rezisztencia gént.

Ennek a tanulmánynak az a célja, hogy felmérje a cobas® eplex rendszerrel (Roche) végzett pozitív vértenyészetek gyors molekuláris tesztelésének hatását az antibiotikum-terápiára és a betegek kimenetelére.

Ebben a tanulmányban prospektíven értékeljük az eplex rendszer teljesítményét a kórokozók azonosítására és a rezisztenciamarkerek kimutatására, összehasonlítva a véráram-fertőzések rutinszerű SOC-jával. Értékelni kell az eplex potenciális hatását az antimikrobiális terápia optimalizálásához (kezdeményezés, leállítás, fokozás vagy deeszkaláció) eltelt időre és a beteg kimenetelére.

Összefoglalva: Végül ez a tanulmány értékeli a véráramfertőzések CE-IVD regisztrált szindróma diagnosztikai vizsgálatának lehetséges előnyeit.