Den kliniske effekt af Cobas® Eplex-blodkulturpaneler til diagnosticering af bakteriemi og svampemi

Blodbaneinfektioner (BSI'er) pålægger patienter og sundhedssystemer en betydelig byrde på grund af behovet for hospitalsindlæggelse, forlængede ophold, yderligere diagnostiske tests og specifikke behandlinger. Modtagelse af uhensigtsmæssig empirisk antibiotikabehandling kan øge risikoen for nyre- og levertoksicitet, antibiotikaresistens, opportunistiske infektioner og dødelighed. Derfor er tidlig identifikation af de forårsagende patogener og deres resistensmønstre af yderste vigtighed.

Guldstandarden for diagnosticering af BSI er gennem blodkulturer. For at påvise bakteriæmi eller svampemi opsamles blod fra patienter og inkuberes i blodkulturflasker. Ved anvendelse af konventionelle dyrkningsmetoder undersøges en positiv blodflaske ved hjælp af direkte mikroskopisk undersøgelse, gramfarvning, podning af selektive og ikke-selektive agarer, MALDI-TOF-identifikation, hurtig antimikrobiel følsomhedstest (AST) og standardiserede AST-metoder. Disse metoder kræver adskillige (manuelle) trin og dage med ekspeditionstid. Efter opsamling af en blodkultur afhænger tiden til resultatet af flere faktorer, såsom den tid, der er nødvendig for at transportere blodflaskerne og fylde i inkubatoren, væksthastigheden af ​​bakterier eller svampe samt tiden til at opnå identifikation og AST-resultatet .

Der er udviklet hurtige diagnostiske tests for at forbedre tiden til passende antimikrobiel behandling. De fleste test involverer organismeidentifikation og genotypiske resistensprofiler. Hurtig molekylær diagnostisk testning, såsom multipleks PCR-metoder, muliggør tidlig identifikation af bakterier eller svampe og deres antimikrobielle resistensgener (resultater inden for mindre end 2 timer efter påbegyndelse af testen). Dette hjælper med at minimere den tid, der er nødvendig for at påbegynde effektiv antimikrobiel behandling. Kommercielle diagnostiske systemer til at fremskynde identifikation og påvisning af antibiotikaresistensgener for forårsagende patogener i BSI er blevet udviklet. Eksempler omfatter Cepheid® GeneXpert, BioFire® FilmArray®TM og Roche eplex®. Systemet anvendt i denne undersøgelse, eplex-systemet, er en multipleks PCR-platform med tilfældig adgang, der kombinerer ekstraktion af nukleinsyrer og hurtig RT-PCR. Tre Blood Culture Identification (BCID) paneler bruges til at identificere de sygdomsfremkaldende organismer: Gram-positive panel, Gram-negative panel og Fungal Pathogen panel. Disse paneler er designet til at detektere 56 forskellige organismer, der dækker 95% af patogener, der almindeligvis er forbundet med BSI'er, og 10 almindelige antibiotikaresistensgener.

Formålet med denne undersøgelse er at vurdere virkningen af ​​hurtig molekylær testning på positive blodkulturer med cobas® eplex-systemet (Roche) på antibiotikabehandling og patientresultat.

I denne undersøgelse evaluerer vi prospektivt ydeevnen af ​​eplex-systemet til patogenidentifikation og påvisning af resistensmarkører sammenlignet med rutinemæssig SOC for blodbaneinfektioner. Den potentielle indvirkning af eplex på tid til optimering (initiering, seponering, eskalering eller deeskalering) af antimikrobiel behandling og patientresultat vil blive evalueret.

Sammenfattende vil denne undersøgelse endelig evaluere de potentielle fordele ved at implementere CE-IVD registreret syndromdiagnostisk test af blodbaneinfektioner.