Den kliniske effekten av Cobas® Eplex-blodkulturpaneler for diagnose av bakteriemi og soppmi

Blodstrømsinfeksjoner (BSI) påfører pasienter og helsevesen en betydelig belastning på grunn av behovet for sykehusinnleggelse, lengre opphold, ytterligere diagnostiske tester og spesifikke behandlinger. Å motta upassende empirisk antibiotikabehandling kan øke risikoen for nyre- og levertoksisitet, antibiotikaresistens, opportunistiske infeksjoner og dødelighet. Derfor er tidlig identifisering av de forårsakende patogenene og deres resistensmønstre av største betydning.

Gullstandarden for diagnose av BSI er gjennom blodkulturer. For å oppdage bakteriemi eller fungemi samles blod fra pasienter og inkuberes i blodkulturflasker. Ved bruk av konvensjonelle dyrkingsmetoder undersøkes en positiv blodflaske ved bruk av direkte mikroskopisk undersøkelse, gramfarging, inokulering av selektive og ikke-selektive agarer, MALDI-TOF-identifikasjon, rask antimikrobiell følsomhetstesting (AST) og standardiserte AST-metoder. Disse metodene krever flere (manuelle) trinn og dager med behandlingstid. Etter innsamling av en blodkultur avhenger tiden til resultatet av flere faktorer, som tiden det tar å transportere blodflaskene og laste i inkubatoren, veksthastigheten til bakterier eller sopp samt tiden det tar å få identifiseringen og AST-resultatet .

Det er utviklet raske diagnostiske tester for å forbedre tiden til passende antimikrobiell behandling. De fleste tester involverer organismeidentifikasjon og genotypiske resistensprofiler. Rask molekylær diagnostisk testing, som multiplekse PCR-metoder, muliggjør tidlig identifisering av bakterier eller sopp og deres antimikrobielle resistensgener (resultater innen mindre enn 2 timer etter initiering av testen). Dette bidrar til å minimere tiden som trengs for å starte effektiv antimikrobiell behandling. Kommersielle diagnostiske systemer for å akselerere identifisering og påvisning av antibiotikaresistensgener for forårsakende patogener i BSI er utviklet. Eksempler inkluderer Cepheid® GeneXpert, BioFire® FilmArray®TM og Roche eplex®. Systemet som brukes i denne studien, eplex-systemet, er en multipleks PCR-plattform med tilfeldig tilgang som kombinerer ekstraksjon av nukleinsyrer og rask RT-PCR. Tre Blood Culture Identification-paneler (BCID) brukes til å identifisere de sykdomsfremkallende organismene: Gram-positivt panel, Gram-negativt panel og Fungal Pathogen-panelet. Disse panelene er designet for å oppdage 56 forskjellige organismer som dekker 95 % av patogener som vanligvis er assosiert med BSI-er og 10 vanlige antibiotikaresistensgener.

Målet med denne studien er å vurdere effekten av rask molekylær testing på positive blodkulturer med cobas® eplex-systemet (Roche) på antibiotikabehandling og pasientresultat.

I denne studien evaluerer vi prospektivt ytelsen til eplex-systemet for patogenidentifikasjon og påvisning av resistensmarkører sammenlignet med rutinemessige SOC for blodstrømsinfeksjoner. Den potensielle effekten av eplex på tid til optimalisering (initiering, seponering, eskalering eller deeskalering) av antimikrobiell terapi og pasientresultat vil bli evaluert.

Oppsummert, til slutt vil denne studien evaluere de potensielle fordelene ved å implementere CE-IVD registrerte syndromdiagnostiske tester av blodbaneinfeksjoner.