Den kliniska effekten av Cobas® Eplex-blodkulturpaneler för diagnos av bakteriemi och fungemi

Blodströmsinfektioner (BSI) lägger en avsevärd börda på patienter och sjukvårdssystem på grund av behovet av sjukhusinläggning, förlängda vistelser, ytterligare diagnostiska tester och specifika behandlingar. Att få olämplig empirisk antibiotikabehandling kan öka risken för njur- och levertoxicitet, antibiotikaresistens, opportunistiska infektioner och dödlighet. Därför är tidig identifiering av de orsakande patogenerna och deras resistensmönster av yttersta vikt.

Guldstandarden för diagnos av BSI är genom blododlingar. För att upptäcka bakteriemi eller fungemi samlas blod från patienter upp och inkuberas i blododlingsflaskor. Vid användning av konventionella odlingsmetoder undersöks en positiv blodflaska med hjälp av direkt mikroskopisk undersökning, gramfärgning, inokulering av selektiva och icke-selektiva agarer, MALDI-TOF-identifiering, snabb antimikrobiell känslighetstestning (AST) och standardiserade AST-metoder. Dessa metoder kräver flera (manuella) steg och dagars handläggningstid. Efter insamlingen av en blododling beror tiden till resultatet på flera faktorer såsom den tid som behövs för att transportera blodflaskorna och ladda i inkubatorn, tillväxthastigheten för bakterier eller svampar samt tiden för att få identifieringen och AST-resultatet .

Snabba diagnostiska tester för att förbättra tiden till lämplig antimikrobiell behandling har utvecklats. De flesta tester involverar organismidentifiering och genotypiska resistensprofiler. Snabb molekylär diagnostisk testning, såsom multiplex PCR-metoder, möjliggör tidig identifiering av bakterier eller svampar och deras antimikrobiella resistensgener (resultat inom mindre än 2 timmar efter påbörjad test). Detta hjälper till att minimera tiden som behövs för att initiera effektiv antimikrobiell behandling. Kommersiella diagnostiska system för att påskynda identifieringen och detekteringen av antibiotikaresistensgener för orsakande patogener i BSI har utvecklats. Exempel inkluderar Cepheid® GeneXpert, BioFire® FilmArray®TM och Roche eplex®. Systemet som används i denna studie, eplex-systemet, är en slumpmässig multiplex PCR-plattform som kombinerar extraktion av nukleinsyror och snabb RT-PCR. Tre BCID-paneler (Blood Culture Identification) används för att identifiera de sjukdomsorsakande organismerna: Gram-positiv panel, Gram-negativ panel och Fungal Pathogen panel. Dessa paneler är designade för att upptäcka 56 olika organismer som täcker 95 % av patogener som vanligtvis förknippas med BSI och 10 vanliga antibiotikaresistensgener.

Syftet med denna studie är att bedöma effekten av snabba molekylära tester på positiva blododlingar med cobas® eplex-systemet (Roche) på antibiotikabehandling och patientresultat.

I denna studie utvärderar vi prospektivt prestandan hos eplex-systemet för patogenidentifiering och detektion av resistensmarkörer jämfört med rutinmässiga SOC för blodomloppsinfektioner. Den potentiella effekten av eplex på tiden till optimering (initiering, avbrytande, upptrappning eller nedtrappning) av antimikrobiell behandling och patientresultat kommer att utvärderas.

Sammanfattningsvis, Slutligen kommer denna studie att utvärdera de potentiella fördelarna med att implementera CE-IVD-registrerade syndromdiagnostiska tester av blodomloppsinfektioner.