Moniparametrinen mutaatioiden havaitseminen massaspektrometrian avulla virtsarakon syövässä
Perusteellinen analyysi virtsarakon syövän keskeisestä mutaatiospektristä: Nukleiinihappomassaspektrometriaan perustuvan monimutkaisen mutaationtunnistusjärjestelmän perustaminen ja kliininen validointi
Virtsarakon syöpä on erittäin heterogeeninen pahanlaatuinen kasvain, jolle on ominaista useat geneettiset muutokset, jotka liittyvät tiiviisti sairauden etenemiseen, uusiutumisriskiin ja hoitovasteeseen. Olemassa olevat mutaatiodetektio- lähestymistavat ovat kuitenkin usein rajoittuneita korkeisiin kustannuksiin, monimutkaisiin työnkulkuihin tai riittämättömään kapasiteettiin monikanava- ja matalan taajuuden mutaatioanalyysiin, mikä rajoittaa niiden rutiininomaista kliinistä soveltamista.
Tämän tutkimuksen tarkoituksena on perustaa ja kliinisesti validoida monikanavainen mutaatiodetektiojärjestelmä virtsarakon syövälle, joka perustuu nukleiinihappojen massaspektrometriaan. Käyttäen tuoreita kasvainkudoksia ja vastaavia vierekkäisiä normaaleja kudosnäytteitä, jotka on kerätty virtsarakon syöpäpotilailta, tämä tutkimus pyrkii rakentamaan kohdennetun mutaatiopaneelin, joka sisältää keskeisiä toiminnallisia mutaatioita, joilla on osoitettu kliininen relevanssi. Vastaavat normaalikudokset toimivat sukusolureferensseinä mahdollistaen somaattisten mutaatioiden tarkan tunnistamisen. Järjestelmän analyyttistä suorituskykyä, mukaan lukien herkkyys, spesifisyys ja yhteensopivuus kokogenomisekvensoinnin kanssa, arvioidaan systemaattisesti.
Lisäksi tämä tutkimus tutkii mutaatiopaneelin kliinistä hyödyllisyyttä riskiluokittelussa ja hoidon päätöksenteon tukemisessa vertaamalla sen ennustearvoa vakiintuneisiin kliinisiin malleihin ja suosituksissa suositeltuihin työkaluihin. Lopputavoitteena on kehittää kustannustehokas, toistettava ja kliinisesti sovellettava molekyylitestausstrategia, joka voi tukea tarkkaa diagnoosia ja virtsarakon syöpäpotilaiden yksilöllistä hoitoa.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Ehdot
Yksityiskohtainen kuvaus
Virtsarakon syöpä on erittäin heterogeeninen sairaus, jossa on monimutkaisia geneettisiä mutaatioita, jotka vaikuttavat kasvaimen käyttäytymiseen, hoidon vastaukseen ja potilaan ennusteeseen. Nykyiset geneettiset testausmenetelmät kohtaavat usein rajoituksia useiden mutaatioiden samanaikaisessa havaitsemisessa korkealla herkkyydellä ja alhaisilla kustannuksilla. Tämän tutkimuksen tavoitteena on kehittää ja kliinisesti validoida uusi monipuolinen mutaationtunnistusjärjestelmä virtsarakon syövälle perustuen nukleiinihappojen massaspektrometriaan (MassARRAY) -teknologiaan.
Tutkimus koostuu kahdesta vaiheesta. Ensimmäisessä vaiheessa perustamme standardoidun tunnistuspaneelin, joka kohdistuu avainlukuisiin virtsarakon syöpään liittyviin geeneihin ja toiminnallisiin mutaatiokohtiin, jotka on valittu mutaation esiintymistiheyden, kliinisen merkityksen, selviytymisvaikutuksen ja arvovaltaisten tietokantojen (TCGA, OncoKB, ClinVar) todisteiden perusteella. Paneeli kattaa kriittiset geenit, kuten FGFR3, TP53, PIK3CA ja muut, jotka liittyvät kasvaimen etenemiseen, hoidon vastaukseen ja ennusteeseen. Toisessa vaiheessa validoimme tämän järjestelmän kliinistä hyötyä käyttäen 400 tuoretta virtsarakon syövän kudosnäytettä ja parillisia vierekkäisiä normaaleja kudosnäytteitä.
Tämä tunnistusjärjestelmä tarjoaa useita etuja: (1) Suurtehoinen monipuolistaminen - jopa 30 mutaatiokohdan samanaikainen tunnistus yhdellä ajoituksella; (2) Korkea herkkyys - kyky havaita matalan taajuuden mutaatioita (vain 1-5 % varianttialleelitaajuus); (3) Kvantitatiivinen analyysi - tarjoaa alleelitaajuustietoja kasvainkuorman arvioimiseksi ja hoidon vastauksen seurantaan; (4) Kustannustehokkuus ja yksinkertaisuus - alhaisemmat kustannukset ja yksinkertaisempi työnkulku verrattuna seuraavan sukupolven sekvensointiin, mikä tekee siitä sopivan kliiniseen käyttöönottoon.
Järjestelmän kliinistä arvoa arvioidaan tiukasti: (1) vertaamalla sen riskin stratifiointisuorituskykyä vakiintuneisiin kliinisiin työkaluihin (EORTC, EAU, VI-RADS); (2) arvioimalla sen hoidon ennustearvoa nykyisiin standardeihin (CUETO, immunohistokemialliset merkkiaineet) verrattuna; ja (3) validoimalla sen tarkkuutta koko eksomin sekvensointiin verrattuna kultaisena standardina parillisissa kasvain- ja vierekkäisten normaaliudosnäytteissä.
Tarjoamalla kattavan, edullisen ja kliinisesti toiminnallisen mutaatioprofilointityökalun, tämä tutkimus pyrkii parantamaan tarkkaa riskin stratifiointia, ohjaamaan yksilöllisiä hoitopäätöksiä ja mahdollistamaan dynaamisen uusiutumisen seurannan virtsarakon syöpäpotilaille. Lopullisena tavoitteena on perustaa standardoitu molekyylidiagnostinen viitekehys, joka voidaan integroida rutiinikliiniseen käytäntöön.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: Weiguang Yang, Doctor of Medicine
- Puhelinnumero: +86 18221095087
- Sähköposti: yangwg2024@lzu.edu.cn
Opiskelupaikat
-
-
Gansu
-
Lanzhou, Gansu, Kiina, 730030
- Rekrytointi
- The Second Hospital of Lanzhou University
-
Ottaa yhteyttä:
- Weiguang Yang, Doctor of Medicine
- Puhelinnumero: +86 18221095087
- Sähköposti: yangwg2024@lzu.edu.cn
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Käyttökelpoisiksi hyväksytyillä osallistujilla on oltava riittävästi tuoretta jäädytettyä kasvainkudosta DNA:n eristämistä ja mutaatioanalyysia varten.
Poissulkemiskriteerit sisältävät riittämättömän laadun kasvainkudoksen DNA:ta mutaatioanalyysia varten, raskauden tai imetyksen sekä vakavat hallitsemattomat rinnakkaissairaudet, jotka voivat häiritä tutkimukseen osallistumista.
Tutkimuspopulaatio edustaa virtsarakon syöpäpotilaita, jotka saavat standardia kliinistä hoitoa, keskittyen geneettiseen mutaatioprofilointiin parantuneen riskiluokittelun ja hoidon ennustamisen saavuttamiseksi.
Kuvaus
Ottamiskriteerit:
- Histologisesti varmistettu virtsarakon urotereliaalikarsinooman diagnoosi (mikä tahansa vaihe, mukaan lukien ei-lihasinvasiivinen ja lihasinvasiivinen).
- Riittävän kasvainkudoksenäytteen (tuore jäädytetty tai arkistoitu FFPE) saatavuus DNA-eristystä ja mutaatioanalyysiä varten.
- Ikä ≥ 18 vuotta diagnoosiaikana.
Poissulkemiskriteerit:
- Muu pahanlaatuinen kasvainhistoria viimeisten 5 vuoden aikana, lukuun ottamatta asianmukaisesti hoidettua ei-melanoomaista ihosyöpää tai kohdunkaulan in situ -karsinoomaa.
- Riittämätön laatu tai määrä kasvainkudoksen DNA:ta mutaatioanalyysipaneelia varten (esim. vakava DNA:n hajoaminen, riittämätön DNA-saanto).
- Raskaus tai imetys.
- Vakava hallitsematon samanaikainen sairaus, joka häiritsisi tutkimuksen seurantaa tai noudattamista, mukaan lukien mutta ei rajoittuen meneillään olevaan tai aktiiviseen infektioon, oireilevaan sydämen vajaatoimintaan, epävakaan rintakipuun, sydämen rytmihäiriöön tai mielenterveyden häiriöön/sosiaalisiin tilanteisiin, jotka rajoittaisivat tutkimusvaatimusten noudattamista.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
NMIBC (Lihaskudokseen tunkeutumaton virtsarakon syöpä) -tutkimusryhmä
Tähän kohorttiin kuuluvat potilaat, joilla on diagnosoitu lihaskudokseen leviämätön virtsarakon syöpä.
Osallistujat luokitellaan leikkauksen jälkeisen uusiutumisen ja etenemisen tilan sekä intravesikaalisen hoidon vastauksen mukaan (uusiutuminen vs. ei uusiutumista; vastaus vs. ei vastausta).
Mutaatiopositiivisten ja mutaationegatiivisten ryhmien välisiä selviytymiserot arvioidaan käyttäen Kaplan-Meierin selviytymisanalyysiä.
Leikkauksen jälkeisen uusiutumisen, etenemisen ja hoidon vastauksen ennustemallit kehitetään käyttäen monimuuttujaista Coxin suhteellisten riskien regressioanalyysiä.
Mallin suorituskyky vahvistetaan 30 prosentissa osallistujista ja verrataan Euroopan urologiyhdistyksen sekä Euroopan syöpätutkimus- ja hoidon järjestön vakiintuneisiin riskimalleihin.
|
Tämä tutkimus käyttää virtsarakkosyövän monikanavaista mutaationtunnistusjärjestelmää, joka perustuu nukleiinihappojen massaspektrometriaan.
Järjestelmä on suunniteltu tunnistamaan geneettisiä muutoksia virtsarakkosyöpään liittyvissä geeneissä, mukaan lukien Fibroblastien Kasvutekijäreseptori 3 (FGFR3), Tumoriproteiini P53 (TP53) ja muut merkitykselliset geenit.
Alusta tarjoaa suuren siirtonopeuden monikanavaisen mutaationtunnistuksen korkealla analyyttisellä herkkyydellä ja kustannustehokkuudella, mikä soveltuu mahdolliseen kliiniseen käyttöön.
Kasvainkudosnäytteitä kerätään prospektiivisesti potilailta, joilla on virtsarakkosyöpä ja jotka päättävät leikkaushoidosta.
Tutkimus on havainnoiva, eikä siinä tehdä aktiivista interventiota, terapeuttista muutosta tai vaikuta kliinisiin hoitopäätöksiin.
Kudostenalyysistä saatuja mutaatiotiloja arvioidaan korrelaatioiden suhteen kliinisiin lopputulemiin, kuten uusiutumiseen, etenemiseen ja hoitovasteeseen.
|
|
MIBC (Lihasinvasiivisen virtsarakon syövän) tutkimusryhmä
Tämä kohortti sisältää potilaat, joilla on diagnosoitu lihasinvasiivinen virtsarakon syöpä.
Osallistujat luokitellaan adjuvanttihoidon jälkeisen uusiutumisen ja kaukokäännöksen läsnäolon tai puuttumisen mukaan.
Selviytymiserot mutaatiopositiivisten ja mutaationegatiivisten ryhmien välillä arvioidaan käyttäen Kaplan-Meierin selviytymisanalyysiä.
Uusiutumisen ja kaukokäännöksen ennustava malli adjuvanttihoidon jälkeen kehitetään käyttäen monimuuttujaista Coxin suhteellisten riskien regressioanalyysiä.
Mallin suorituskyky vahvistetaan jäljellä olevassa 30 % osallistujista.
Ennustetarkkuutta verrataan olemassa oleviin kliinisiin arviointimenetelmiin, mukaan lukien kliinipatologiset ominaisuudet, yksittäisen geenin mutaatiomarkkerit ja immunohistokemialliset biomarkkerit.
|
Tämä tutkimus käyttää virtsarakkosyövän monikanavaista mutaationtunnistusjärjestelmää, joka perustuu nukleiinihappojen massaspektrometriaan.
Järjestelmä on suunniteltu tunnistamaan geneettisiä muutoksia virtsarakkosyöpään liittyvissä geeneissä, mukaan lukien Fibroblastien Kasvutekijäreseptori 3 (FGFR3), Tumoriproteiini P53 (TP53) ja muut merkitykselliset geenit.
Alusta tarjoaa suuren siirtonopeuden monikanavaisen mutaationtunnistuksen korkealla analyyttisellä herkkyydellä ja kustannustehokkuudella, mikä soveltuu mahdolliseen kliiniseen käyttöön.
Kasvainkudosnäytteitä kerätään prospektiivisesti potilailta, joilla on virtsarakkosyöpä ja jotka päättävät leikkaushoidosta.
Tutkimus on havainnoiva, eikä siinä tehdä aktiivista interventiota, terapeuttista muutosta tai vaikuta kliinisiin hoitopäätöksiin.
Kudostenalyysistä saatuja mutaatiotiloja arvioidaan korrelaatioiden suhteen kliinisiin lopputulemiin, kuten uusiutumiseen, etenemiseen ja hoitovasteeseen.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Selviytymiserot mutaatio- ja ei-mutaatioryhmien välillä virtsarakkosyöpäpotilailla
Aikaikkuna: Selviytyminen arvioidaan leikkauksen jälkeisessä seurannassa 6 kuukauden, 1 vuoden, 2 vuoden ja 3 vuoden kohdalla, mukaan lukien uusiutuminen, eteneminen ja etäpesäkkeettömän selviytymisen tapahtumat 3 vuoden aikana.
|
Tämä lopputulosmittari pyrkii vertailemaan elossaoloprosentteja virtsarakon syöpäpotilaiden kesken, joilla on mutaatioita keskeisissä virtsarakon syöpään liittyvissä geeneissä (kuten monipuolisen mutaatiotunnistuspaneelin määrittämä), ja niiden välillä, joilla ei ole mutaatioita.
Mutaatiotilaa (mikä tahansa geenimutaatio verrattuna ei-mutaatioon) korreloidaan kliinisten lopputulosten kanssa, mukaan lukien toistumattoman selviytymisen (RFS), etenevyydettömän selviytymisen (PFS) ja kokonaisselviytymisen (OS), käyttäen Kaplan-Meierin selviytymisanalyysiä.
Näitä selviytymismittareita arvioidaan selvittääkseen, vaikuttaako mutaatiotila ennusteeseen, ja tunnistaakseen merkittäviä selviytymiseroja mutatoituneiden ja ei-mutatoituneiden ryhmien välillä.
|
Selviytyminen arvioidaan leikkauksen jälkeisessä seurannassa 6 kuukauden, 1 vuoden, 2 vuoden ja 3 vuoden kohdalla, mukaan lukien uusiutuminen, eteneminen ja etäpesäkkeettömän selviytymisen tapahtumat 3 vuoden aikana.
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Ennakoivien mallien kehittäminen leikkauksenjälkeiselle toistumiselle, etenemiselle ja vastaukselle intravesikaaliseen hoitoon
Aikaikkuna: Ennustava malli kehitetään ja arvioidaan 3 vuoden seuranta-aikana leikkauksen jälkeen, ja tietoja kerätään keskeisinä aikaväleinä: 6 kuukautta, 1 vuosi, 2 vuotta ja 3 vuotta leikkauksen jälkeen.
|
Tämä toissijainen tulostekijä keskittyy leikkauksen jälkeisen uusiutumisen, etenemisen ja intravesikaaliseen hoitoon vastaamisen riskitekijöiden tunnistamiseen käyttäen monimuuttujalista Coxin suhteellisten riskien regressioanalyysiä.
Tekijät kuten kasvainvaihe, kasvainten määrä, ikä ja mutaatiotila sisällytetään ennustemalliin arvioimaan uusiutumisen ja etenemisen todennäköisyyttä.
Malli integroi mutaatiopaneelin riskiluokittelun hienosäätämiseksi ja kliinisen päätöksenteon tukemiseksi.
|
Ennustava malli kehitetään ja arvioidaan 3 vuoden seuranta-aikana leikkauksen jälkeen, ja tietoja kerätään keskeisinä aikaväleinä: 6 kuukautta, 1 vuosi, 2 vuotta ja 3 vuotta leikkauksen jälkeen.
|
|
Mutaatiopaneelin ennustearvon validoiminen riskiluokittelussa käyttäen olemassa olevia kliinisiä malleja
Aikaikkuna: Validointi tapahtuu 3 vuoden potilasseurannan jälkeen, kun ennustemalleja verrataan niiden tehokkuuden suhteen riskiluokittelussa ja uusiutumisen ennustamisessa.
|
Tämä mittari arvioi mutaatio-paneelin suorituskykyä potilaan ennusteiden ennustamisessa verrattuna vakiintuneisiin kliinisiin malleihin, kuten European Association of Urology (EAU), European Organisation for Research and Treatment of Cancer (EORTC) ja Spanish Urological Club for Oncological Treatment (CUETO).
Mutaatio-paneelin ennustearvoa verrataan näihin malleihin riskiryhmien eriyttämisessä eri riskiryhmissä (erittäin korkea, korkea, keskitaso, matala riski).
Tavoitteena on vahvistaa mutaatio-paneelin tehokkuus lisätyökaluna potilaiden eriyttämisessä ja uusiutumisen ennustamisessa.
|
Validointi tapahtuu 3 vuoden potilasseurannan jälkeen, kun ennustemalleja verrataan niiden tehokkuuden suhteen riskiluokittelussa ja uusiutumisen ennustamisessa.
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Tutkijat
- Päätutkija: Zhilong Dong, Doctor of Medicine, Lanzhou University Second Hospital
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Arvioitu)
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
- Urogenitaaliset sairaudet
- Urogenitaaliset kasvaimet
- Neoplasmat sivustoittain
- Neoplasmat
- Miesten urogenitaaliset sairaudet
- Urologiset sairaudet
- Naisten virtsa- ja sukupuolielinten sairaudet
- Naisten virtsa- ja sukupuolielinten sairaudet ja raskauden komplikaatiot
- Urologiset kasvaimet
- Virtsarakon sairaudet
- Virtsarakon kasvaimet
Muut tutkimustunnusnumerot
- LZU2H-BC-MASS-2026
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
IPD-suunnitelman kuvaus
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .