Мультиплексное обнаружение мутаций с помощью масс-спектрометрии при раке мочевого пузыря
Комплексный анализ спектра ключевых мутаций при раке мочевого пузыря: разработка и клиническая валидация мультиплексной системы детекции мутаций на основе масс-спектрометрии нуклеиновых кислот
Рак мочевого пузыря представляет собой высокогетерогенное злокачественное новообразование, характеризующееся частыми генетическими изменениями, тесно связанными с прогрессированием заболевания, риском рецидива и ответом на лечение. Однако существующие подходы к детекции мутаций часто ограничены высокой стоимостью, сложными рабочими процессами или недостаточной способностью к мультиплексному анализу мутаций и анализу низкочастотных мутаций, что ограничивает их рутинное клиническое применение.
Целью данного исследования является создание и клиническая валидация системы мультиплексной детекции мутаций при раке мочевого пузыря на основе масс-спектрометрии нуклеиновых кислот. Используя свежую опухолевую ткань и соответствующие образцы прилежащей нормальной ткани, собранные у пациентов с раком мочевого пузыря, данное исследование направлено на создание целевой панели мутаций, включающей ключевые функциональные мутации с доказанной клинической значимостью. Соответствующие нормальные ткани служат герминальными референсами для точной идентификации соматических мутаций. Аналитическая производительность системы, включая чувствительность, специфичность и соответствие результатам полногеномного секвенирования, будет систематически оценена.
Кроме того, в данном исследовании будет изучена клиническая полезность панели мутаций в стратификации риска и поддержке принятия решений о лечении путем сравнения её прогностической ценности с установленными клиническими моделями и инструментами, рекомендованными в руководствах. Конечной целью является разработка экономически эффективной, воспроизводимой и клинически применимой молекулярной тестовой стратегии, которая может поддержать точную диагностику и индивидуализированное ведение пациентов с раком мочевого пузыря.
Обзор исследования
Статус
Условия
Подробное описание
Рак мочевого пузыря является высокогетерогенным заболеванием со сложными генетическими мутациями, которые влияют на поведение опухоли, ответ на лечение и исходы пациентов. Современные методы генетического тестирования часто сталкиваются с ограничениями в одновременном обнаружении множественных мутаций с высокой чувствительностью и низкой стоимостью. Это исследование направлено на разработку и клиническую валидацию новой системы мультиплексного обнаружения мутаций для рака мочевого пузыря на основе технологии масс-спектрометрии нуклеиновых кислот (MassARRAY).
Исследование состоит из двух этапов. На первом этапе мы разработаем стандартизированную панель обнаружения, нацеленную на ключевые гены, связанные с раком мочевого пузыря, и функциональные сайты мутаций, отобранные на основе частоты мутаций, клинической значимости, влияния на выживаемость и данных авторитетных баз (TCGA, OncoKB, ClinVar). Панель охватывает критически важные гены, включая FGFR3, TP53, PIK3CA и другие, вовлечённые в прогрессирование опухоли, терапевтический ответ и прогноз. На втором этапе мы проведём валидацию клинической полезности этой системы с использованием 400 свежесобранных образцов ткани рака мочевого пузыря и парных образцов прилегающей нормальной ткани.
Эта система обнаружения предлагает несколько преимуществ: (1) Высокопроизводительное мультиплексирование — одновременное обнаружение до 30 сайтов мутаций за один запуск; (2) Высокая чувствительность — способность обнаруживать низкочастотные мутации (с частотой аллельных вариантов всего 1-5%); (3) Количественный анализ — предоставление информации о частоте аллелей для оценки опухолевой нагрузки и мониторинга ответа на лечение; (4) Экономическая эффективность и простота — более низкая стоимость и упрощённый рабочий процесс по сравнению с секвенированием следующего поколения, что делает её пригодной для клинического внедрения.
Клиническая ценность этой системы будет тщательно оценена путём: (1) сравнения её производительности в стратификации риска с установленными клиническими инструментами (EORTC, EAU, VI-RADS); (2) оценки её прогностической ценности для лечения по сравнению с текущими стандартами (CUETO, иммуногистохимические маркеры); и (3) валидации её точности против полного экзомного секвенирования как золотого стандарта в парных образцах опухолевой и прилегающей нормальной ткани.
Предоставляя комплексный, доступный и клинически применимый инструмент профилирования мутаций, это исследование направлено на улучшение точной стратификации риска, руководство индивидуальными решениями о лечении и обеспечение динамического мониторинга рецидивов для пациентов с раком мочевого пузыря. Конечная цель — установить стандартизированную молекулярно-диагностическую структуру, которую можно интегрировать в рутинную клиническую практику.
Тип исследования
Регистрация (Оцененный)
Контакты и местонахождение
Контакты исследования
- Имя: Weiguang Yang, Doctor of Medicine
- Номер телефона: +86 18221095087
- Электронная почта: yangwg2024@lzu.edu.cn
Места учебы
-
-
Gansu
-
Lanzhou, Gansu, Китай, 730030
- Рекрутинг
- The Second Hospital of Lanzhou University
-
Контакт:
- Weiguang Yang, Doctor of Medicine
- Номер телефона: +86 18221095087
- Электронная почта: yangwg2024@lzu.edu.cn
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
- Взрослый
- Пожилой взрослый
Принимает здоровых добровольцев
Метод выборки
Исследуемая популяция
Описание
Критерии включения:
- Гистологически подтвержденный диагноз уротелиальной карциномы мочевого пузыря (любой стадии, включая немышечно-инвазивную и мышечно-инвазивную).
- Наличие достаточного образца опухолевой ткани (свежезамороженной или архивной фиксированной в формалине и залитой в парафин) для экстракции ДНК и анализа мутаций.
- Возраст ≥ 18 лет на момент постановки диагноза.
Критерии исключения:
- Наличие других злокачественных опухолей в анамнезе в течение последних 5 лет, за исключением адекватно пролеченного немеланомного рака кожи или карциномы in situ шейки матки.
- Недостаточное качество или количество ДНК опухолевой ткани для анализа панели мутаций (например, выраженная деградация ДНК, недостаточный выход ДНК).
- Беременность или период грудного вскармливания.
- Тяжелое неконтролируемое интеркуррентное заболевание, которое может повлиять на наблюдение в исследовании или соблюдение протокола, включая, но не ограничиваясь, текущей или активной инфекцией, симптоматической застойной сердечной недостаточностью, нестабильной стенокардией, сердечной аритмией или психическим заболеванием/социальными обстоятельствами, ограничивающими соблюдение требований исследования.
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
Исследовательская группа по изучению немышечно-инвазивного рака мочевого пузыря (НМИРМП)
Эта когорта включает пациентов с диагнозом немышечно-инвазивного рака мочевого пузыря.
Участники классифицируются в зависимости от послеоперационного рецидива и статуса прогрессирования, а также ответа на внутрипузырную терапию (рецидив против отсутствия рецидива; ответ против отсутствия ответа).
Различия в выживаемости между группами с мутацией и без мутации будут оценены с использованием анализа выживаемости по методу Каплана-Мейера.
Прогностические модели для послеоперационного рецидива, прогрессирования и ответа на лечение будут разработаны с использованием многомерного регрессионного анализа пропорциональных рисков Кокса.
Производительность модели будет проверена на 30% участников и сравнена с установленными моделями риска от Европейской ассоциации урологов и Европейской организации по исследованию и лечению рака.
|
В этом исследовании используется мультиплексная система детекции мутаций при раке мочевого пузыря на основе масс-спектрометрии нуклеиновых кислот.
Система предназначена для выявления генетических изменений в генах, связанных с раком мочевого пузыря, включая рецептор фактора роста фибробластов 3 (FGFR3), опухолевый белок P53 (TP53) и другие соответствующие гены.
Платформа обеспечивает высокопроизводительную мультиплексную детекцию мутаций с высокой аналитической чувствительностью и экономической эффективностью, что подходит для потенциального клинического применения.
Образцы опухолевой ткани будут проспективно собираться у пациентов с раком мочевого пузыря, которые выбирают хирургическое лечение.
Исследование является обсервационным, без активного вмешательства, изменения терапии или влияния на клинические решения по лечению.
Статус мутаций из анализа ткани будет оцениваться на предмет корреляций с клиническими исходами, включая рецидив, прогрессирование и ответ на лечение.
|
|
Исследовательская группа по MIBC (инвазивному раку мочевого пузыря с поражением мышечного слоя)
Эта когорта включает пациентов с диагнозом мышечно-инвазивного рака мочевого пузыря.
Участники классифицируются в зависимости от рецидива после адъювантной терапии и наличия или отсутствия отдалённых метастазов.
Различия в выживаемости между мутационно-позитивными и мутационно-негативными группами будут оценены с помощью анализа выживаемости по методу Каплана-Мейера.
Предиктивная модель для рецидива и отдалённых метастазов после адъювантной терапии будет разработана с использованием многомерного регрессионного анализа пропорциональных рисков Кокса.
Работоспособность модели будет проверена на оставшихся 30% участников.
Прогностическая точность будет сравниваться с существующими клиническими методами оценки, включая клинико-патологические характеристики, маркеры одно-генных мутаций и иммуногистохимические биомаркеры.
|
В этом исследовании используется мультиплексная система детекции мутаций при раке мочевого пузыря на основе масс-спектрометрии нуклеиновых кислот.
Система предназначена для выявления генетических изменений в генах, связанных с раком мочевого пузыря, включая рецептор фактора роста фибробластов 3 (FGFR3), опухолевый белок P53 (TP53) и другие соответствующие гены.
Платформа обеспечивает высокопроизводительную мультиплексную детекцию мутаций с высокой аналитической чувствительностью и экономической эффективностью, что подходит для потенциального клинического применения.
Образцы опухолевой ткани будут проспективно собираться у пациентов с раком мочевого пузыря, которые выбирают хирургическое лечение.
Исследование является обсервационным, без активного вмешательства, изменения терапии или влияния на клинические решения по лечению.
Статус мутаций из анализа ткани будет оцениваться на предмет корреляций с клиническими исходами, включая рецидив, прогрессирование и ответ на лечение.
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Различия в выживаемости между группами с мутациями и без мутаций у пациентов с раком мочевого пузыря
Временное ограничение: Выживаемость будет оцениваться в ходе послеоперационного наблюдения через 6 месяцев, 1 год, 2 года и 3 года, включая события безрецидивной, безпрогрессионной и безметастатической выживаемости в течение 3-летнего периода.
|
Данный показатель результата направлен на сравнение показателей выживаемости между пациентами с раком мочевого пузыря, имеющими мутации в ключевых генах, связанных с раком мочевого пузыря (определяемыми с помощью мультиплексной панели детекции мутаций), и теми, у кого мутации отсутствуют.
Статус мутации (наличие любой мутации гена в сравнении с отсутствием мутации) будет коррелировать с клиническими исходами, включая выживаемость без рецидивов (RFS), выживаемость без прогрессирования (PFS) и общую выживаемость (OS), с использованием анализа выживаемости по методу Каплана-Мейера.
Эти показатели выживаемости будут оценены для определения того, влияет ли статус мутации на прогноз, а также для выявления любых значительных различий в выживаемости между группами с мутациями и без мутаций.
|
Выживаемость будет оцениваться в ходе послеоперационного наблюдения через 6 месяцев, 1 год, 2 года и 3 года, включая события безрецидивной, безпрогрессионной и безметастатической выживаемости в течение 3-летнего периода.
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Разработка прогностических моделей для послеоперационного рецидива, прогрессирования и ответа на внутрипузырную терапию
Временное ограничение: Прогностическая модель будет разработана и оценена в течение 3-летнего периода наблюдения после операции, с данными, собранными в ключевые интервалы: 6 месяцев, 1 год, 2 года и 3 года после операции.
|
Этот вторичный показатель результата направлен на выявление факторов риска послеоперационного рецидива, прогрессирования и ответа на внутрипузырную терапию с использованием многомерного регрессионного анализа Кокса пропорциональных рисков.
Факторы, такие как стадия опухоли, количество опухолей, возраст и статус мутации, будут включены в прогностическую модель для оценки вероятности рецидива и прогрессирования.
Модель интегрирует панель мутаций для уточнения стратификации риска и поддержки принятия клинических решений.
|
Прогностическая модель будет разработана и оценена в течение 3-летнего периода наблюдения после операции, с данными, собранными в ключевые интервалы: 6 месяцев, 1 год, 2 года и 3 года после операции.
|
|
Валидация прогностической ценности панели мутаций для стратификации риска с использованием существующих клинических моделей
Временное ограничение: Валидация будет проведена через 3 года наблюдения за пациентами, в момент сравнения прогностических моделей по их эффективности в стратификации риска и предсказании рецидива.
|
Эта мера позволит оценить эффективность панели мутаций в прогнозировании исходов у пациентов по сравнению с установленными клиническими моделями, такими как Европейская ассоциация урологов (EAU), Европейская организация по исследованию и лечению рака (EORTC) и Испанский урологический клуб онкологического лечения (CUETO).
Прогностическая ценность панели мутаций будет сравниваться с этими моделями для стратификации риска в различных группах риска (очень высокий, высокий, средний, низкий риск).
Цель состоит в том, чтобы подтвердить эффективность панели мутаций в качестве дополнительного инструмента для стратификации пациентов и прогнозирования рецидива.
|
Валидация будет проведена через 3 года наблюдения за пациентами, в момент сравнения прогностических моделей по их эффективности в стратификации риска и предсказании рецидива.
|
Соавторы и исследователи
Спонсор
Следователи
- Главный следователь: Zhilong Dong, Doctor of Medicine, Lanzhou University Second Hospital
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования (Оцененный)
Первичное завершение (Оцененный)
Завершение исследования (Оцененный)
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (Действительный)
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Дополнительные соответствующие термины MeSH
- Урогенитальные заболевания
- Урогенитальные новообразования
- Новообразования по локализации
- Новообразования
- Мужские мочеполовые заболевания
- Урологические заболевания
- Женские урогенитальные заболевания
- Женские мочеполовые заболевания и осложнения беременности
- Урологические новообразования
- Заболевания мочевого пузыря
- Новообразования мочевого пузыря
Другие идентификационные номера исследования
- LZU2H-BC-MASS-2026
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
Описание плана IPD
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .