Détection moléculaire précoce pour un meilleur diagnostic de l'aspergillose pulmonaire invasive et de la zygomycose pulmonaire invasive

Arrière-plan:

Les infections fongiques invasives sont une cause importante de maladies infectieuses, de morbidité et de mortalité chez les patients immunodéprimés atteints de cancer, de greffe de cellules souches hématopoïétiques, d'anémie aplasique, de maladies auto-immunes et de déficiences immunitaires primaires.

Parmi les plus meurtrières de ces infections figurent l'aspergillose pulmonaire invasive et la zygomycose. La détection précoce de ces infections permet l'initiation rapide d'un traitement antifongique spécifique, qui peut sauver des vies. Cependant, le diagnostic précoce des infections fongiques respiratoires est difficile, ce qui entraîne souvent un retard dans la thérapie et un traitement inexact.

La section Hôtes immunodéprimés a développé une série de tests PCR sensibles et hautement spécifiques pour la détection de ces infections potentiellement mortelles. Nous avons également caractérisé l'expression de biomarqueurs dérivés de la paroi cellulaire, le (1-3)-Bêta-D-glucane et le galactomannane in vitro et in vivo. Des études sur des animaux de laboratoire indiquent que ces tests peuvent compléter les modalités de diagnostic actuelles et permettre une détection plus précise et plus précoce des infections fongiques pulmonaires invasives chez les patients immunodéprimés.

Objectifs:

L'objectif principal de cette étude est d'améliorer le diagnostic précoce de l'aspergillose pulmonaire invasive et de la zygomycose pulmonaire invasive chez les patients immunodéprimés grâce à l'ajout d'une méthodologie de détection de biomarqueurs moléculaires aux systèmes de diagnostic standard utilisés dans les laboratoires de microbiologie clinique.

Les objectifs secondaires sont :

A. Pour comparer le rendement diagnostique et les performances analytiques de la PCR, du galactomannane et du (1-3)-bêta-D-glucane aux systèmes de diagnostic standard.

B. Pour évaluer l'effet de différentes variables indépendantes sur l'expression des tests susmentionnés

C. Caractériser les variables pouvant contribuer au résultat thérapeutique (réponse globale ; survie)

D. Caractériser l'utilisation de ces biomarqueurs dans le cadre des définitions EORTC/MSG

E. Identifier les marqueurs génétiques qui peuvent prédisposer les patients aux infections pulmonaires fongiques invasives.

Admissibilité:

Patients immunodéprimés actuellement inscrits dans un protocole de centre clinique approuvé par le NIH IRB pour l'évaluation et/ou le traitement de leur maladie primaire, ou patients recevant un traitement au Centre médical national pour enfants (CNMC) qui développent un infiltrat pulmonaire radiologiquement compatible avec l'aspergillose pulmonaire invasive ou zygomycose pulmonaire invasive, selon les critères EORTC/MSG.

Conception:

Il s'agit d'une étude interventionnelle diagnostique prospective multicentrique.

Les patients référés au centre clinique pour évaluation et traitement dans les protocoles de recherche primaires seront éligibles pour l'inscription à ce protocole au centre clinique. Les patients répondant aux critères d'éligibilité peuvent également être inscrits à partir du CNMC.

Les patients qui présentent des signes radiologiques compatibles et qui sont à risque de développer une aspergillose pulmonaire invasive et une zygomycose pulmonaire invasive recevront des échantillons de surnageant de liquide de lavage bronchoalvéolaire (LBA) et/ou de tissu provenant d'une biopsie pulmonaire lorsqu'ils seront disponibles, obtenus pour la mesure de la PCR diagnostique pour Aspergillus et identification des zygomycètes, protéomique, cytokines et pour la présence de galactomannane et de (1-3)-bêta-D-glucane. Le BAL ne sera effectué que s'il est cliniquement indiqué dans le cadre des soins de routine du patient pour les infiltrats pulmonaires.

Le sang sera prélevé sur des patients répondant aux critères d'éligibilité, qu'ils aient subi une biopsie du LBA ou du tissu pulmonaire, à soumettre pour la mesure de la PCR diagnostique pour l'identification des Aspergillus et des Zygomycètes, la protéomique, les cytokines, la présence de galactomannane et (1- 3)-Bêta-D-glucane et génomique de l'hôte.

Des copies numériques d'images de tomographie par ordinateur (CT), qui font partie des soins de routine, seront utilisées pour reconstruire des images volumétriques multidimensionnelles et corréler les résultats cliniques et de laboratoire avec l'étendue de l'implication du volume pulmonaire.

Arrière-plan:

Les infections fongiques invasives sont une cause importante de maladies infectieuses, de morbidité et de mortalité chez les patients immunodéprimés atteints de cancer, de greffe de cellules souches hématopoïétiques, d'anémie aplasique, de maladies auto-immunes et de déficiences immunitaires primaires.

Parmi les plus meurtrières de ces infections figurent l'aspergillose pulmonaire invasive et la zygomycose. La détection précoce de ces infections permet l'initiation rapide d'un traitement antifongique spécifique, qui peut sauver des vies. Cependant, le diagnostic précoce des infections fongiques respiratoires est difficile, ce qui entraîne souvent un retard dans la thérapie et un traitement inexact.

La section Hôtes immunodéprimés a développé une série de tests PCR sensibles et hautement spécifiques pour la détection de ces infections potentiellement mortelles. Nous avons également caractérisé l'expression de biomarqueurs dérivés de la paroi cellulaire, le (1-3)-Bêta-D-glucane et le galactomannane in vitro et in vivo. Des études sur des animaux de laboratoire indiquent que ces tests peuvent compléter les modalités de diagnostic actuelles et permettre une détection plus précise et plus précoce des infections fongiques pulmonaires invasives chez les patients immunodéprimés.

Objectifs:

L'objectif principal de cette étude est d'améliorer le diagnostic précoce de l'aspergillose pulmonaire invasive et de la zygomycose pulmonaire invasive chez les patients immunodéprimés grâce à l'ajout d'une méthodologie de détection de biomarqueurs moléculaires aux systèmes de diagnostic standard utilisés dans les laboratoires de microbiologie clinique.

Les objectifs secondaires sont :

A. Pour comparer le rendement diagnostique et les performances analytiques de la PCR, du galactomannane et du (1-3)-bêta-D-glucane aux systèmes de diagnostic standard.

B. Pour évaluer l'effet de différentes variables indépendantes sur l'expression des tests susmentionnés

C. Caractériser les variables pouvant contribuer au résultat thérapeutique (réponse globale ; survie)

D. Caractériser l'utilisation de ces biomarqueurs dans le cadre des définitions EORTC/MSG

E. Identifier les marqueurs génétiques qui peuvent prédisposer les patients aux infections pulmonaires fongiques invasives.

Admissibilité:

Patients immunodéprimés actuellement inscrits dans un protocole de centre clinique approuvé par le NIH IRB pour l'évaluation et/ou le traitement de leur maladie primaire, ou patients recevant un traitement au Centre médical national pour enfants (CNMC) qui développent un infiltrat pulmonaire radiologiquement compatible avec l'aspergillose pulmonaire invasive ou zygomycose pulmonaire invasive, selon les critères EORTS/MSG.

Conception:

Il s'agit d'une étude interventionnelle diagnostique prospective multicentrique.

Les patients référés au centre clinique pour évaluation et traitement dans les protocoles de recherche primaires seront éligibles pour l'inscription à ce protocole au centre clinique. Les patients répondant aux critères d'éligibilité peuvent également être inscrits à partir du CNMC.

Les patients qui présentent des signes radiologiques compatibles et qui sont à risque de développer une aspergillose pulmonaire invasive et une zygomycose pulmonaire invasive recevront des échantillons de surnageant de liquide de lavage bronchoalvéolaire (LBA) et/ou de tissu provenant d'une biopsie pulmonaire lorsqu'ils seront disponibles, obtenus pour la mesure de la PCR diagnostique pour Aspergillus et identification des zygomycètes, protéomique, cytokines et pour la présence de galactomannane et de (1-3)-bêta-D-glucane. Le BAL ne sera effectué que s'il est cliniquement indiqué dans le cadre des soins de routine du patient pour les infiltrats pulmonaires.

Le sang sera prélevé sur des patients répondant aux critères d'éligibilité, qu'ils aient subi une biopsie du LBA ou du tissu pulmonaire, à soumettre pour la mesure de la PCR diagnostique pour l'identification des Aspergillus et des Zygomycètes, la protéomique, les cytokines, la présence de galactomannane et (1- 3)-Bêta-D-glucane et génomique de l'hôte.

Des copies numériques d'images de tomographie par ordinateur (CT), qui font partie des soins de routine, seront utilisées pour reconstruire des images volumétriques multidimensionnelles et corréler les résultats cliniques et de laboratoire avec l'étendue de l'implication du volume pulmonaire.