Biomarqueurs d'ADN dans des échantillons de tissus de patients atteints d'ostéosarcome
Recherche thérapeutiquement applicable pour générer des traitements efficaces (TARGET) pour l'ostéosarcome
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Intervention / Traitement
Description détaillée
OBJECTIFS:
I. Détecter de manière exhaustive les aberrations génomiques, épigénomiques et transcriptomiques dans des échantillons de tissus de patients atteints d'ostéosarcome susceptibles de jouer un rôle dans la chimiorésistance et les métastases à l'aide de technologies à haute résolution à l'échelle du génome.
II. Identifier les mutations génétiques récurrentes impliquées dans la pathogenèse de l'ostéosarcome, en particulier pour le développement de la chimiorésistance et des tumeurs métastatiques.
III. Identifier et valider ces biomarqueurs pour de nouvelles cibles thérapeutiques pour les patients atteints d'ostéosarcome, en particulier ceux atteints d'une maladie métastatique et dont les tumeurs sont résistantes à la chimiothérapie standard.
APERÇU : Il s'agit d'une étude multicentrique. Les échantillons d'ADN de tissu tumoral et de sang périphérique archivés sont analysés pour le profilage du nombre de copies d'ADN, le profilage de l'expression génique, le profilage de la méthylation de l'ADN, le profilage des microARN et le reséquençage génomique. Données cliniques, y compris démographiques ; date du diagnostic, de la chirurgie, de la chimiothérapie, de la récidive, de la progression et du décès ; imagerie; toxicité; et des éléments de données pathologiques associés aux échantillons sont également collectés et analysés.
Type d'étude
Inscription (Réel)
Contacts et emplacements
Lieux d'étude
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Pennsylvania
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Philadelphia, Pennsylvania, États-Unis, 19104
- Childrens Oncology Group
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
- Enfant
- Adulte
- Adulte plus âgé
Accepte les volontaires sains
Sexes éligibles pour l'étude
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
La description
Critère d'intégration:
- Diagnostic de l'ostéosarcome
Échantillons fraîchement congelés prélevés au moment du diagnostic avec de l'ADN de sang apparié (de préférence) de patients inscrits aux protocoles de biologie de l'ostéosarcome suivants :
- COG-P9851
- COG-AOST06B1
- Données disponibles sur les résultats cliniques
- Non spécifié
- Non spécifié
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Modèles d'observation: Cas uniquement
- Perspectives temporelles: Rétrospective
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
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Ancillaire-Corrélatif (prélèvement et analyse de biomarqueurs)
Les échantillons d'ADN de tissu tumoral et de sang périphérique archivés sont analysés pour le profilage du nombre de copies d'ADN, le profilage de l'expression génique, le profilage de la méthylation de l'ADN, le profilage des microARN et le reséquençage génomique.
Données cliniques, y compris démographiques ; date du diagnostic, de la chirurgie, de la chimiothérapie, de la récidive, de la progression et du décès ; imagerie; toxicité; et des éléments de données pathologiques associés aux échantillons sont également collectés et analysés.
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Études corrélatives
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Expression des gènes
Délai: Ligne de base
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L'algorithme d'analyse de signification des puces à ADN (SAM) sera utilisé pour l'analyse de l'expression différentielle.
L'analyse des voies et l'intégration des données seront effectuées sur les gènes exprimés de manière différentielle à l'aide d'Ingenuity Pathway Analysis.
Les gènes exprimés différentiellement et les cibles miARN ainsi que les gènes dans les aberrations significatives de l'ADN seront cartographiés et intégrés pour identifier les voies et les réseaux enrichis.
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Ligne de base
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Incidence des aberrations du nombre de copies
Délai: Ligne de base
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Les données du tableau seront importées dans l'analyseur de nombre de copies (CNAG) pour les tableaux de cartographie GeneChip afin d'identifier les aberrations du nombre de copies dans les échantillons de tumeurs.
Pour identifier les régions avec une CNA fréquente parmi différents groupes d'échantillons de patients, nous utiliserons l'outil d'identification génomique des cibles significatives dans le cancer (GISTIC) .
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Ligne de base
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Incidence des mutations qui se produisent à une fréquence cliniquement significative
Délai: Ligne de base
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Ligne de base
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Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Collaborateurs
Les enquêteurs
- Chercheur principal: Ching C Lau, Children's Oncology Group
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Réel)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Estimation)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- AOST10B5 (Autre identifiant: CTEP)
- U10CA098543 (Subvention/contrat des NIH des États-Unis)
- NCI-2011-02840 (Identificateur de registre: CTRP (Clinical Trial Reporting Program))
- CDR0000683276
- COG-AOST10B5
Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
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