Биомаркеры ДНК в образцах тканей пациентов с остеосаркомой
Терапевтически применимые исследования для разработки эффективных методов лечения (TARGET) остеосаркомы
Обзор исследования
Статус
Вмешательство/лечение
Подробное описание
ЦЕЛИ:
I. Всесторонне обнаружить геномные, эпигеномные и транскриптомные аберрации в образцах тканей пациентов с остеосаркомой, которые могут играть роль в химиорезистентности и метастазировании, с использованием полногеномных технологий высокого разрешения.
II. Выявить рецидивирующие генетические мутации, участвующие в патогенезе остеосаркомы, особенно в развитии химиорезистентных и метастатических опухолей.
III. Идентифицировать и подтвердить эти биомаркеры для новых терапевтических целей для пациентов с остеосаркомой, особенно с метастазами и чьи опухоли устойчивы к стандартной химиотерапии.
ОПИСАНИЕ: Это многоцентровое исследование. Архивные образцы опухолевой ткани и ДНК периферической крови анализируют на предмет профилирования числа копий ДНК, профилирования экспрессии генов, профилирования метилирования ДНК, профилирования микроРНК и повторного секвенирования генома. Клинические данные, включая демографические; дата постановки диагноза, операции, химиотерапии, рецидива, прогрессирования и смерти; визуализация; токсичность; и элементы патологических данных, связанные с образцами, также собираются и анализируются.
Тип исследования
Регистрация (Действительный)
Контакты и местонахождение
Места учебы
-
-
Pennsylvania
-
Philadelphia, Pennsylvania, Соединенные Штаты, 19104
- Childrens Oncology Group
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
- Ребенок
- Взрослый
- Пожилой взрослый
Принимает здоровых добровольцев
Полы, имеющие право на обучение
Метод выборки
Исследуемая популяция
Описание
Критерии включения:
- Диагностика остеосаркомы
Свежезамороженные образцы, собранные во время постановки диагноза с использованием совпадающей ДНК крови (предпочтительно) у пациентов, включенных в следующие протоколы биологии остеосаркомы:
- COG-P9851
- COG-AOST06B1
- Доступные данные о клинических исходах
- Не указан
- Не указан
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
- Наблюдательные модели: Только для случая
- Временные перспективы: Ретроспектива
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
Вспомогательный корреляционный (отбор и анализ биомаркеров)
Архивные образцы опухолевой ткани и ДНК периферической крови анализируют на предмет профилирования числа копий ДНК, профилирования экспрессии генов, профилирования метилирования ДНК, профилирования микроРНК и повторного секвенирования генома.
Клинические данные, включая демографические; дата постановки диагноза, операции, химиотерапии, рецидива, прогрессирования и смерти; визуализация; токсичность; и элементы патологических данных, связанные с образцами, также собираются и анализируются.
|
Коррелятивные исследования
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Экспрессия генов
Временное ограничение: Базовый уровень
|
Алгоритм анализа значимости микрочипов (SAM) будет использоваться для анализа дифференциальной экспрессии.
Анализ путей и интеграция данных будут выполняться для дифференциально экспрессируемых генов с использованием анализа путей изобретательности.
Дифференциально экспрессируемые гены и мишени микроРНК, а также гены в значительных аберрациях ДНК будут картированы и интегрированы для идентификации обогащенных путей и сетей.
|
Базовый уровень
|
|
Частота аберраций номера копии
Временное ограничение: Базовый уровень
|
Данные массива будут импортированы в анализатор числа копий (CNAG) для картографических массивов GeneChip для выявления аберраций числа копий в образцах опухоли.
Чтобы выявить регионы с частыми CNA среди различных групп образцов пациентов, мы будем использовать инструмент «Геномная идентификация значимых мишеней при раке» (GISTIC).
|
Базовый уровень
|
|
Частота мутаций, возникающих с клинически значимой частотой
Временное ограничение: Базовый уровень
|
Базовый уровень
|
Соавторы и исследователи
Спонсор
Соавторы
Следователи
- Главный следователь: Ching C Lau, Children's Oncology Group
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
Первичное завершение (Действительный)
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (Оценивать)
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- AOST10B5 (Другой идентификатор: CTEP)
- U10CA098543 (Грант/контракт NIH США)
- NCI-2011-02840 (Идентификатор реестра: CTRP (Clinical Trial Reporting Program))
- CDR0000683276
- COG-AOST10B5
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .