DNA-biomarkers in weefselmonsters van patiënten met osteosarcoom
Therapeutisch toepasbaar onderzoek om effectieve behandelingen (TARGET) voor osteosarcoom te genereren
Studie Overzicht
Toestand
Interventie / Behandeling
Gedetailleerde beschrijving
DOELSTELLINGEN:
I. Uitgebreide detectie van genomische, epigenomische en transcriptoomafwijkingen in weefselmonsters van patiënten met osteosarcoom die een rol kunnen spelen bij chemoresistentie en metastase met behulp van genoombrede technologieën met hoge resolutie.
II. Terugkerende genetische mutaties identificeren die betrokken zijn bij de pathogenese van osteosarcoom, vooral voor de ontwikkeling van chemoresistentie en metastatische tumoren.
III. Het identificeren en valideren van deze biomarkers voor nieuwe therapeutische doelen voor patiënten met osteosarcoom, vooral degenen met gemetastaseerde ziekte en van wie de tumoren resistent zijn tegen standaardchemotherapie.
OVERZICHT: Dit is een multicenter studie. Gearchiveerd tumorweefsel en DNA-specimens uit perifeer bloed worden geanalyseerd op DNA-kopienummerprofilering, genexpressieprofilering, DNA-methylatieprofilering, microRNA-profilering en genomische resequencing. Klinische gegevens inclusief demografische gegevens; datum van diagnose, operatie, chemotherapie, recidief, progressie en overlijden; in beeld brengen; toxiciteit; en pathologische gegevenselementen die verband houden met de monsters worden ook verzameld en geanalyseerd.
Studietype
Inschrijving (Werkelijk)
Contacten en locaties
Studie Locaties
-
-
Pennsylvania
-
Philadelphia, Pennsylvania, Verenigde Staten, 19104
- Childrens Oncology Group
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
- Kind
- Volwassen
- Oudere volwassene
Accepteert gezonde vrijwilligers
Geslachten die in aanmerking komen voor studie
Bemonsteringsmethode
Studie Bevolking
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- Diagnose van osteosarcoom
Vers ingevroren monsters verzameld op het moment van diagnose met matchedblood DNA (bij voorkeur) van patiënten die deelnamen aan de volgende osteosarcoombiologieprotocollen:
- COG-P9851
- COG-AOST06B1
- Beschikbare gegevens over klinische resultaten
- Niet gespecificeerd
- Niet gespecificeerd
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
- Observatiemodellen: Case-Alleen
- Tijdsperspectieven: Retrospectief
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
Ancillary-Correlative (bemonstering en analyse van biomarkers)
Gearchiveerd tumorweefsel en DNA-specimens uit perifeer bloed worden geanalyseerd op DNA-kopienummerprofilering, genexpressieprofilering, DNA-methylatieprofilering, microRNA-profilering en genomische resequencing.
Klinische gegevens inclusief demografische gegevens; datum van diagnose, operatie, chemotherapie, recidief, progressie en overlijden; in beeld brengen; toxiciteit; en pathologische gegevenselementen die verband houden met de monsters worden ook verzameld en geanalyseerd.
|
Correlatieve studies
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Expressie van genen
Tijdsspanne: Basislijn
|
Het algoritme Significance Analysis of Microarrays (SAM) zal worden gebruikt voor analyse van differentiële expressie.
Pathway-analyse en data-integratie zullen worden uitgevoerd op de differentieel tot expressie gebrachte genen met behulp van Ingenuity Pathway Analysis.
Differentieel tot expressie gebrachte genen en miRNA-doelen, evenals genen in de significante DNA-afwijkingen, zullen in kaart worden gebracht en geïntegreerd om de verrijkte routes en netwerken te identificeren.
|
Basislijn
|
|
Incidentie van afwijkingen in het aantal kopieën
Tijdsspanne: Basislijn
|
De arraygegevens worden geïmporteerd in Copy Number Analyzer (CNAG) voor GeneChip-mappingarrays om aberraties in het aantal kopieën in de tumormonsters te identificeren.
Om regio's met frequente CNA te identificeren tussen verschillende groepen patiëntenmonsters, zullen we de tool Genomic Identification of Significant Targets in Cancer (GISTIC) gebruiken.
|
Basislijn
|
|
Incidentie van mutaties die optreden met een klinisch significante frequentie
Tijdsspanne: Basislijn
|
Basislijn
|
Medewerkers en onderzoekers
Sponsor
Medewerkers
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Ching C Lau, Children's Oncology Group
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
Primaire voltooiing (Werkelijk)
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Schatting)
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- AOST10B5 (Andere identificatie: CTEP)
- U10CA098543 (Subsidie/contract van de Amerikaanse NIH)
- NCI-2011-02840 (Register-ID: CTRP (Clinical Trial Reporting Program))
- CDR0000683276
- COG-AOST10B5
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .