DNA-biomarkører i vevsprøver fra pasienter med osteosarkom
Terapeutisk anvendelig forskning for å generere effektive behandlinger (TARGET) for osteosarkom
Studieoversikt
Status
Intervensjon / Behandling
Detaljert beskrivelse
MÅL:
I. Å fullstendig oppdage genomiske, epigenomiske og transkriptomiske aberrasjoner i vevsprøver fra pasienter med osteosarkom som kan spille en rolle i kjemoresistens og metastaser ved bruk av høyoppløselige genomomfattende teknologier.
II. Å identifisere tilbakevendende genetiske mutasjoner involvert i patogenesen av osteosarkom, spesielt for utvikling av kjemoresistens og metastatiske svulster.
III. Å identifisere og validere disse biomarkørene for nye terapeutiske mål for pasienter med osteosarkom, spesielt de med metastatisk sykdom og hvis svulster er resistente mot standard kjemoterapi.
OVERSIKT: Dette er en multisenterstudie. Arkivert tumorvev og DNA-prøver fra perifert blod blir analysert for DNA-kopinummerprofilering, genekspresjonsprofilering, DNA-metyleringsprofilering, mikroRNA-profilering og genomisk resekvensering. Kliniske data inkludert demografi; dato for diagnose, operasjon, kjemoterapi, tilbakefall, progresjon og død; bildebehandling; toksisitet; og patologiske dataelementer knyttet til prøvene blir også samlet inn og analysert.
Studietype
Registrering (Faktiske)
Kontakter og plasseringer
Studiesteder
-
-
Pennsylvania
-
Philadelphia, Pennsylvania, Forente stater, 19104
- Childrens Oncology Group
-
-
Deltakelseskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
- Barn
- Voksen
- Eldre voksen
Tar imot friske frivillige
Kjønn som er kvalifisert for studier
Prøvetakingsmetode
Studiepopulasjon
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
- Diagnose av osteosarkom
Ferskfrosne prøver samlet på tidspunktet for diagnose med matchet blod-DNA (foretrukket) fra pasienter som er registrert på følgende osteosarkombiologiske protokoller:
- COG-P9851
- COG-AOST06B1
- Tilgjengelige kliniske utfallsdata
- Ikke spesifisert
- Ikke spesifisert
Studieplan
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
- Observasjonsmodeller: Bare etui
- Tidsperspektiver: Retrospektiv
Kohorter og intervensjoner
Gruppe / Kohort |
Intervensjon / Behandling |
|---|---|
|
Hjelpe-korrelativ (biomarkørprøvetaking og analyse)
Arkivert tumorvev og DNA-prøver fra perifert blod blir analysert for DNA-kopinummerprofilering, genekspresjonsprofilering, DNA-metyleringsprofilering, mikroRNA-profilering og genomisk resekvensering.
Kliniske data inkludert demografi; dato for diagnose, operasjon, kjemoterapi, tilbakefall, progresjon og død; bildebehandling; toksisitet; og patologiske dataelementer knyttet til prøvene blir også samlet inn og analysert.
|
Korrelative studier
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Uttrykk av gener
Tidsramme: Grunnlinje
|
Significance Analysis of Microarrays (SAM)-algoritmen vil bli brukt for analyse av differensielt uttrykk.
Baneanalyse og dataintegrasjon vil bli utført på de differensielt uttrykte genene ved hjelp av Ingenuity Pathway Analysis.
Differensielt uttrykte gener og miRNA-mål så vel som gener i de betydelige DNA-avvikene vil bli kartlagt og integrert for å identifisere de berikede veiene og nettverkene.
|
Grunnlinje
|
|
Forekomst av kopinummeravvik
Tidsramme: Grunnlinje
|
Matrisedataene vil bli importert til Copy Number Analyzer (CNAG) for GeneChip-kartleggingsmatriser for å identifisere kopinummeravvik i tumorprøvene.
For å identifisere regioner med hyppig CNA blant forskjellige grupper av pasientprøver, vil vi bruke verktøyet Genomic Identification of Significant Targets in Cancer (GISTIC).
|
Grunnlinje
|
|
Forekomst av mutasjoner som oppstår med en klinisk signifikant frekvens
Tidsramme: Grunnlinje
|
Grunnlinje
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Sponsor
Samarbeidspartnere
Etterforskere
- Hovedetterforsker: Ching C Lau, Children's Oncology Group
Studierekorddatoer
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
Primær fullføring (Faktiske)
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først lagt ut (Anslag)
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Sist bekreftet
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- AOST10B5 (Annen identifikator: CTEP)
- U10CA098543 (U.S. NIH-stipend/kontrakt)
- NCI-2011-02840 (Registeridentifikator: CTRP (Clinical Trial Reporting Program))
- CDR0000683276
- COG-AOST10B5
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .