Biomarcadores de ADN en muestras de tejido de pacientes con osteosarcoma
Investigación Terapéuticamente Aplicable para Generar Tratamientos Efectivos (TARGET) para el Osteosarcoma
Descripción general del estudio
Estado
Intervención / Tratamiento
Descripción detallada
OBJETIVOS:
I. Detectar de manera integral aberraciones genómicas, epigenómicas y transcriptómicas en muestras de tejido de pacientes con osteosarcoma que pueden desempeñar un papel en la quimiorresistencia y la metástasis utilizando tecnologías de genoma completo de alta resolución.
II. Identificar mutaciones genéticas recurrentes implicadas en la patogenia del osteosarcoma, especialmente para el desarrollo de tumores quimiorresistentes y metastásicos.
tercero Identificar y validar estos biomarcadores para nuevas dianas terapéuticas para pacientes con osteosarcoma, especialmente aquellos con enfermedad metastásica y cuyos tumores son resistentes a la quimioterapia estándar.
ESQUEMA: Este es un estudio multicéntrico. Los especímenes archivados de tejido tumoral y ADN de sangre periférica se analizan para determinar el perfil del número de copias de ADN, el perfil de expresión génica, el perfil de metilación del ADN, el perfil de microARN y la resecuenciación genómica. Datos clínicos, incluidos datos demográficos; fecha de diagnóstico, cirugía, quimioterapia, recurrencia, progresión y muerte; formación de imágenes; toxicidad; y los elementos de datos patológicos asociados con las muestras también se recopilan y analizan.
Tipo de estudio
Inscripción (Actual)
Contactos y Ubicaciones
Ubicaciones de estudio
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Pennsylvania
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Philadelphia, Pennsylvania, Estados Unidos, 19104
- Childrens Oncology Group
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Criterios de participación
Criterio de elegibilidad
Edades elegibles para estudiar
- Niño
- Adulto
- Adulto Mayor
Acepta Voluntarios Saludables
Géneros elegibles para el estudio
Método de muestreo
Población de estudio
Descripción
Criterios de inclusión:
- Diagnóstico de osteosarcoma
Muestras frescas congeladas recolectadas en el momento del diagnóstico con ADN de sangre compatible (preferido) de pacientes inscritos en los siguientes protocolos biológicos de osteosarcoma:
- COG-P9851
- COG-AOST06B1
- Datos de resultados clínicos disponibles
- No especificado
- No especificado
Plan de estudios
¿Cómo está diseñado el estudio?
Detalles de diseño
- Modelos observacionales: Solo caso
- Perspectivas temporales: Retrospectivo
Cohortes e Intervenciones
Grupo / Cohorte |
Intervención / Tratamiento |
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Auxiliar-Correlativo (muestreo y análisis de biomarcadores)
Los especímenes archivados de tejido tumoral y ADN de sangre periférica se analizan para determinar el perfil del número de copias de ADN, el perfil de expresión génica, el perfil de metilación del ADN, el perfil de microARN y la resecuenciación genómica.
Datos clínicos, incluidos datos demográficos; fecha de diagnóstico, cirugía, quimioterapia, recurrencia, progresión y muerte; formación de imágenes; toxicidad; y los elementos de datos patológicos asociados con las muestras también se recopilan y analizan.
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Estudios correlativos
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¿Qué mide el estudio?
Medidas de resultado primarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
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Expresión de genes
Periodo de tiempo: Base
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El algoritmo de Análisis de Significación de Microarrays (SAM) se utilizará para el análisis de la expresión diferencial.
El análisis de vías y la integración de datos se realizarán en los genes expresados diferencialmente mediante el análisis de vías Ingenuity.
Los genes expresados diferencialmente y los objetivos de miARN, así como los genes en las aberraciones de ADN significativas, se mapearán e integrarán para identificar las vías y redes enriquecidas.
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Base
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Incidencia de aberraciones en el número de copias
Periodo de tiempo: Base
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Los datos de la matriz se importarán al Analizador de número de copias (CNAG) para que las matrices de mapeo de GeneChip identifiquen aberraciones en el número de copias en las muestras de tumores.
Para identificar regiones con CNA frecuente entre diferentes grupos de muestras de pacientes, utilizaremos la herramienta Genomic Identification of Significant Targets in Cancer (GISTIC) .
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Base
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Incidencia de mutaciones que ocurren con una frecuencia clínicamente significativa
Periodo de tiempo: Base
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Base
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Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Colaboradores
Investigadores
- Investigador principal: Ching C Lau, Children's Oncology Group
Fechas de registro del estudio
Fechas importantes del estudio
Inicio del estudio (Actual)
Finalización primaria (Actual)
Fechas de registro del estudio
Enviado por primera vez
Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad
Publicado por primera vez (Estimar)
Actualizaciones de registros de estudio
Última actualización publicada (Actual)
Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad
Última verificación
Más información
Términos relacionados con este estudio
Términos MeSH relevantes adicionales
Otros números de identificación del estudio
- AOST10B5 (Otro identificador: CTEP)
- U10CA098543 (Subvención/contrato del NIH de EE. UU.)
- NCI-2011-02840 (Identificador de registro: CTRP (Clinical Trial Reporting Program))
- CDR0000683276
- COG-AOST10B5
Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio
Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.
Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.
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