Diagnostic Gene Xpert de la tuberculose à l'aide d'aspirations trachéales provenant de patients en unité de soins intensifs (USI)

Contexte La tuberculose (TB) est une grave urgence de santé publique mondiale et il existe un grand besoin d'amélioration des outils de diagnostic actuels et d'évaluation de technologies nouvelles et novatrices pour le diagnostic rapide de la tuberculose. La méthode de test la plus courante pour la tuberculose est l'examen microscopique des frottis d'expectoration, qui est resté largement inchangé dans sa sophistication et sa sensibilité. L'examen microscopique des frottis détecte environ 50 % de tous les cas de tuberculose active et n'est pas capable d'identifier la résistance aux médicaments. De plus, même si la culture est plus précise, les résultats ne sont disponibles que dans plusieurs semaines. Le traitement empirique des patients contre la tuberculose expose les patients aux effets secondaires toxiques des médicaments et, s'il n'y a pas de réponse au traitement, soulève la question de la tuberculose multirésistante. Ces considérations s'appliquent à la prise de décision clinique dans l'unité de soins intensifs où la tuberculose n'est pas rare. Un diagnostic de TB dans ce contexte a des implications importantes pour les interactions médicamenteuses, la voie d'administration et la toxicité des médicaments.

Le test MTB/RIF du système Gene Xpert®, un test moléculaire à la demande pour la détection simultanée de la résistance à Mycobacterium tuberculosis (M.tb) et à la rifampicine (RIF), a récemment été lancé. C'est le seul système qui combine la préparation d'échantillons embarquée avec la PCR en temps réel [1]. Helb et ses collègues ont développé et réalisé la première analyse du test MTB/RIF du Cepheid Gene Xpert System. Ils ont évalué l'utilité diagnostique du système à l'aide d'échantillons d'expectorations et ont montré que le système était très sensible et simple à utiliser [2]. Un article récent (NEJM, 2010, sous presse) portant sur près de 2 000 patients a révélé que Xpert avait une sensibilité de près de 90 % dans la tuberculose à frottis négatif. Cependant, les performances du test lors de l'utilisation d'aspirations trachéales sont inconnues. Il est également difficile de savoir si le test aura un impact dans l'unité de soins intensifs où la décision de traiter est souvent prise cliniquement et un traitement empirique est initié. Pour répondre à ces questions, nous visons à obtenir des aspirations trachéales d'environ 120 patients sous ventilation mécanique suspectés de tuberculose de l'unité de soins intensifs de l'hôpital Groote Schuur. Des tests seront effectués au laboratoire de l'unité d'infection et d'immunité pulmonaire (hôpital Groote Schuur, Cape Town) pour évaluer l'utilité diagnostique du test Xpert® MTB/RIF dans ce groupe de patients. La période d'étude prévue sera de 12 mois.