Mise en œuvre clinique du statut de porteur à l'aide du séquençage de nouvelle génération (NextGen)

Projet 1-Intervention clinique et résultats Objectif 1 : Mener un essai contrôlé randomisé (ECR) avec jusqu'à 400 sujets (femmes et partenaires) à la recherche d'un test de portage avant la conception pour évaluer l'impact du programme à l'aide du séquençage du génome entier (WGS).

Objectif 2 : Développer des processus pour transmettre les informations du WGS directement dans le dossier médical électronique du patient, et établir des stratégies de reporting innovantes et informatives pour les cliniciens et les couples agissant sur la base de ces informations.

Objectif 3 : Mesurer l'intégration des informations de séquence dans les soins cliniques pour le statut de porteur et les résultats secondaires, notamment :

1. Résultats rapportés par les patients (PRO) sur l'impact sur la qualité de vie, la satisfaction à l'égard des soins, la rapidité de notification et l'utilisation des informations génomiques.
2. Résultats du processus tels que la rapidité, le nombre de résultats à signaler et le temps d'interprétation.

Projet 2 - Technologie WGS, informatique et comité de retour des résultats (RORC)

Objectif 1 : Générer une séquence du génome entier et interpréter des variants sur des échantillons randomisés de la cohorte de dépistage des porteurs préconceptionnels Kaiser Permanente Northwest (KPNW).

1. Pour effectuer le séquençage du génome entier, l'assemblage et la détection de variantes pour chaque échantillon.
2. Fournir des données sur les variantes de chaque échantillon avec une annotation et un classement de la signification clinique.
3. Valider les données à l'aide d'une plate-forme orthogonale pour les résultats pertinents au statut de porteur et les résultats secondaires exploitables.

Objectif 2 : Développer et mettre en œuvre un comité de retour des résultats (RORC) qui intègre des preuves pour évaluer les critères de déclaration du statut de porteur pour la prise de décision en matière de procréation et les résultats secondaires.

Projet 3 - Implications éthiques et psychosociales

Objectif 1 : Évaluer les perspectives des patients et des cliniques sur les besoins d'information, la satisfaction, les connaissances et la prise de décision concernant le choix d'obtenir des résultats de statut de porteur du WGS dans quatre catégories de maladies génétiques.

Objectif 2 : Évaluer, du point de vue des patients et des cliniciens, les conséquences éthiques, psychosociales et comportementales immédiates et en aval du dépistage élargi des porteurs à l'aide du WGS.

Objectif 3 : Évaluer l'impact du test de portage élargi à l'aide du WGS sur l'utilisation ultérieure des soins de santé et comparer le coût de la prestation du WGS aux soins habituels.