Interaction du polymorphisme pour prédire l'efficacité du bevacizumab (BEVAGENE)

Patientes atteintes d'un cancer du sein métastatique (CSM) de huit divisions italiennes d'oncologie médicale, avec un CSM HER2 négatif confirmé histologiquement, traitées avec un traitement de première intention comprenant du bevacizumab 10 mg/m2 i.v. aux jours 1 et 15 en association avec le paclitaxel de première intention 90 mg/m2 i.v. les jours 1, 8 et 15, toutes les 4 semaines, seront recrutés pour la présente étude pharmacogénétique. Les patients MBC traités par une chimiothérapie de première intention comprenant du paclitaxel sans bevacizumab seront également inclus dans le groupe témoin.

Les sites de la maladie métastatique seront réévalués radiologiquement selon les critères RECIST (Response Evaluation Criteria in Solid Tumors) 1.1, chez les patients présentant une maladie mesurable. Chez les patients sans lésions mesurables, la progression de la maladie sera définie lorsque de nouvelles lésions sont apparues ou lorsque des lésions existantes ont évolué. De même, dans le cas de lésions non mesurables, une détérioration de l'état clinique non due à la toxicité du traitement sera définie comme une progression de la maladie.

La survie sans progression (PFS) sera définie comme la période de temps entre le début du traitement et la première observation de la progression de la maladie comme décrit ci-dessus, ou du décès quelle qu'en soit la cause. Tous les patients seront évalués pour la réponse, la SSP et la survie globale. Chaque patient entrant dans l'étude signera le consentement éclairé. Le protocole a été approuvé par le comité d'éthique de l'Azienda Ospedaliera-Universitaria Pisana, Pise, Italie, (CESM 3077/2010).

Analyses de génotypage Des échantillons de sang (3 ml) seront prélevés dans des tubes d'acide éthylènediaminetétraacétique (EDTA) et conservés à -80°C. Les gènes et polymorphismes impliqués dans la voie de l'angiogenèse et déjà suggérés comme prédicteurs de la réponse au bevacizumab seront choisis pour les présentes analyses. L'extraction de l'ADN germinal sera effectuée à l'aide du kit QIAamp DNA Blood Mini (Qiagen, Valencia, Californie, États-Unis). La discrimination allélique des gènes sera effectuée à l'aide d'un instrument ABI PRISM 7900 SDS (Applied Biosystems, Carlsbad, Californie, États-Unis) et avec des tests de génotypage TaqMan® SNP validés (Applied Biosystems). Les réactions PCR seront réalisées selon le protocole du fabricant. Le génotypage ne sera pas effectué tant qu'un nombre adéquat d'événements (> 80 % sur la population de l'étude) n'aura pas été signalé en termes de SSP.

Analyse statistique Le premier objectif de cette analyse rétrospective sera d'évaluer le rôle éventuel de ces polymorphismes géniques étudiés pour prédire la réponse au bevacizumab en termes de SSP. Les critères d'évaluation secondaires seront les corrélations avec la survie globale (SG) et le taux de réponse. Tous les polymorphismes seront analysés pour la déviation de l'équilibre de Hardy-Weinberg (HWE) au moyen de la comparaison entre les distributions alléliques observées avec celles attendues du HWE par le test χ2. Toute corrélation entre les polymorphismes des gènes et le taux de réponse sera analysée par le test exact de Fisher bilatéral. L'association entre chaque polymorphisme individuel et les caractéristiques clinico-pathologiques les plus pertinentes avec la SSP sera testée à l'aide d'un modèle de risques proportionnels de Cox. La méthodologie Multifactor Dimensionality Reduction (MDR) sera appliquée (en utilisant la version 2.0 beta 6 du logiciel MDR disponible sur http://sourceforge.net/projects/mdr/) pour étudier le rôle d'une interaction entre les polymorphismes géniques dans l'identification des biomarqueurs du paclitaxel plus la réponse au bevacizumab.

La combinaison de génotypes avec le bénéfice de SSP le plus élevé corrélé à une amélioration de la SG sera choisie pour des analyses ultérieures. La différence de SSP entre les profils génétiques favorables et les profils génétiques défavorables sera évaluée avec le test du log-rank et la méthode de Kaplan-Meier pour évaluer les courbes de survie. Un modèle à risques proportionnels de Cox, avec les profils génétiques possibles et les caractéristiques cliniques et pathologiques des patients individuellement corrélés à la SSP, sera utilisé pour calculer le risque relatif ajusté (HR) et l'intervalle de confiance à 95 % (IC à 95 %). Une valeur P <0,05 sera acceptée comme statistiquement significative. Les analyses des risques proportionnels de Kaplan-Meier et Cox seront effectuées à l'aide de la version SPSS 17.0 (SPSS, Chicago, IL).