Interakcja polimorfizmu w celu przewidywania skuteczności bewacyzumabu (BEVAGENE)

Chorzy na raka piersi z przerzutami (MBC) z ośmiu włoskich oddziałów Onkologii Klinicznej, z histologicznie potwierdzonym HER2-ujemnym MBC, leczeni terapią pierwszego rzutu z bewacyzumabem 10 mg/m2 i.v. w dniach 1 i 15 w skojarzeniu z paklitakselem pierwszego rzutu 90 mg/m2 i.v. w dniach 1, 8 i 15, co 4 tygodnie, zostaną włączeni do niniejszego badania farmakogenetycznego. Pacjenci z MBC leczeni chemioterapią pierwszego rzutu obejmującą paklitaksel bez bewacyzumabu również zostaną włączeni jako grupa kontrolna.

Miejsca przerzutów zostaną poddane ponownej ocenie radiologicznej zgodnie z kryteriami oceny odpowiedzi w guzach litych (RECIST) 1.1 u pacjentów z mierzalną chorobą. U pacjentów bez mierzalnych zmian chorobowych progresja choroby zostanie określona, ​​gdy pojawią się nowe zmiany lub gdy ewoluują istniejące zmiany. Podobnie w przypadku zmian niemierzalnych, pogorszenie stanu klinicznego niespowodowane toksycznością leczenia będzie określane jako progresja choroby.

Przeżycie wolne od progresji (PFS) będzie definiowane jako okres czasu od rozpoczęcia leczenia do pierwszej obserwacji progresji choroby, jak opisano powyżej, lub zgonu z dowolnej przyczyny. Wszyscy pacjenci zostaną poddani ocenie pod kątem odpowiedzi, PFS i przeżycia całkowitego. Każdy pacjent zgłaszający się do badania podpisze świadomą zgodę. Protokół został zatwierdzony przez komisję etyczną Azienda Ospedaliera-Universitaria Pisana, Pisa, Włochy, (CESM 3077/2010).

Analizy genotypowe Próbki krwi (3 ml) zostaną pobrane do probówek z kwasem etylenodiaminotetraoctowym (EDTA) i przechowywane w temperaturze -80°C. Do niniejszych analiz zostaną wybrane geny i polimorfizmy biorące udział w szlaku angiogenezy i sugerowane już jako predyktory odpowiedzi na bewacyzumab. Ekstrakcja DNA linii zarodkowej zostanie przeprowadzona przy użyciu zestawu QIAamp DNA Blood Mini Kit (Qiagen, Valencia, Kalifornia, USA). Alleliczna dyskryminacja genów zostanie przeprowadzona przy użyciu instrumentu ABI PRISM 7900 SDS (Applied Biosystems, Carlsbad, Kalifornia, USA) oraz za pomocą zwalidowanych testów genotypowania TaqMan® SNP (Applied Biosystems). Reakcje PCR będą przeprowadzane zgodnie z protokołem producenta. Genotypowanie nie zostanie przeprowadzone, dopóki nie zostanie zgłoszona odpowiednia liczba zdarzeń (>80% w badanej populacji) pod względem PFS.

Analiza statystyczna Pierwszym celem tej retrospektywnej analizy będzie ocena możliwej roli tych badanych polimorfizmów genów w przewidywaniu odpowiedzi na bewacyzumab pod względem PFS. Drugorzędowymi punktami końcowymi będą korelacje z całkowitym przeżyciem (OS) i odsetkiem odpowiedzi. Wszystkie polimorfizmy zostaną przeanalizowane pod kątem odchyleń od równowagi Hardy'ego-Weinberga (HWE) poprzez porównanie obserwowanych rozkładów alleli z oczekiwanymi z HWE w teście χ2. Każda korelacja między polimorfizmami genów a odsetkiem odpowiedzi zostanie przeanalizowana za pomocą dwustronnego dokładnego testu Fishera. Związek między każdym pojedynczym polimorfizmem a najistotniejszymi cechami kliniczno-patologicznymi PFS zostanie przetestowany przy użyciu modelu proporcjonalnego ryzyka Coxa. Zastosowana zostanie metodologia Multifactor Dimensionality Reduction (MDR) (przy użyciu oprogramowania MDR w wersji 2.0 beta 6 dostępnej na stronie http://sourceforge.net/projects/mdr/) w celu zbadania roli interakcji między polimorfizmami genów w identyfikacji biomarkerów paklitakselu plus odpowiedź na bewacyzumab.

Do dalszych analiz zostanie wybrana kombinacja genotypów z najwyższą korzyścią w zakresie PFS skorelowaną z poprawą OS. Różnica w PFS między korzystnymi profilami genetycznymi a niekorzystnymi profilami genetycznymi zostanie oceniona za pomocą testu log-rank i metody Kaplana-Meiera do oceny krzywych przeżycia. Do obliczenia skorygowanego współczynnika ryzyka (HR) i 95% przedziału ufności (95% CI) zostanie wykorzystany model proporcjonalnego ryzyka Coxa, z możliwymi profilami genetycznymi oraz kliniczną i patologiczną charakterystyką pacjenta indywidualnie skorelowaną z PFS. Wartość P <0,05 zostanie przyjęta jako istotna statystycznie. Analizy proporcjonalnego hazardu Kaplana-Meiera i Coxa zostaną przeprowadzone przy użyciu oprogramowania SPSS w wersji 17.0 (SPSS, Chicago, IL).