Polymorfi-interaktion for at forudsige Bevacizumabs effekt (BEVAGENE)

Metastaserende brystkræftpatienter (MBC) fra otte italienske afdelinger af medicinsk onkologi, med histologisk bekræftet HER2-negativ MBC, behandlet med en førstelinjebehandling inklusive bevacizumab 10 mg/m2 i.v. på dag 1 og 15 kombineret med førstelinjes paclitaxel 90 mg/m2 i.v. på dag 1, 8 og 15, hver 4. uge, vil blive tilmeldt det nuværende farmakogenetiske studie. MBC-patienter behandlet med en førstelinje-kemoterapi inklusive paclitaxel uden bevacizumab vil også blive optaget som kontrolgruppe.

Steder for metastatisk sygdom vil blive re-evalueret radiologisk i henhold til Response Evaluation Criteria in Solid Tumors (RECIST) kriterier 1.1 hos patienter med målbar sygdom. Hos patienter uden målbare læsioner vil sygdomsprogression blive defineret, når nye læsioner dukkede op, eller når eksisterende læsioner udviklede sig. Ligeledes vil forringelse af den kliniske tilstand, der ikke skyldes behandlingstoksicitet, i tilfælde af ikke-målbare læsioner blive defineret som progression af sygdom.

Progressionsfri overlevelse (PFS) vil blive defineret som tidsrummet fra begyndelsen af ​​behandlingen til den første observation af sygdomsprogression som beskrevet ovenfor, eller død af enhver årsag. Alle patienter vil blive vurderet for respons, PFS og samlet overlevelse. Hver patient, der deltager i undersøgelsen, vil underskrive det informerede samtykke. Protokollen er blevet godkendt af etisk udvalg i Azienda Ospedaliera-Universitaria Pisana, Pisa, Italien, (CESM 3077/2010).

Genotypeanalyser Blodprøver (3 ml) vil blive opsamlet i ethylendiamintetraeddikesyre (EDTA) rør og opbevaret ved -80°C. Gener og polymorfier involveret i angiogenese-vejen og allerede foreslået som prædiktorer for bevacizumab-respons, vil blive valgt til de nuværende analyser. Germline DNA-ekstraktion vil blive udført ved hjælp af QIAamp DNA Blood Mini Kit (Qiagen, Valencia, Californien, USA). Allelsk diskrimination af gener vil blive udført ved hjælp af et ABI PRISM 7900 SDS-instrument (Applied Biosystems, Carlsbad, Californien, USA) og med validerede TaqMan® SNP-genotypebestemmelsesassays (Applied Biosystems). PCR-reaktioner vil blive udført i henhold til producentens protokol. Genotyping vil ikke blive udført, før et tilstrækkeligt antal hændelser (>80 % af undersøgelsespopulationen) vil blive rapporteret i form af PFS.

Statistisk analyse Det første formål med denne retrospektive analyse vil være at evaluere den mulige rolle af disse undersøgte genpolymorfismer til at forudsige bevacizumab-responset i form af PFS. De sekundære endepunkter vil være korrelationerne med samlet overlevelse (OS) og responsrate. Alle polymorfier vil blive analyseret for afvigelse fra Hardy-Weinberg-ligevægten (HWE) ved hjælp af sammenligning mellem observerede allelfordelinger med dem, der forventes fra HWE ved χ2-test. Enhver sammenhæng mellem genpolymorfismer og responsrate vil blive analyseret ved den tosidede Fisher's Exact Test. Sammenhængen mellem hver enkelt polymorfi og de mest relevante klinisk-patologiske karakteristika med PFS vil blive testet ved hjælp af en Cox proportional hazards model. Multifactor Dimensionality Reduction (MDR)-metoden vil blive anvendt (ved at bruge version 2.0 beta 6 af MDR-software tilgængelig på http://sourceforge.net/projects/mdr/) for at undersøge rollen af ​​en interaktion mellem genpolymorfismer i identifikation af biomarkører for paclitaxel plus bevacizumab-respons.

Genotypekombinationen med den højeste PFS-fordel korreleret med en OS-forbedring vil blive valgt til yderligere analyser. Forskellen i PFS mellem gunstige genetiske profiler og de ugunstige genetiske profiler vil blive vurderet med log-rank test og Kaplan-Meier metoden til at evaluere overlevelseskurver. En Cox proportional hazards model, med de mulige genetiske profiler og de kliniske og patologiske patientkarakteristika individuelt korreleret med PFS, vil blive brugt til at beregne det justerede hazards ratio (HR) og 95% konfidensintervallet (95% CI). En P-værdi på <0,05 vil blive accepteret som statistisk signifikant. Kaplan-Meier og Cox proportionelle fareanalyser vil blive udført ved hjælp af SPSS version 17.0 (SPSS, Chicago, IL).