Interakce polymorfismu k předpovědi účinnosti bevacizumabu (BEVAGENE)

Pacienti s metastatickým karcinomem prsu (MBC) z osmi italských divizí lékařské onkologie, s histologicky potvrzeným HER2-negativním MBC, léčeni terapií první volby zahrnující bevacizumab 10 mg/m2 i.v. ve dnech 1 a 15 v kombinaci s paclitaxelem první linie 90 mg/m2 i.v. ve dnech 1, 8 a 15, každé 4 týdny, budou zařazeni do této farmakogenetické studie. Jako kontrolní skupina budou zařazeni také pacienti s MBC léčení chemoterapií první linie včetně paklitaxelu bez bevacizumabu.

Místa metastatického onemocnění budou u pacientů s měřitelným onemocněním radiologicky přehodnocena podle kritérií RECIST (Response Evaluation Criteria in Solid Tumors) 1.1. U pacientů bez měřitelných lézí bude progrese onemocnění definována, když se objeví nové léze nebo když se existující léze vyvinou. Podobně v případě neměřitelných lézí bude zhoršení klinického stavu, které není způsobeno toxicitou léčby, definováno jako progrese onemocnění.

Přežití bez progrese (PFS) bude definováno jako časové období od začátku léčby do prvního pozorování progrese onemocnění, jak je popsáno výše, nebo úmrtí z jakékoli příčiny. U všech pacientů bude hodnocena odpověď, PFS a celkové přežití. Každý pacient vstupující do studie podepíše informovaný souhlas. Protokol byl schválen etickou komisí Azienda Ospedaliera-Universitaria Pisana, Pisa, Itálie (CESM 3077/2010).

Genotypizační analýzy Vzorky krve (3 ml) budou odebírány do zkumavek s kyselinou ethylendiamintetraoctovou (EDTA) a skladovány při -80 °C. Pro tyto analýzy budou vybrány geny a polymorfismy zapojené do dráhy angiogeneze a již navržené jako prediktory odpovědi na bevacizumab. Extrakce zárodečné DNA bude provedena pomocí sady QIAamp DNA Blood Mini Kit (Qiagen, Valencia, Kalifornie, USA). Alelická diskriminace genů bude provedena pomocí přístroje ABI PRISM 7900 SDS (Applied Biosystems, Carlsbad, Kalifornie, USA) a validovanými testy genotypizace TaqMan® SNP (Applied Biosystems). PCR reakce budou prováděny podle protokolu výrobce. Genotypizace nebude provedena, dokud nebude hlášen adekvátní počet příhod (>80 % na studované populaci) ve smyslu PFS.

Statistická analýza Prvním cílem této retrospektivní analýzy bude zhodnotit možnou roli těchto zkoumaných genových polymorfismů při predikci odpovědi na bevacizumab z hlediska PFS. Sekundárními cílovými body budou korelace s celkovým přežitím (OS) a mírou odpovědi. Všechny polymorfismy budou analyzovány na odchylku od Hardy-Weinbergovy rovnováhy (HWE) pomocí srovnání mezi pozorovanými alelickými distribucemi s distribucemi očekávanými od HWE pomocí χ2 testu. Jakákoli korelace mezi genovými polymorfismy a mírou odezvy bude analyzována oboustranným Fisherovým exaktním testem. Souvislost mezi každým jednotlivým polymorfismem a nejvýznamnějšími klinicko-patologickými charakteristikami s PFS bude testována pomocí Coxova modelu proporcionálních rizik. K prozkoumání role interakce mezi genovými polymorfismy při identifikaci biomarkerů paclitaxelu bude použita metodika Multifactor Dimensionality Reduction (MDR) (s použitím verze 2.0 beta 6 softwaru MDR dostupného na http://sourceforge.net/projects/mdr/). plus odpověď na bevacizumab.

Pro další analýzy bude vybrána kombinace genotypu s nejvyšším přínosem PFS korelujícím se zlepšením OS. Rozdíl v PFS mezi příznivými genetickými profily a nepříznivými genetickými profily bude hodnocen log-rank testem a Kaplan-Meierovou metodou pro hodnocení křivek přežití. Coxův model proporcionálních rizik s možnými genetickými profily a klinickými a patologickými charakteristikami pacienta individuálně korelovanými s PFS bude použit k výpočtu upraveného poměru rizik (HR) a 95% intervalu spolehlivosti (95% CI). Hodnota P <0,05 bude přijata jako statisticky významná. Kaplan-Meierova a Coxova proporcionální analýza rizik bude provedena pomocí SPSS verze 17.0 (SPSS, Chicago, IL).