Polymorfisme-interactie om de werkzaamheid van Bevacizumab te voorspellen (BEVAGENE)

Patiënten met gemetastaseerde borstkanker (MBC) van acht Italiaanse divisies van Medische Oncologie, met histologisch bevestigde HER2-negatieve MBC, behandeld met een eerstelijnsbehandeling waaronder bevacizumab 10 mg/m2 i.v. op dag 1 en 15 gecombineerd met eerstelijns paclitaxel 90 mg/m2 i.v. op dag 1, 8 en 15, om de 4 weken, worden ingeschreven voor de huidige farmacogenetische studie. MBC-patiënten die worden behandeld met een eerstelijns chemotherapie inclusief paclitaxel zonder bevacizumab zullen ook als controlegroep worden opgenomen.

Locaties van gemetastaseerde ziekte zullen radiologisch opnieuw worden beoordeeld volgens de Response Evaluation Criteria in Solid Tumors (RECIST) criteria 1.1, bij patiënten met meetbare ziekte. Bij patiënten zonder meetbare laesies wordt progressie van de ziekte bepaald wanneer nieuwe laesies verschijnen of bestaande laesies evolueren. Evenzo zal in het geval van niet-meetbare laesies een verslechtering van de klinische toestand die niet het gevolg is van behandelingstoxiciteit, worden gedefinieerd als progressie van de ziekte.

Progressievrije overleving (PFS) wordt gedefinieerd als de tijdsperiode vanaf het begin van de behandeling tot de eerste waarneming van ziekteprogressie zoals hierboven beschreven, of overlijden door welke oorzaak dan ook. Alle patiënten zullen worden beoordeeld op respons, PFS en algehele overleving. Elke patiënt die aan het onderzoek deelneemt, ondertekent de geïnformeerde toestemming. Het protocol is goedgekeurd door de ethische commissie van Azienda Ospedaliera-Universitaria Pisana, Pisa, Italië, (CESM 3077/2010).

Genotyperingsanalyses Bloedmonsters (3 ml) worden verzameld in ethyleendiaminetetraazijnzuur (EDTA)-buisjes en bewaard bij -80°C. Genen en polymorfismen die betrokken zijn bij de angiogenese-route en reeds gesuggereerd zijn als voorspellers van bevacizumab-respons, zullen voor de huidige analyses worden gekozen. Kiembaan-DNA-extractie zal worden uitgevoerd met behulp van de QIAamp DNA Blood Mini Kit (Qiagen, Valencia, Californië, VS). Allelische discriminatie van genen zal worden uitgevoerd met behulp van een ABI PRISM 7900 SDS-instrument (Applied Biosystems, Carlsbad, Californië, VS) en met gevalideerde TaqMan® SNP-genotyperingstesten (Applied Biosystems). PCR-reacties worden uitgevoerd volgens het protocol van de fabrikant. Genotypering zal pas worden uitgevoerd als een voldoende aantal gebeurtenissen (>80% van de onderzoekspopulatie) is gerapporteerd in termen van PFS.

Statistische analyse Het eerste doel van deze retrospectieve analyse is het evalueren van de mogelijke rol van deze onderzochte genpolymorfismen bij het voorspellen van de bevacizumab-respons in termen van PFS. De secundaire eindpunten zijn de correlaties met de totale overleving (OS) en het responspercentage. Alle polymorfismen zullen worden geanalyseerd op afwijking van het Hardy-Weinberg Equilibrium (HWE) door middel van vergelijking tussen waargenomen allelische distributies met die verwacht van de HWE door op χ2-test. Elke correlatie tussen genpolymorfismen en responspercentage zal worden geanalyseerd door de tweezijdige Fisher's Exact Test. De associatie tussen elk individueel polymorfisme en de meest relevante klinisch-pathologische kenmerken met PFS zal worden getest met behulp van een Cox-model voor proportionele risico's. De Multifactor Dimensionality Reduction (MDR)-methodiek zal worden toegepast (met behulp van versie 2.0 beta 6 van MDR-software beschikbaar op http://sourceforge.net/projects/mdr/) om de rol van een interactie tussen genpolymorfismen bij het identificeren van biomarkers van paclitaxel te onderzoeken. plus bevacizumab-respons.

De genotypecombinatie met het hoogste PFS-voordeel in verband met een OS-verbetering zal worden gekozen voor verdere analyses. Het verschil in PFS tussen gunstige genetische profielen en de ongunstige genetische profielen zal worden beoordeeld met de log-rank-test en de Kaplan-Meier-methode om overlevingscurven te evalueren. Een Cox proportioneel hazards-model, met de mogelijke genetische profielen en de klinische en pathologische patiëntkarakteristieken individueel gecorreleerd met de PFS, zal worden gebruikt om de aangepaste hazards ratio (HR) en het 95% betrouwbaarheidsinterval (95% BI) te berekenen. Een P-waarde van <0,05 wordt als statistisch significant geaccepteerd. De Kaplan-Meier en Cox proportionele gevarenanalyses zullen worden uitgevoerd met SPSS versie 17.0 (SPSS, Chicago, IL).