Взаимодействие полиморфизма для прогнозирования эффективности бевацизумаба (BEVAGENE)

Пациенты с метастатическим раком молочной железы (МРМЖ) из восьми итальянских отделений медицинской онкологии с гистологически подтвержденным HER2-отрицательным МРМЖ получали терапию первой линии, включающую бевацизумаб 10 мг/м2 внутривенно. в 1-й и 15-й дни в сочетании с паклитакселом первой линии 90 мг/м2 в/в. в дни 1, 8 и 15, каждые 4 недели, будут включаться в настоящее фармакогенетическое исследование. Пациенты с MBC, получавшие химиотерапию первой линии, включающую паклитаксел без бевацизумаба, также будут включены в качестве контрольной группы.

Участки метастатического заболевания будут повторно оценены радиологически в соответствии с критериями 1.1 Критериев оценки ответа при солидных опухолях (RECIST) у пациентов с измеримым заболеванием. У пациентов без измеримых поражений прогрессирование заболевания будет определяться при появлении новых поражений или развитии существующих поражений. Аналогичным образом, в случае не поддающихся измерению поражений ухудшение клинического состояния, не связанное с токсичностью лечения, будет определяться как прогрессирование заболевания.

Выживаемость без прогрессирования (ВБП) будет определяться как период времени от начала лечения до первого наблюдения прогрессирования заболевания, как описано выше, или смерти от любой причины. У всех пациентов будут оцениваться ответ, ВБП и общая выживаемость. Каждый пациент, участвующий в исследовании, подпишет информированное согласие. Протокол был одобрен комитетом по этике Azienda Ospedaliera-Universitaria Pisana, Пиза, Италия (CESM 3077/2010).

Анализ генотипа Образцы крови (3 мл) будут собираться в пробирки с этилендиаминтетрауксусной кислотой (ЭДТА) и храниться при температуре -80°C. Гены и полиморфизмы, участвующие в пути ангиогенеза и уже предложенные в качестве предикторов ответа на бевацизумаб, будут выбраны для настоящего анализа. Выделение ДНК зародышевой линии будет выполняться с использованием набора QIAamp DNA Blood Mini Kit (Qiagen, Валенсия, Калифорния, США). Аллельную дискриминацию генов будут проводить с использованием SDS-прибора ABI PRISM 7900 (Applied Biosystems, Карлсбад, Калифорния, США) и с помощью проверенных анализов генотипирования TaqMan® SNP (Applied Biosystems). Реакции ПЦР будут проводиться в соответствии с протоколом производителя. Генотипирование не будет проводиться до тех пор, пока не будет зарегистрировано достаточное количество событий (> 80% в исследуемой популяции) с точки зрения ВБП.

Статистический анализ Первой целью этого ретроспективного анализа будет оценка возможной роли этих исследованных полиморфизмов генов для прогнозирования ответа на бевацизумаб с точки зрения ВБП. Вторичными конечными точками будут корреляции с общей выживаемостью (ОВ) и частотой ответа. Все полиморфизмы будут проанализированы на отклонение от равновесия Харди-Вайнберга (HWE) посредством сравнения наблюдаемых аллельных распределений с ожидаемыми от HWE с помощью теста χ2. Любая корреляция между полиморфизмом генов и скоростью ответа будет проанализирована с помощью двустороннего точного теста Фишера. Связь между каждым отдельным полиморфизмом и наиболее значимыми клинико-патологическими характеристиками с ВБП будет проверена с использованием модели пропорциональных рисков Кокса. Будет применяться методология многофакторного уменьшения размерности (MDR) (с использованием версии 2.0 beta 6 программного обеспечения MDR, доступного на http://sourceforge.net/projects/mdr/) для исследования роли взаимодействия между полиморфизмами генов в идентификации биомаркеров паклитаксела. плюс ответ на бевацизумаб.

Комбинация генотипов с наибольшим преимуществом ВБП, коррелирующим с улучшением общей выживаемости, будет выбрана для дальнейшего анализа. Разница в ВБП между благоприятными генетическими профилями и неблагоприятными генетическими профилями будет оцениваться с помощью логарифмического рангового теста и метода Каплана-Мейера для оценки кривых выживаемости. Модель пропорциональных рисков Кокса с возможными генетическими профилями и клиническими и патологическими характеристиками пациента, индивидуально коррелированными с ВБП, будет использоваться для расчета скорректированного отношения рисков (HR) и 95% доверительного интервала (95% ДИ). Значение P <0,05 будет принято как статистически значимое. Анализ пропорциональных рисков Каплана-Мейера и Кокса будет выполняться с использованием SPSS версии 17.0 (SPSS, Чикаго, Иллинойс).