Analyse RNAseq de l'expression génique microbienne dans les infections nécrosantes des tissus mous (NSTI)

Hypothèse : Nous émettons l'hypothèse que RNAseq nous permettra d'en savoir plus sur les agents responsables des infections nécrosantes des tissus mous (NSTI) et les facteurs de risque impliqués dans l'acquisition de ces infections dévastatrices

Des biopsies tissulaires seront obtenues à partir de patients consentants admis avec un NSTI. Les biopsies seront utilisées pour l'analyse clinique standard des espèces bactériennes présentes ou stockées pour un séquençage ultérieur de l'ARN. Le séquençage de l'ARN identifiera les bactéries présentes dans le site d'infection qui ne peuvent pas être détectées à l'aide de techniques de culture standard et révélera les profils d'expression des gènes bactériens dans le site NSTI. Les dossiers médicaux seront également examinés pour les informations de base sur les patients ainsi que les pratiques de gestion des soins des plaies. Nous espérons identifier les espèces bactériennes couramment présentes dans ces types d'infections ainsi que les facteurs de risque prédisposant les individus aux NSTI.