RNAseq-analyse av mikrobiell genuttrykk ved nekrotiserende bløtvevsinfeksjoner (NSTI)

Hypotese: Vi antar at RNAseq vil tillate oss å lære mer om årsakene til nekrotiserende bløtvevsinfeksjoner (NSTI) og risikofaktorer involvert i å få disse ødeleggende infeksjonene

Vevsbiopsier vil bli innhentet fra samtykkende pasienter innlagt med NSTI. Biopsier vil bli brukt for standard klinisk analyse av bakteriearter som er tilstede eller lagret for senere RNA-sekvensering. RNA-sekvensering vil identifisere bakterier som er tilstede innenfor infeksjonsstedet som kanskje ikke kan oppdages ved bruk av standard kulturteknikker, samt avsløre bakterielle genekspresjonsprofiler innenfor NSTI-stedet. Medisinske diagrammer vil også bli gjennomgått for grunnleggende pasientinformasjon samt praksis for sårbehandling. Vi håper å identifisere bakteriearter som ofte er tilstede i denne typen infeksjoner, samt risikofaktorer som disponerer individer for NSTI.