RNAseq-analyse van microbiële genexpressie bij necrotiserende weke delen infecties (NSTI)

Hypothese: we veronderstellen dat RNAseq ons in staat zal stellen meer te leren over de veroorzakers van necrotiserende weke delen infecties (NSTI) en risicofactoren die betrokken zijn bij het verkrijgen van deze verwoestende infecties

Weefselbiopten zullen worden verkregen van patiënten die hiermee hebben ingestemd en zijn opgenomen met NSTI. Biopsieën zullen worden gebruikt voor standaard klinische analyse van aanwezige of opgeslagen bacteriesoorten voor latere RNA-sequencing. RNA-sequencing zal bacteriën identificeren die aanwezig zijn op de infectieplaats die mogelijk niet worden gedetecteerd met behulp van standaard kweektechnieken, en ook bacteriële genexpressieprofielen onthullen binnen de NSTI-plaats. Medische dossiers zullen ook worden beoordeeld op basispatiëntinformatie en praktijken op het gebied van wondverzorging. We hopen bacteriesoorten te identificeren die vaak aanwezig zijn in dit soort infecties, evenals risicofactoren die individuen vatbaar maken voor NSTI's.