Analiza RNAseq ekspresji genów drobnoustrojów w martwiczych zakażeniach tkanek miękkich (NSTI)

Hipoteza: Stawiamy hipotezę, że RNAseq pozwoli nam dowiedzieć się więcej o czynnikach wywołujących martwicze infekcje tkanek miękkich (NSTI) i czynnikach ryzyka związanych z nabywaniem tych wyniszczających infekcji

Biopsje tkanek będą pobierane od pacjentów przyjętych z powodu NSTI, którzy wyrazili na to zgodę. Biopsje zostaną wykorzystane do standardowej analizy klinicznej gatunków bakterii obecnych lub przechowywanych w celu późniejszego sekwencjonowania RNA. Sekwencjonowanie RNA zidentyfikuje bakterie obecne w miejscu infekcji, których nie można wykryć przy użyciu standardowych technik hodowli, a także ujawni profile ekspresji genów bakteryjnych w miejscu NSTI. Karty medyczne zostaną również przejrzane pod kątem podstawowych informacji o pacjencie, a także praktyk leczenia ran. Mamy nadzieję zidentyfikować gatunki bakterii powszechnie występujące w tego typu infekcjach, a także czynniki ryzyka predysponujące osoby do NSTI.