RNAseq-analys av mikrobiellt genuttryck vid nekrotiserande mjukvävnadsinfektioner (NSTI)

Hypotes: Vi antar att RNAseq kommer att tillåta oss att lära oss mer om orsakerna till nekrotiserande mjukdelsinfektioner (NSTI) och riskfaktorer som är involverade i att få dessa förödande infektioner

Vävnadsbiopsier kommer att erhållas från patienter med samtycke som tagits in med NSTI. Biopsier kommer att användas för klinisk standardanalys av bakteriearter som finns eller lagras för senare RNA-sekvensering. RNA-sekvensering kommer att identifiera bakterier som finns på infektionsstället som kanske inte kan detekteras med standardodlingstekniker samt avslöja bakteriella genuttrycksprofiler inom NSTI-stället. Medicinska diagram kommer också att granskas för grundläggande patientinformation samt sårvårdshanteringsmetoder. Vi hoppas kunna identifiera bakteriearter som ofta förekommer i dessa typer av infektioner såväl som riskfaktorer som predisponerar individer för NSTI.