Changements associés à H. Pylori et à la carcinogenèse gastrique (IIT H pylori)
Séquençage de nouvelle génération pour évaluer les changements transcriptomiques associés à l'infection à H. Pylori et à la carcinogenèse du cancer gastrique
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Intervention / Traitement
Description détaillée
L'infection à H. pylori est une cause environnementale prévalente du cancer gastrique. Les mécanismes moléculaires de la carcinogenèse due à H. pylori restent inexpliqués et les conséquences de l'infection sont variables et imprévisibles. Le but de cette recherche est d'examiner le transcriptome de l'ARN de la muqueuse du cancer gastrique (la muqueuse gastrique est la membrane muqueuse de l'estomac) chez les patients infectés par H. pylori et d'examiner le spectre de la maladie associée à l'infection. Nous examinerons également le contenu bactérien des échantillons pour identifier la ou les souches spécifiques de H. pylori et le profil microbien de l'estomac en corrélation avec le transcriptome de la muqueuse gastrique et la prédisposition au cancer gastrique. Les patients atteints d'une infection à H. pylori active antérieure ou actuelle qui prévoient de subir une évaluation endoscopique seront éligibles pour participer. Chez ces patients, nous prévoyons de prélever jusqu'à quatre biopsies supplémentaires de chaque zone de l'estomac déjà échantillonnée.
Les biopsies seront utilisées pour le séquençage d'ARN et d'ADN de nouvelle génération et de nouvelles analyses bioinformatiques. L'analyse sera effectuée au Weill Cornell Medical College par Doron Betel, PhD. Le séquençage sera effectué dans le laboratoire Epigenetics Core sous la supervision de Doron Betel, qui travaillera en étroite collaboration avec le chercheur principal, Manish A. Shah, M.D. L'examen de l'impact génétique de l'infection à H. pylori chez les patients peut exposer des facteurs génétiques qui influencer la cancérogenèse du cancer gastrique et donner un aperçu plus approfondi des voies moléculaires qui servent de biomarqueurs candidats pour la cancérogenèse du cancer gastrique. Notre objectif est de distinguer les patients atteints d'une infection chronique à H. pylori qui risquent de développer ultérieurement un cancer gastrique de la grande majorité des patients atteints d'une infection à H. pylori qui ne développent pas de malignité.
Type d'étude
Inscription (Réel)
Contacts et emplacements
Lieux d'étude
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New York
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New York, New York, États-Unis, 10021
- Weill Cornell Medical College
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
La description
Critère d'intégration:
- Le patient doit être âgé de 18 ans ou plus
- Le patient doit avoir une infection active ou antérieure à H. pylori, ou avoir été traité pour une infection à H. pylori dans le passé, tel qu'évalué par ELISA (non applicable pour le sous-ensemble de patients témoins) ou avoir un cancer gastrique ou œsophagien ou avoir l'œsophage de Barrett
- Les patients doivent être éligibles et prévoient de subir une endoscopie supérieure et une biopsie tissulaire de routine
- Les patients doivent signer un consentement éclairé
Critère d'exclusion:
- Antécédents de saignement gastro-intestinal supérieur (dans les 3 mois)
- Trouble hémorragique ou coagulopathie
- Accident vasculaire cérébral ou infarctus du myocarde récent (dans les 3 mois)
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Modèles d'observation: Cohorte
- Perspectives temporelles: Éventuel
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
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Patient
Les sujets de cette étude seront soit positifs pour H. pylori avec une infection active, soit débarrassés d'une infection à H. pylori ou seront à la fois positifs pour les anticorps anti-H. pylori et auront une tumeur maligne du tractus gastro-intestinal, en particulier un adénocarcinome gastrique.
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La partie expérimentale de cette étude est l'exigence d'une biopsie supplémentaire à partir d'un site qui est déjà en cours de biopsie au moment d'une endoscopie de routine.
Tous les patients qui développent des saignements à la suite de leurs biopsies cliniques de routine ne subiront aucune biopsie de recherche supplémentaire.
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Contrôle
Un petit sous-ensemble de patients sans infection à H. pylori sera également recruté (n = 30) pour servir de groupe témoin.
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La partie expérimentale de cette étude est l'exigence d'une biopsie supplémentaire à partir d'un site qui est déjà en cours de biopsie au moment d'une endoscopie de routine.
Tous les patients qui développent des saignements à la suite de leurs biopsies cliniques de routine ne subiront aucune biopsie de recherche supplémentaire.
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Identifier les altérations génomiques associées à l'infection à H. pylori
Délai: Dans les 3 ans suivant la collecte des tissus
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Capacité à obtenir du tissu adéquat pour le séquençage de prochaine génération à partir d'endoscopie
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Dans les 3 ans suivant la collecte des tissus
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Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Examiner le contenu bactérien dans les échantillons
Délai: au moment du prélèvement de l'échantillon
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Le séquençage à haut débit de l'ADN et de l'ARN sera utilisé pour déterminer le contenu bactérien des échantillons
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au moment du prélèvement de l'échantillon
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Collaborateurs et enquêteurs
Les enquêteurs
- Chercheur principal: Manish Shah, MD, Weill Medical College of Cornell University
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Estimé)
Achèvement de l'étude (Estimé)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Estimé)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- 1203012274
Plan pour les données individuelles des participants (IPD)
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Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
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