Endringer assosiert med H. Pylori og gastrisk karsinogenese (IIT H pylori)

H. pylori-infeksjon er en utbredt miljøårsak til magekreft. De molekylære mekanismene for karsinogenese på grunn av H. pylori forblir uforklarlige og konsekvensene av infeksjon er variable og uforutsigbare. Målet med denne forskningen er å undersøke RNA-transkriptomet til mageslimhinnen (mageslimhinnen er slimhinnen i magen), hos pasienter med H. pylori-infeksjon og undersøke spekteret av sykdom forbundet med infeksjon. Vi vil også undersøke bakterieinnholdet i prøvene for å finne den spesifikke H. pylori-stammen(e) og magemikrobielle profilen for å korrelere med gastrisk slimhinnetranskriptom og predisposisjon for magekreft. Pasienter med tidligere eller nåværende aktiv H. pylori-infeksjon som planlegger endoskopisk evaluering vil være kvalifisert for deltakelse. Fra disse pasientene planlegger vi å ta opptil fire ekstra biopsier fra hvert område av magen som allerede tas prøver.

Biopsiene vil bli brukt til neste generasjons RNA- og DNA-sekvensering og nye bioinformatikkanalyser. Analysen vil bli utført ved Weill Cornell Medical College av Doron Betel, PhD. Sekvenseringen vil bli utført i Epigenetics Core-laboratoriet under tilsyn av Doron Betel, som vil jobbe tett med hovedetterforskeren, Manish A. Shah, M.D. Undersøkelse av den genetiske påvirkningen av H. pylori-infeksjon hos pasienter kan avsløre genetiske faktorer som påvirke karsinogenesen for magekreft og gi dypere innsikt i molekylære veier som fungerer som kandidat biomarkører for karsinogenese i magekreft. Vårt mål er å skille pasienter med kronisk H. pylori-infeksjon som er i fare for senere å utvikle magekreft fra de aller fleste pasienter med H. pylori-infeksjon som ikke utvikler malignitet.