Förändringar associerade med H. Pylori och magkarcinogenes (IIT H pylori)

H. pylori-infektion är en utbredd miljöorsak till magcancer. De molekylära mekanismerna för karcinogenes på grund av H. pylori förblir oförklarade och konsekvenserna av infektion är varierande och oförutsägbara. Syftet med denna forskning är att undersöka RNA-transkriptomet av magcancerslemhinnan (magslemhinnan är slemhinnan i magen), hos patienter med H. pylori-infektion och undersöka spektrumet av sjukdomar som är förknippade med infektion. Vi kommer också att undersöka bakterieinnehållet i prover för att lokalisera den eller de specifika H. pylori-stammarna och den mikrobiella profilen i magen för att korrelera med transkriptomet av magslemhinnan och predisposition för magcancer. Patienter med tidigare eller pågående aktiv H. pylori-infektion som planerar att undergå endoskopisk utvärdering kommer att vara berättigade till deltagande. Från dessa patienter planerar vi att ta upp till fyra ytterligare biopsier från varje område av magen som redan provtas.

Biopsierna kommer att användas för nästa generations RNA- och DNA-sekvensering och nya bioinformatiska analyser. Analysen kommer att utföras vid Weill Cornell Medical College av Doron Betel, PhD. Sekvenseringen kommer att utföras i Epigenetics Core-laboratoriet under överinseende av Doron Betel, som kommer att arbeta nära med huvudutredaren, Manish A. Shah, M.D. Undersökning av den genetiska påverkan av H. pylori-infektion hos patienter kan avslöja genetiska faktorer som påverka karcinogenesen i magcancer och ge djupare insikt i molekylära vägar som fungerar som biomarkörer för karcinogenes i magcancer. Vårt mål är att skilja patienter med kronisk H. pylori-infektion som löper risk att senare utveckla magcancer från de allra flesta patienter med H. pylori-infektion som inte utvecklar malignitet.