Changements du microbiote intestinal après une greffe de microbiote fécal

Le mécanisme exact par lequel FMT est efficace est actuellement inconnu. Une étude récente portant sur 14 patients atteints d'ICD récurrente traités avec FMT35 a montré une diminution de la diversité pré-FMT, le microbiote intestinal devenant plus diversifié et similaire aux donneurs post-FMT. Ce groupe a montré des changements significatifs dans 3 ordres taxonomiques, mais aucun organisme ou espèce n'a été universellement associé au succès. Weingarden et al. ont montré que la FMT rétablissait la composition normale des acides biliaires chez les patients atteints d'ICD36 récurrente, suggérant que la correction du métabolisme des acides biliaires est probablement un mécanisme majeur par lequel la FMT aboutit à une guérison et prévient la récurrence de l'ICD. Une compréhension plus complète des mécanismes de la FMT pourrait permettre le développement de thérapies synthétiques à base de microbiote qui constitueraient une alternative sûre et efficace à la FMT traditionnelle. Nous émettons l'hypothèse que des changements précoces dans le microbiote intestinal distal post-FMT pourraient aider à identifier les espèces clés associées à l'efficacité. De plus, nous pensons qu'il existe des effets métaboliques et immunologiques mesurables qui peuvent également être bénéfiques après la FMT. Cette étude vise à documenter les changements précoces du microbiote intestinal distal (à la fois fécal et associé à la muqueuse) après la FMT. De plus, les échantillons de sang total et d'urine faciliteront les analyses collaboratives immunologiques et métabolomiques.

Il s'agira d'un essai clinique ouvert de FMT pour prévenir une nouvelle récidive chez les patients qui ont subi au moins un troisième épisode d'infection à Clostridium difficile (CDI) et qui ont déjà été traités par la vancomycine par voie orale. Les sujets seront composés de 6 patients externes adultes référés après 3 épisodes (ou plus) d'ICD. Les sujets, qui auront été traités avec au moins 10 jours de traitement anti-ICD (métronidazole, vancomycine ou fidaxomicine) pour l'infection aiguë la plus récente, recevront ensuite une FMT avec des selles de donneur administrées au moment de la sigmoïdoscopie. Après la procédure, les sujets seront suivis pendant 8 semaines pour la récurrence de C. difficile. Les sujets qui rechutent pendant cette période se verront proposer une FMT répétée en utilisant les selles du donneur. Nous prévoyons de collecter des échantillons de selles de base et post-FMT pour des analyses de microbiome ainsi que des échantillons d'urine et de sang pour des études métabolomiques et immunologiques. Les sujets seront contactés à 24 semaines pour évaluer les résultats de sécurité à long terme