UC-GENOME : analyse génomique du cancer urothélial pour améliorer les résultats des patients et la recherche

APERÇU : Il s'agit d'une étude multicentrique.

PLAN D'ÉTUDE:

IDENTIFICATION DU SUJET ET CONSENTEMENT :

Les sites peuvent approcher tous les sujets qui se présentent à un rendez-vous pour l'évaluation d'un cancer urothélial métastatique pour inclusion. Le personnel de l'étude examine les documents de consentement avec les sujets potentiels et répond à toutes les questions. Si un sujet souhaite plus de temps ou souhaite retarder son inscription à l'étude, il reçoit une copie du document de consentement et est informé de la manière de poser des questions ou de s'inscrire à une date ultérieure. Si le sujet choisit de participer à l'étude, il signe le consentement et en reçoit une copie pour ses propres dossiers.

COLLECTE ET TRAITEMENT DES ÉCHANTILLONS DE BIOS :

Lorsque les sujets sont autorisés à participer à cette étude, ils consentent à accéder à tout tissu tumoral d'archives (qu'il provienne du site primaire ou de tout site métastatique) pour analyse génétique. Ce tissu n'est pas anonymisé au moment du test afin qu'un rapport spécifique au sujet puisse être généré et envoyé au médecin traitant. De plus, les sujets consentent à l'utilisation indéfinie de leurs échantillons et des informations cliniques liées pour la recherche biomédicale en cours ou future. De plus, les sites informent les sujets pendant le processus de consentement que les chercheurs peuvent utiliser leurs informations pour la recherche génétique, y compris la recherche sur les mutations somatiques ou germinales. Les spécimens et le rapport fournis au HCRN sont anonymisés et les analyses futures seront effectuées sur des données/échantillons codés (anonymisés).

Collecte d'échantillons de tumeurs archivés :

• Une fois que le sujet aura donné son consentement, les sites demanderont du tissu tumoral archivé primaire et/ou métastatique. L'échantillon de tissu envoyé peut se présenter sous la forme d'un bloc ou de lames. La biopsie à l'aiguille est également acceptable.
• Chaque institution peut utiliser son propre mode opératoire standard pour la préparation du matériel FFPE. Chaque site participant expédiera les échantillons accessibles sous GU15-217 directement au laboratoire effectuant l'analyse NGS. Les sites demanderont également le(s) rapport(s) de pathologie correspondant(s). Un rapport de pathologie anonymisé sera ensuite envoyé au HCRN avec le tissu.

Prélèvement de sang à des fins de recherche uniquement :

• Chaque sujet aura 47 ml de sang prélevé et mis en banque pour de futurs tests. 10 mL de l'échantillon seront utilisés pour le plasma destiné à la banque. 17 ml de l'échantillon seront utilisés pour l'isolement et la cryoconservation des PBMC. 20 ml de l'échantillon seront utilisés pour le plasma pour le cfDNA. Toute analyse ADN du sang (y compris une éventuelle analyse de la lignée germinale) est uniquement à des fins de recherche et sera effectuée sur des échantillons codés (anonymisés).

Génération de rapports:

• Le rapport spécifique au sujet généré comprend un résumé des altérations génomiques mettant en évidence les variations considérées comme potentiellement exploitables, une discussion concise des analyses moléculaires, une liste d'essais cliniques potentiels incorporant des agents ciblés pertinents et des options thérapeutiques potentielles basées sur les altérations spécifiques découvertes ainsi que les niveaux de preuve pour chacun. La sélection des essais cliniques et les niveaux de preuve fournis sont basés sur un examen et une analyse approfondis de la littérature ainsi que sur un panel d'experts du cancer de la vessie convoqué par le BCGC. Ce groupe d'experts du BCGC travaillera avec le laboratoire NGS pour s'assurer que tous les essais cliniques potentiels sont représentés dans les rapports individuels des sujets.

Stockage pour la recherche future :

• La biobanque BCAN du Hoosier Cancer Research Network (HCRN) stockera l'ADN et l'ARN isolés pour l'étude, le FFPE supplémentaire et tout échantillon biologique restant après le NGS. Si à tout moment un sujet souhaite se retirer de l'étude, le sujet contactera son médecin de l'étude. Le HCRN détruira tous les spécimens qu'il pourrait lier au sujet. Une fois que les spécimens ont été dépouillés de toutes les informations d'identification ou des liens vers des informations d'identification, ils ne peuvent pas être rappelés pour être détruits.

COMMUNICATION DES RÉSULTATS NGS AU FOURNISSEUR ET À L'OBJET :

Une fois le test NGS terminé, un rapport spécifique au sujet sera fourni au médecin traitant du sujet, soit en copie papier et/ou via un portail en ligne (généralement dans les 14 jours ouvrables suivant la réception du tissu tumoral) et un rapport anonymisé au HCRN . Si un addenda est fait à un rapport, un rapport mis à jour sera fourni au médecin traitant et au HCRN de la manière décrite ci-dessus. Au cours du processus de consentement éclairé, les sites informent chaque sujet que son médecin communiquera les résultats des tests génétiques sur leurs échantillons de tumeur. Parallèlement aux résultats communiqués, le médecin traitant des sujets expliquera les implications des résultats de leurs tests, y compris si leurs profils génétiques les rendent potentiellement éligibles pour une thérapie ou un essai clinique spécifique.

Les sites informent également les sujets que les chercheurs conserveront tous les échantillons restants une fois le profilage génétique de leur tumeur terminé. Le stockage se poursuit indéfiniment pour de futures recherches biomédicales. Cela peut inclure le développement de produits commerciaux à partir de leurs spécimens.

Les sites doivent expliquer aux sujets que bien qu'un échantillon de sang soit obtenu, cette étude ne vise pas à découvrir des mutations germinales. Les sites doivent souligner que les analyses génétiques effectuées dans le cadre de cette étude ne doivent pas être interprétées comme des tests génétiques pour les mutations génétiques associées à la prédisposition héréditaire au cancer. Néanmoins, la NGS pouvant être réalisée sur du sang, il est possible qu'une mutation germinale prédisposant un sujet au cancer soit découverte incidemment. Cependant, les sujets ne recevront aucune information sur ces mutations, car cette analyse sera effectuée sur des échantillons anonymisés.

SAISIE DES DOSSIERS MÉDICAUX :

Le personnel de recherche de chaque site extrait les informations cliniques de chaque sujet et entre les informations dans la plate-forme de recherche clinique basée sur le Web (système EDC). Les données extraites comprennent des détails sur les éléments suivants : données démographiques, diagnostic du cancer, stade du cancer, prise en charge chirurgicale et médicale, toute décision de traitement prise en réponse aux résultats de l'END communiqués au médecin et toute réponse/donnée sur les résultats à plus long terme à la suite de ces décisions de traitement .

ACCÈS AUX DONNÉES/ÉCHANTILLONS POUR LA RECHERCHE FUTURE :

La base de données relie les données cliniques et génétiques codées, créant un référentiel d'échantillons biologiques et de données. Ces données, ainsi que les échantillons biologiques stockés au HCRN, seront finalement disponibles pour les chercheurs ayant des études approuvées par le BCGC et l'IRB permettant l'accès à ces données/échantillons, et le HCRN gérant les données, protégeant la confidentialité des sujets de l'étude.