UC-GENOME: Urotheliális rák-genomikus elemzés a betegek kimenetelének és kutatásának javítására

VÁZLAT: Ez egy többközpontú tanulmány.

TANULÁSI TERV:

TÁRGY AZONOSÍTÁSA ÉS BEJELENTÉSE:

A helyszínek minden olyan alanyt megkereshetnek, akik egy találkozón vesznek részt az áttétes urothelrák értékelése céljából. A tanulmányozó személyzet áttekinti a beleegyező dokumentumokat a potenciális alanyokkal, és válaszol minden kérdésre. Ha egy alany több időt igényel, vagy el akarja halasztani a vizsgálatba való felvételét, megkapja a beleegyező dokumentum egy példányát, és tájékoztatják arról, hogyan tehet fel kérdéseket vagy hogyan jelentkezhet egy későbbi időpontban. Ha a vizsgálati alany úgy dönt, hogy részt vesz a vizsgálatban, aláírja a hozzájárulását, és másolatot kap a saját nyilvántartására.

BIOSMINTA GYŰJTÉS ÉS FELDOLGOZÁS:

Amikor az alanyok beleegyeznek a vizsgálatba, beleegyeznek, hogy hozzáférjenek bármely archív tumorszövethez (akár az elsődleges, akár bármely áttétes helyről) genetikai elemzés céljából. Ezt a szövetet a vizsgálat időpontjában nem azonosítják, így alanyspecifikus jelentést lehet készíteni és elküldeni a kezelőorvosnak. Ezenkívül az alanyok beleegyeznek a mintáik és a kapcsolódó klinikai információik határozatlan ideig történő felhasználásába folyamatban lévő vagy jövőbeni orvosbiológiai kutatások céljából. Ezenkívül a webhelyek a hozzájárulási folyamat során tájékoztatják az alanyokat arról, hogy a kutatók felhasználhatják információikat genetikai kutatásokhoz, beleértve a szomatikus vagy csíravonal-mutációk kutatását. A HCRN-nek átadott minták és jelentés azonosítatlanok, és a jövőbeni elemzéseket kódolt (identizált) adatokon/mintákon végzik el.

Archivált daganatminták gyűjteménye:

• Az alany beleegyezését követően a helyszínek elsődleges és/vagy metasztatikus archivált daganatszövetet kérnek. A küldött szövetminta blokk vagy tárgylemez formájában is lehet. A tűbiopszia is elfogadható.
• Az FFPE anyag elkészítéséhez minden intézmény saját szabványos működési eljárást alkalmazhat. Minden részt vevő helyszín közvetlenül az NGS-elemzést végző laboratóriumba szállítja a GU15-217 alatt elérhető mintákat. A webhelyek a megfelelő patológiai jelentés(eke)t is kérni fogják. Ezután a szövettel együtt elküldik a HCRN-nek az azonosítatlan patológiai jelentést.

Vérgyűjtés kizárólag kutatási célokra:

• Minden alanynak 47 ml vért kell gyűjtenie, és bankba kell helyezni a jövőbeni vizsgálatokhoz. A mintából 10 ml-t használnak fel plazmához a bankoláshoz. A mintából 17 ml-t használunk fel a PBMC izolálására és mélyhűtésére. A mintából 20 ml-t használnak fel plazmához a cfDNS-hez. A vér bármely DNS-elemzése (beleértve az esetleges csíravonal-elemzést is) kizárólag kutatási célokat szolgál, és kódolt (identitásmentesített) mintákon hajtják végre.

Jelentés generálása:

• Az elkészített tárgyspecifikus jelentés tartalmazza a genomiális változások összefoglalását, kiemelve a potenciálisan megvalósíthatónak tartott variációkat, a molekuláris elemzések tömör tárgyalását, a potenciális klinikai vizsgálatok listáját, amelyek releváns célzott szereket tartalmaznak, és a lehetséges terápiás lehetőségeket a felfedezett specifikus változásokon, valamint a kapcsolódóan. bizonyítékok szintjei mindegyikre. A klinikai vizsgálatok és a benyújtott bizonyítékok szintjei a szakirodalom kiterjedt áttekintésén és elemzésén, valamint a BCGC által összehívott húgyhólyagrák-szakértői testületen alapulnak. Ez a BCGC szakértői testület az NGS-laborral együttműködve biztosítja, hogy minden lehetséges klinikai vizsgálat szerepeljen az egyes alanyok jelentéseiben.

Tárolás a jövőbeli kutatásokhoz:

• A Hoosier Cancer Research Network (HCRN) BCAN Biobankja tárolja a vizsgálathoz izolált DNS-t és RNS-t, további FFPE-t és az NGS után megmaradt biomintákat. Ha egy alany bármikor ki kíván lépni a vizsgálatból, az alany kapcsolatba lép a vizsgálati orvosával. A HCRN megsemmisít minden olyan példányt, amelyet az alanyhoz kapcsolhat. Miután a példányokat megfosztották minden azonosító információtól vagy az azonosító információra mutató hivatkozástól, nem lehet visszahívni őket, hogy megsemmisítsék őket.

AZ NGS EREDMÉNYÉNEK KÖZLÉSE A SZOLGÁLTATÓ ÉS A TÁRGY SZÁMÁRA:

Az NGS-teszt befejezése után a vizsgálati alany kezelőorvosa egy alanyspecifikus jelentést kap papíron és/vagy on-line portálon keresztül (általában a daganatszövet kézhezvételétől számított 14 munkanapon belül), valamint egy azonosítatlan jelentést a HCRN-nek. . Ha a jelentéshez kiegészítést tesznek, a fent leírt módon frissített jelentést küldenek a kezelőorvosnak és a HCRN-nek. A tájékoztatáson alapuló beleegyezési folyamat során a helyszínek tájékoztatják az egyes alanyokat, hogy orvosa közölni fogja a tumorminták genetikai vizsgálatának eredményeit. A közölt eredmények mellett az alanyok kezelőorvosa elmagyarázza a vizsgálati eredményeik következményeit, beleértve azt is, hogy genetikai profiljuk alkalmassá teszi-e őket egy adott terápiára vagy klinikai vizsgálatra.

Az oldalak arról is tájékoztatják az alanyokat, hogy a kutatók a daganat genetikai profilalkotása után megmaradó mintákat tárolnak. A tárolás korlátlan ideig folytatódik a jövőbeli orvosbiológiai kutatások számára. Ez magában foglalhatja a kereskedelmi termékek kifejlesztését a példányaikból.

A helyszíneknek el kell magyarázniuk az alanyoknak, hogy bár vérmintát vesznek, ennek a vizsgálatnak nem célja a csíravonal-mutációk feltárása. Az oldalaknak hangsúlyozniuk kell, hogy a jelen tanulmányban végzett genetikai elemzések nem értelmezhetők az örökletes rákra való hajlamhoz kapcsolódó genetikai mutációk genetikai vizsgálataként. Mindazonáltal, mivel az NGS-t véren is elvégezhetik, lehetséges, hogy véletlenül felfedeznek egy csíravonal-mutációt, amely hajlamosítja az alanyt a rákra. Az alanyok azonban nem kapnak információt az ilyen mutációkról, mivel ezt az elemzést azonosítatlan mintákon végzik el.

ORVOSI FELVONÁSOK KIBOCSÁTÁSA:

Az egyes helyszíneken dolgozó kutatók kivonják a klinikai információkat az egyes alanyokról, és beírják az információkat a web alapú klinikai kutatási platformba (EDC rendszer). A kivont adatok a következőkre vonatkozó részleteket tartalmazzák: demográfiai adatok, rákdiagnózis, rák stádiuma, sebészeti és orvosi kezelés, az orvossal közölt NGS-eredményekre válaszul hozott minden kezelési döntés, valamint az ezen kezelési döntések eredményeként kapott válasz/hosszabb távú kimenetel adat. .

AZ ADATOKHOZ/MINTÁKHOZ VALÓ HOZZÁFÉRÉS A JÖVŐBELI KUTATÁSHOZ:

Az adatbázis kódolt klinikai és genetikai adatokat kapcsol össze, így biomintát és adattárat hoz létre. Ezek az adatok a HCRN-ben tárolt biomintákkal együtt végső soron a BCGC és IRB által jóváhagyott tanulmányokkal rendelkező kutatók számára lesznek elérhetőek, amelyek lehetővé teszik az adatokhoz/mintákhoz való hozzáférést, és a HCRN kezeli az adatokat, védve a vizsgálati alanyok titkosságát.