UC-GENOME: GENOMická analýza uroteliální rakoviny ke zlepšení výsledků a výzkumu pacientů

PŘEHLED: Toto je multicentrická studie.

STUDIJNÍ PLÁN:

IDENTIFIKACE PŘEDMĚTU A SOUHLAS:

Místa mohou oslovit všechny subjekty, které se zúčastní schůzky pro hodnocení metastatického uroteliálního karcinomu pro zařazení. Pracovníci studie prozkoumají dokumenty o souhlasu s potenciálními subjekty a zodpoví všechny otázky. Pokud si subjekt přeje více času nebo si přeje odložit zápis do studie, dostane kopii dokumentu o souhlasu a bude informován o tom, jak klást otázky nebo se zapsat později. Pokud se subjekt rozhodne zúčastnit se studie, podepíše souhlas a dostane kopii pro vlastní záznamy.

SBĚR A ZPRACOVÁNÍ VZORKŮ BIOS:

Když subjekty souhlasí se vstupem do této studie, souhlasí s přístupem k jakékoli archivní nádorové tkáni (ať už z primárního nebo jakéhokoli metastatického místa) pro genetickou analýzu. Tato tkáň není v době testování identifikována, takže může být vytvořena zpráva specifická pro subjekt a odeslána ošetřujícímu lékaři. Subjekty dále souhlasí s neomezeným použitím jejich vzorků a souvisejících klinických informací pro probíhající nebo budoucí biomedicínský výzkum. Kromě toho stránky informují subjekty během procesu souhlasu, že výzkumníci mohou použít jejich informace pro genetický výzkum, včetně výzkumu somatických nebo zárodečných mutací. Vzorky a zpráva poskytnutá HCRN jsou deidentifikovány a budoucí analýzy budou prováděny na kódovaných (de-identifikovaných) datech/vzorcích.

Sbírka archivovaných vzorků nádorů:

• Poté, co subjekt obdrží souhlas, budou místa vyžadovat primární a/nebo metastatickou archivovanou nádorovou tkáň. Odeslaný vzorek tkáně může mít formu bloku nebo sklíček. Přijatelná je i biopsie jehlou.
• Každá instituce může pro přípravu materiálu FFPE použít svůj standardní operační postup. Každé zúčastněné pracoviště zašle vzorky přístupné pod GU15-217 přímo do laboratoře provádějící analýzu NGS. Místa si také vyžádají odpovídající patologické zprávy. Poté bude s tkání odeslána zpráva o deidentifikované patologii do HCRN.

Odběr krve pouze pro výzkumné účely:

• Každému subjektu bude odebráno 47 ml krve a uloženo pro budoucí testování. 10 ml vzorku bude použito pro plazmu pro bankovnictví. 17 ml vzorku bude použito pro izolaci PBMC a kryokonzervaci. 20 ml vzorku bude použito pro plazmu pro cfDNA. Jakákoli analýza DNA krve (včetně možné analýzy zárodečné linie) je pouze pro výzkumné účely a bude provedena na kódovaných (deidentifikovaných) vzorcích.

Generování přehledu:

• Vygenerovaná specifická zpráva pro předmět obsahuje souhrn genomových změn zdůrazňujících ty varianty považované za potenciálně proveditelné, stručnou diskuzi o molekulárních analýzách, seznam potenciálních klinických studií zahrnujících relevantní cílené látky a potenciální terapeutické možnosti založené na konkrétních objevených změnách spolu se souvisejícími úrovně důkazů pro každého. Výběr klinických studií a úrovně poskytnutých důkazů jsou založeny na rozsáhlém přehledu a analýze literatury a také na panelu odborníků na rakovinu močového měchýře svolanému BCGC. Tento expertní panel BCGC bude spolupracovat s laboratoří NGS, aby zajistil, že všechny potenciální klinické studie budou zastoupeny ve zprávách jednotlivých subjektů.

Úložiště pro budoucí výzkum:

• Biobanka BCAN v Hoosier Cancer Research Network (HCRN) bude uchovávat DNA a RNA izolované pro studii, další FFPE a jakékoli biovzorky zbývající po NGS. Pokud si subjekt přeje kdykoli odstoupit ze studie, kontaktuje svého studijního lékaře. HCRN zničí všechny exempláře, které by mohly spojovat s předmětem. Jakmile byly exempláře zbaveny všech identifikačních informací nebo odkazů na identifikační informace, nelze je vyvolat ke zničení.

KOMUNIKACE VÝSLEDKŮ NGS POSKYTOVATELI A SUBJEKTU:

Po dokončení testování NGS bude ošetřujícímu lékaři subjektu poskytnuta zpráva o konkrétním subjektu buď v tištěné podobě a/nebo prostřednictvím on-line portálu (obvykle do 14 pracovních dnů od obdržení nádorové tkáně) a zpráva s deidentifikací pro HCRN . V případě doplnění zprávy bude aktualizovaná zpráva poskytnuta ošetřujícímu lékaři a HCRN výše popsaným způsobem. Během procesu informovaného souhlasu místa informují každý subjekt, že jeho lékař sdělí výsledky genetického testování na jejich vzorcích nádoru. Spolu s výsledky, které jsou sděleny, ošetřující lékař subjektů vysvětlí důsledky jejich výsledků testování, včetně toho, zda je jejich genetický profil činí potenciálně způsobilými pro specifickou terapii nebo klinickou studii.

Stránky také informují subjekty, že výzkumníci budou uchovávat všechny zbývající vzorky po dokončení genetického profilování jejich nádoru. Skladování pokračuje na neurčito pro budoucí biomedicínský výzkum. To může zahrnovat vývoj komerčních produktů z jejich vzorků.

Místa musí subjektům vysvětlit, že ačkoli se získává vzorek krve, tato studie není zaměřena na objevování zárodečných mutací. Místa musí zdůraznit, že genetické analýzy provedené v rámci této studie by neměly být vykládány jako genetické testování na genetické mutace spojené s dědičnou náchylností k rakovině. Nicméně, protože NGS může být prováděno na krvi, je možné, že bude náhodně objevena zárodečná mutace, která predisponuje subjekt k rakovině. Subjekty však neobdrží žádné informace o takových mutacích, protože tato analýza bude provedena na neidentifikovaných vzorcích.

ABSTRAKCE LÉKAŘSKÝCH ZÁZNAMŮ:

Výzkumní pracovníci na každém místě abstrahují klinické informace od každého subjektu a zadávají je do webové platformy klinického výzkumu (EDC systém). Abstrahovaná data zahrnují podrobnosti o následujících údajích: demografii, diagnóze rakoviny, stádiu rakoviny, chirurgickém a lékařském managementu, veškerá rozhodnutí o léčbě učiněná v reakci na výsledky NGS sdělené lékaři a jakékoli údaje o reakci/dlouhodobém výsledku v důsledku těchto rozhodnutí o léčbě .

PŘÍSTUP K DATŮM/VZORKŮM PRO BUDOUCÍ VÝZKUM:

Databáze propojuje kódovaná klinická a genetická data a vytváří biovzorky a úložiště dat. Tato data, spolu s biovzorky uloženými v HCRN, budou nakonec k dispozici výzkumníkům se studiemi schválenými BCGC a IRB, které umožní přístup k těmto datům/vzorkům, a HCRN bude data spravovat a bude chránit důvěrnost subjektů studie.