UC-GENOME: Urotheliale kanker-GENOMische analyse om patiëntresultaten en onderzoek te verbeteren

OVERZICHT: Dit is een onderzoek in meerdere centra.

STUDIE PLAN:

ONDERWERPIDENTIFICATIE EN TOESTEMMING:

Sites kunnen alle proefpersonen benaderen die een afspraak bijwonen voor evaluatie van uitgezaaide urotheelkanker voor opname. Studiepersoneel beoordeelt toestemmingsdocumenten met potentiële proefpersonen en beantwoordt alle vragen. Als een proefpersoon meer tijd wenst of de inschrijving voor het onderzoek wil uitstellen, krijgt hij/zij een kopie van het toestemmingsdocument en wordt hij/zij geïnformeerd over hoe hij/zij vragen kan stellen of zich op een later tijdstip kan inschrijven. Als de proefpersoon ervoor kiest om aan het onderzoek deel te nemen, ondertekent hij of zij de toestemming en krijgt hij of zij een kopie voor zijn of haar eigen administratie.

BIOSPECIMEN INZAMELING EN VERWERKING:

Wanneer proefpersonen toestemming hebben gekregen voor deelname aan dit onderzoek, stemmen ze in met toegang tot elk gearchiveerd tumorweefsel (hetzij van de primaire of een metastatische locatie) voor genetische analyse. Dit weefsel wordt niet geanonimiseerd op het moment van testen, zodat een onderwerpspecifiek rapport kan worden gegenereerd en naar de behandelend arts kan worden gestuurd. Verder stemmen proefpersonen in met het onbeperkte gebruik van hun specimens en gekoppelde klinische informatie voor lopend of toekomstig biomedisch onderzoek. Bovendien informeren sites proefpersonen tijdens het toestemmingsproces dat onderzoekers hun informatie mogen gebruiken voor genetisch onderzoek, inclusief onderzoek naar somatische of kiembaanmutaties. De aan HCRN verstrekte monsters en rapporten zijn geanonimiseerd en toekomstige analyses zullen worden uitgevoerd op gecodeerde (geanonimiseerde) gegevens/monsters.

Verzameling van gearchiveerde tumormonsters:

• Nadat de proefpersoon toestemming heeft gegeven, zullen sites primair en/of gemetastaseerd gearchiveerd tumorweefsel opvragen. Het verzonden weefselmonster kan de vorm hebben van een blok of objectglaasjes. Naaldbiopsie is ook acceptabel.
• Elke instelling kan haar eigen standaardwerkwijze gebruiken voor de voorbereiding van het FFPE-materiaal. Elke deelnemende locatie verzendt monsters waartoe toegang is verkregen onder GU15-217 rechtstreeks naar het laboratorium dat de NGS-analyse uitvoert. Sites zullen ook om overeenkomstige pathologierapport(en) vragen. Een geanonimiseerd pathologierapport wordt dan samen met het weefsel naar HCRN gestuurd.

Bloedafname uitsluitend voor onderzoeksdoeleinden:

• Van elke proefpersoon wordt 47 ml bloed afgenomen en opgeslagen voor toekomstige tests. 10 ml van het monster wordt gebruikt voor plasma voor bankieren. 17 ml van het monster wordt gebruikt voor PBMC-isolatie en cryopreservatie. 20 ml van het monster wordt gebruikt voor plasma voor cfDNA. Elke DNA-analyse van bloed (inclusief mogelijke kiembaananalyse) is uitsluitend voor onderzoeksdoeleinden en wordt uitgevoerd op gecodeerde (geanonimiseerde) monsters.

Rapport genereren:

• Het gegenereerde onderwerpspecifieke rapport bevat een samenvatting van genomische veranderingen die de variaties belichten die als potentieel uitvoerbaar worden beschouwd, een beknopte bespreking van de moleculaire analyses, een lijst van potentiële klinische onderzoeken waarin relevante gerichte middelen zijn opgenomen, en mogelijke therapeutische opties op basis van de specifieke veranderingen die zijn ontdekt samen met bijbehorende niveaus van bewijs voor elk. De selectie van klinische onderzoeken en geleverde bewijsniveaus zijn gebaseerd op uitgebreide beoordeling en analyse van de literatuur en op een door het BCGC bijeengeroepen panel van deskundigen op het gebied van blaaskanker. Dit BCGC-expertpanel zal samenwerken met het NGS-laboratorium om ervoor te zorgen dat alle potentiële klinische studies vertegenwoordigd zijn in de rapporten van de individuele proefpersonen.

Opslag voor toekomstig onderzoek:

• De BCAN-biobank van het Hoosier Cancer Research Network (HCRN) zal DNA en RNA opslaan dat is geïsoleerd voor het onderzoek, extra FFPE en alle biospecimens die overblijven na de NGS. Als een proefpersoon zich op enig moment uit het onderzoek wil terugtrekken, neemt de proefpersoon contact op met de onderzoeksarts. HCRN vernietigt alle exemplaren die mogelijk verband houden met het onderwerp. Zodra exemplaren zijn ontdaan van alle identificerende informatie of links naar identificerende informatie, kunnen ze niet worden teruggeroepen om te worden vernietigd.

COMMUNICATIE VAN NGS-RESULTATEN AAN VERSTREKKER EN ONDERNEMER:

Nadat de NGS-test is voltooid, wordt een proefpersoonspecifiek rapport verstrekt aan de behandelend arts van de proefpersoon, hetzij op papier en/of via een online portaal (doorgaans binnen 14 werkdagen na ontvangst van het tumorweefsel) en een geanonimiseerd rapport aan HCRN . Als er een addendum bij een melding wordt gemaakt, wordt op de hierboven beschreven wijze een bijgewerkte melding aan de behandelend arts en het HCRN verstrekt. Tijdens het geïnformeerde toestemmingsproces informeren sites elke proefpersoon dat zijn of haar arts de resultaten van de genetische tests op hun tumorspecimens zal communiceren. Samen met de resultaten die worden gecommuniceerd, zal de behandelend arts van de proefpersonen de implicaties van hun testresultaten toelichten, inclusief of hun genetische profielen hen mogelijk in aanmerking laten komen voor een specifieke therapie of klinische proef.

Sites informeren proefpersonen ook dat onderzoekers eventuele overgebleven exemplaren zullen opslaan nadat de genetische profilering van hun tumor is voltooid. Opslag gaat voor onbepaalde tijd door voor toekomstig biomedisch onderzoek. Dit kan de ontwikkeling van commerciële producten van hun exemplaren omvatten.

Sites moeten proefpersonen uitleggen dat hoewel er een bloedmonster wordt afgenomen, dit onderzoek niet gericht is op het ontdekken van kiembaanmutaties. Sites moeten benadrukken dat genetische analyses die in dit onderzoek worden uitgevoerd niet mogen worden opgevat als genetische tests voor genetische mutaties die verband houden met erfelijke vatbaarheid voor kanker. Desalniettemin, omdat NGS op bloed kan worden uitgevoerd, is het mogelijk dat incidenteel een kiembaanmutatie wordt ontdekt die een persoon vatbaar maakt voor kanker. Proefpersonen krijgen echter geen informatie over dergelijke mutaties, aangezien deze analyse wordt uitgevoerd op geanonimiseerde monsters.

ABSTRACTIE VAN MEDISCHE DOSSIERS:

Onderzoekspersoneel op elke locatie abstraheert klinische informatie van elk onderwerp en voert de informatie in op het webgebaseerde platform voor klinisch onderzoek (EDC-systeem). Geabstraheerde gegevens omvatten details over het volgende: demografische gegevens, kankerdiagnose, kankerstadium, chirurgische en medische behandeling, eventuele behandelbeslissingen die zijn genomen als reactie op de NGS-resultaten die aan de arts zijn meegedeeld en eventuele gegevens over de respons/uitkomst op langere termijn als gevolg van deze behandelbeslissingen .

TOEGANG TOT GEGEVENS/SPECIMENS VOOR TOEKOMSTIG ONDERZOEK:

De database koppelt gecodeerde klinische en genetische gegevens, waardoor een biospecimen- en gegevensopslagplaats ontstaat. Deze gegevens, samen met biospecimens die zijn opgeslagen bij HCRN, zullen uiteindelijk beschikbaar zijn voor onderzoekers met BCGC-goedgekeurde en IRB-goedgekeurde studies die toegang geven tot deze data/specimens, en met HCRN die de gegevens beheert, waardoor de vertrouwelijkheid van proefpersonen wordt beschermd.