UC-GENOME: análisis GENómico del cáncer urotelial para mejorar los resultados de los pacientes y la investigación

ESQUEMA: Este es un estudio multicéntrico.

PLAN DE ESTUDIOS:

IDENTIFICACIÓN Y CONSENTIMIENTO DEL SUJETO:

Los sitios pueden acercarse a todos los sujetos que asisten a una cita para la evaluación del cáncer urotelial metastásico para su inclusión. El personal del estudio revisa los documentos de consentimiento con los sujetos potenciales y responde todas y cada una de las preguntas. Si un sujeto desea más tiempo o desea retrasar la inscripción en el estudio, se le entrega una copia del documento de consentimiento y se le informa sobre cómo hacer preguntas o inscribirse en una fecha posterior. Si el sujeto elige participar en el estudio, él o ella firma el consentimiento y se le entrega una copia para sus propios registros.

RECOGIDA Y PROCESAMIENTO DE MUESTRAS DE BIOS:

Cuando los sujetos reciben su consentimiento para participar en este estudio, aceptan el acceso a cualquier tejido tumoral de archivo (ya sea del sitio primario o metastásico) para el análisis genético. Este tejido no se anonimiza en el momento de la prueba, por lo que se puede generar un informe específico del sujeto y enviarlo al médico tratante. Además, los sujetos aceptan el uso indefinido de sus muestras y la información clínica vinculada para investigaciones biomédicas en curso o futuras. Además, los sitios informan a los sujetos durante el proceso de consentimiento que los investigadores pueden usar su información para la investigación genética, incluida la investigación sobre mutaciones somáticas o de la línea germinal. Los especímenes y el informe proporcionados a HCRN están desidentificados y los análisis futuros se realizarán en datos/especímenes codificados (desidentificados).

Colección de muestras de tumores archivados:

• Después de que el sujeto haya dado su consentimiento, los sitios solicitarán tejido tumoral archivado primario y/o metastásico. La muestra de tejido enviada puede venir en forma de bloque o portaobjetos. La biopsia con aguja también es aceptable.
• Cada institución puede utilizar su propio procedimiento operativo estándar para la preparación del material FFPE. Cada sitio participante enviará las muestras a las que se accedió bajo GU15-217 directamente al laboratorio que realiza el análisis NGS. Los sitios también solicitarán los informes de patología correspondientes. Luego, se enviará un informe de patología no identificado a HCRN con el tejido.

Recolección de sangre solo para fines de investigación:

• Cada sujeto tendrá 47 mL de sangre recolectada y almacenada para futuras pruebas. Se utilizarán 10mL de la muestra para plasma para banco. Se utilizarán 17 ml de la muestra para el aislamiento y la crioconservación de PBMC. Se utilizarán 20 ml de la muestra para plasma para cfDNA. Cualquier análisis de ADN de la sangre (incluido el posible análisis de la línea germinal) es solo para fines de investigación y se realizará en muestras codificadas (no identificadas).

La generación del informe:

• El informe específico del tema generado incluye un resumen de las alteraciones genómicas que destacan aquellas variaciones consideradas potencialmente procesables, una discusión concisa de los análisis moleculares, una lista de posibles ensayos clínicos que incorporan agentes dirigidos relevantes y posibles opciones terapéuticas basadas en las alteraciones específicas descubiertas junto con los niveles de evidencia para cada uno. La selección de ensayos clínicos y los niveles de evidencia proporcionados se basan en una extensa revisión y análisis de la literatura, así como en un panel de expertos en cáncer de vejiga convocado por BCGC. Este panel de expertos de BCGC trabajará con el laboratorio de NGS para garantizar que todos los ensayos clínicos potenciales estén representados en los informes de los sujetos individuales.

Almacenamiento para futuras investigaciones:

• El biobanco BCAN en Hoosier Cancer Research Network (HCRN) almacenará ADN y ARN aislados para el estudio, FFPE adicional y cualquier muestra biológica que quede después de la NGS. Si en algún momento un sujeto desea retirarse del estudio, el sujeto se comunicará con su médico del estudio. HCRN destruirá cualquier muestra que pueda vincular al sujeto. Una vez que los especímenes han sido despojados de toda la información de identificación o enlaces a la información de identificación, no se pueden recuperar para destruirlos.

COMUNICACIÓN DE RESULTADOS NGS A PROVEEDOR Y SUJETO:

Una vez completadas las pruebas de NGS, se proporcionará un informe específico del sujeto al médico tratante del sujeto, ya sea en copia impresa y/o a través de un portal en línea (generalmente dentro de los 14 días hábiles posteriores a la recepción del tejido tumoral) y un informe anonimizado a HCRN . Si se realiza una adición a un informe, se proporcionará un informe actualizado al médico tratante y al HCRN de la manera descrita anteriormente. Durante el proceso de consentimiento informado, los sitios informan a cada sujeto que su médico comunicará los resultados de las pruebas genéticas en sus muestras de tumores. Junto con los resultados que se comunican, el médico tratante de los sujetos explicará las implicaciones de los resultados de sus pruebas, incluso si sus perfiles genéticos los hacen potencialmente elegibles para una terapia o ensayo clínico específico.

Los sitios también informan a los sujetos que los investigadores almacenarán cualquier muestra restante después de que se complete el perfil genético de su tumor. El almacenamiento continúa indefinidamente para futuras investigaciones biomédicas. Esto puede incluir el desarrollo de productos comerciales a partir de sus especímenes.

Los sitios deben explicar a los sujetos que, aunque se obtiene una muestra de sangre, este estudio no tiene como objetivo descubrir mutaciones de la línea germinal. Los sitios deben enfatizar que los análisis genéticos realizados dentro de este estudio no deben interpretarse como pruebas genéticas para mutaciones genéticas asociadas con la susceptibilidad al cáncer hereditario. Sin embargo, debido a que la NGS se puede realizar en sangre, es posible que se descubra incidentalmente una mutación de la línea germinal que predisponga a un sujeto al cáncer. Sin embargo, los sujetos no recibirán ninguna información sobre tales mutaciones, ya que este análisis se realizará en muestras no identificadas.

ABSTRACCIÓN DE REGISTROS MÉDICOS:

El personal de investigación en cada sitio extrae información clínica de cada sujeto e ingresa la información en la plataforma de investigación clínica basada en la web (sistema EDC). Los datos resumidos incluyen detalles sobre lo siguiente: datos demográficos, diagnóstico de cáncer, etapa del cáncer, manejo quirúrgico y médico, cualquier decisión de tratamiento tomada en respuesta a los resultados de NGS comunicados al médico y cualquier respuesta/datos de resultados a largo plazo como resultado de estas decisiones de tratamiento .

ACCESO A DATOS/MUESTRAS PARA FUTURAS INVESTIGACIONES:

La base de datos vincula datos clínicos y genéticos codificados, creando un depósito de datos y muestras biológicas. Estos datos, junto con las muestras biológicas almacenadas en HCRN, estarán disponibles en última instancia para los investigadores con estudios aprobados por BCGC y aprobados por IRB que permitan el acceso a estos datos/muestras, y con HCRN administrando los datos, protegiendo la confidencialidad de los sujetos del estudio.