- ICH GCP
- Registre américain des essais cliniques
- Essai clinique NCT02744469
Bénin Population Diversité de la tuberculose et implications (BeniDiT)
Implications de la structure de la population du complexe Mycobacterium Tuberculosis au Bénin pour la présentation, le diagnostic et l'évolution de la tuberculose
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Intervention / Traitement
Description détaillée
L'objectif global de cette étude est de déterminer la structure de la population du complexe Mycobacterium tuberculosis au Bénin, et les implications pour la présentation, le diagnostic et les résultats de la tuberculose L'objectif principal est de comparer les caractéristiques des lignées ancestrales du complexe Mycobacterium tuberculosis, telles que M. africanum West Africain 1 (Lignée 5), avec M. tuberculosis moderne au Bénin.
Cette étude s'appuiera sur le système de surveillance à l'échelle nationale déjà mis en place pour les patients en retraitement et recrutera en outre un échantillon aléatoire représentatif de nouveaux patients. Ainsi, pour cette étude, des crachats de patients en retraitement et d'un échantillon de nouveaux patients, provenant des 24 cliniques de la tuberculose (TB) (Centres de Diagnostic et de Traitement de la Tuberculose) sélectionnés dans tout le pays (Bénin), seront expédiés des cliniques de la tuberculose. au ''Laboratoire de Référence des Mycobactéries'' (LRM), Cotonou (Laboratoire National de Référence pour les Mycobactéries, Cotonou) s'ils y consentent. Tous les patients en retraitement seront recrutés dans l'étude et chaque 4 nouveaux patients détectés après la détection d'un patient en retraitement seront également recrutés dans l'étude.
Lors de l'inscription, un questionnaire sera utilisé pour recueillir auprès des participants consentants des informations telles que : le lieu de résidence du participant (rural ou urbain, tel que déterminé par la densité de population) ; groupe ethnique; âge; sexe; Statut du virus de l'immunodéficience humaine (VIH); Bacille de Calmette Guérin (BCG) vaccin cicatrice...
L'analyse des spoligotypes sera utilisée pour déterminer la structure de la population, car elle permet la classification de la plupart des isolats du complexe Mycobacterium tuberculosis dans les lignées, y compris les souches avec une ou quelques copies de IS6110.
L'évaluation externe de la qualité (assurance qualité) des analyses de laboratoire à effectuer au LRM (Laboratoire National de Référence pour les Mycobactéries) à Cotonou, Bénin pendant l'étude, sera effectuée par l'Institut de Médecine Tropicale d'Anvers en Belgique.
Type d'étude
Inscription (Réel)
Contacts et emplacements
Lieux d'étude
-
-
-
Antwerp, Belgique
- Institute of Tropical Medicine
-
-
-
-
Atacora/Donga
-
Djougou, Atacora/Donga, Bénin
- Centre de Diagnostic et de Traitement de la Tuberculose de Djougou
-
Matéri, Atacora/Donga, Bénin
- Centre de Diagnostic et de Traitement de la Tuberculose de Matéri
-
Natitingou, Atacora/Donga, Bénin
- Centre de Diagnostic et de Traitement de la Tuberculose de Natitingou
-
Tanguiéta, Atacora/Donga, Bénin
- Centre de Diagnostic et de Traitement de la Tuberculose de Tanguiéta
-
-
Atlantique/Littoral
-
Abomey-Calavi, Atlantique/Littoral, Bénin
- Centre de Diagnostic et de Traitement de la tuberculose d'Abomey-Calavi
-
Allada, Atlantique/Littoral, Bénin
- Centre de Diagnostic et de Traitement de la Tuberculose d'Allada
-
Cotonou, Atlantique/Littoral, Bénin, 01BP321
- Centre National Hospitalier Universitaire de Pneumo-Phtisiologie de Cotonou
-
Ouidah, Atlantique/Littoral, Bénin
- Centre de Diagnostic et de Traitement de la Tuberculose de Ouidah
-
-
Borgou/Alibori
-
Bembèrèkè, Borgou/Alibori, Bénin
- Centre de Diagnostic et de Traitement de la Tuberculose de Bembèrèkè HE
-
Kandi, Borgou/Alibori, Bénin
- Centre de Diagnostic et de Traitement de la Tuberculose de Kandi
-
Nikki, Borgou/Alibori, Bénin
- Centre de Diagnostic et de Traitement de la Tuberculose de Nikki Hopital Sounou-Séro
-
Parakou, Borgou/Alibori, Bénin
- Centre de Diagnostic et de Traitement de la Tuberculose de Parakou CSCom
-
-
Littoral
-
Cotonou, Littoral, Bénin, 01BP321
- Laboratoire de Référence des Mycobactéries
-
-
Mono/Couffo
-
Aplahoué, Mono/Couffo, Bénin
- Centre de Diagnostic et de Traitement de la Tuberculose d'Aplahoué
-
Bopa, Mono/Couffo, Bénin
- Centre de Diagnostic et de Traitement de la Tuberculose de Bopa
-
Comè, Mono/Couffo, Bénin
- Centre de Diagnostic et de Traitement de la Tuberculose de Comè
-
Houéyogbé, Mono/Couffo, Bénin
- Centre de Diagnostic et de Traitement de la Tuberculose de Houéyogbé
-
-
Oueme/Plateau
-
Avrankou, Oueme/Plateau, Bénin
- Centre de Diagnostic et de Traitement de la Tuberculose de Avrankou
-
Pobe, Oueme/Plateau, Bénin
- Centre de Diagnostic et de Traitement de la Tuberculose de Pobè
-
Porto-Novo, Oueme/Plateau, Bénin
- Centre de Pneumo-Phtisiologie d'Akron
-
Sakété, Oueme/Plateau, Bénin
- Centre de Diagnostic et de Traitement de la Tuberculose de Sakété
-
-
Zou/Collines
-
Abomey, Zou/Collines, Bénin
- Centre de Diagnostic et de Traitement de la Tuberculose d'Abomey
-
Bohicon, Zou/Collines, Bénin
- Centre de Diagnostic et de Traitement de la Tuberculose de Bohicon
-
Dassa-Zoumè, Zou/Collines, Bénin
- Centre de Diagnostic et de Traitement de la Tuberculose de Dassa-Zoumè
-
Zagnanado, Zou/Collines, Bénin
- Centre de Diagnostic et de Traitement de la Tuberculose de Zagnanado
-
-
Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
Sexes éligibles pour l'étude
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
La description
Critère d'intégration:
- Patients tuberculeux nouveaux ou en retraitement avec une microscopie positive aux bacilles acido-résistants,
- Diagnostiqué dans une clinique antituberculeuse participante du Bénin,
- Âgé ≥ 15 ans (Les patients âgés de moins de 15 ans ne seront pas inclus dans cette étude car la microscopie des bacilles acido-résistants est rarement positive chez les enfants)
- Qui a donné son consentement éclairé (si participant potentiel adulte :≥18 ans) OU qui a donné son consentement en plus du consentement éclairé de son représentant légal (si participant potentiel âgé de 15-<18 ans)
Critère d'exclusion:
- Tuberculose extra-pulmonaire uniquement,
- Nouveau patient qui a commencé à prendre les médicaments de traitement de la tuberculose.
- Patient en retraitement qui a commencé à prendre les médicaments de retraitement antituberculeux.
- Très faible quantité de crachats (au moins 5 millilitres de crachats au total sont acceptables) et participant potentiel refusant de donner plus de crachats
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
---|---|
Nouveaux patients
Les « nouveaux patients tuberculeux » sont des patients qui viennent d'être diagnostiqués pour la tuberculose et qui n'ont jamais été traités pour la tuberculose ou qui sont traités depuis moins d'un mois.
Au total, 1192 nouveaux patients seront recrutés.
|
|
Patients en retraitement
Les ''tuberculeux en retraitement'' sont des patients venant d'être diagnostiqués tuberculeux et qui ont été préalablement traités pour tuberculose (d'une durée d'au moins 1 mois).
Ce groupe comprend : les patients en rechute, en échec et les patients qui reviennent après l'abandon.
Au total, 298 patients en retraitement seront recrutés.
|
Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
---|---|---|
Lignée
Délai: A l'inscription
|
Lignée de Mycobacterium tuberculosis déterminée par le modèle de spoligotypage.
La lignée sera déterminée à l'aide du spécimen prélevé lors de l'inscription des participants.
Le spoligotypage sera effectué sur les crachats ou sur l'isolat de culture en cas d'échec sur les crachats et si la culture est positive.
|
A l'inscription
|
Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
---|---|---|
Spoligotype (famille)
Délai: A l'inscription
|
Spoligotype (famille) de Mycobacterium tuberculosis tel que déterminé par le modèle de spoligotypage.
La lignée sera déterminée à l'aide du spécimen prélevé lors de l'inscription des participants.
|
A l'inscription
|
Échec ou succès du traitement mis en évidence par le résultat de la microscopie (pour les nouveaux patients et les patients en retraitement)
Délai: Au mois 6 pour le nouveau patient ; au mois 8 pour les patients en retraitement
|
L'échec du traitement sera constaté à la fin de la période de traitement en utilisant la microscopie pour la détection des bacilles acido-résistants dans les crachats des participants.
L'échec ou le succès du traitement sera mesuré par microscopie, uniquement pour les nouveaux patients et les patients en retraitement.
|
Au mois 6 pour le nouveau patient ; au mois 8 pour les patients en retraitement
|
Échec ou succès du traitement attesté par le résultat de la culture (pour les patients résistants à la rifampicine)
Délai: Au mois 20 pour les patients résistants à la rifampicine
|
L'échec du traitement sera confirmé à la fin de la période de traitement de 20 mois en cultivant des crachats de participants résistants à la rifampicine.
|
Au mois 20 pour les patients résistants à la rifampicine
|
Vérification des rechutes (par interrogatoire et vérification rétrospective des preuves microscopiques dans les cliniques antituberculeuses)
Délai: Au mois 18 pour les nouveaux patients ; au mois 20 pour les patients en retraitement ; au mois 32 pour les patients résistants à la rifampicine
|
Les participants seront appelés et on leur demandera s'ils ont vécu un autre épisode de tuberculose.
Cela sera confirmé rétrospectivement dans la clinique TB en vérifiant les résultats de la microscopie pour le nouvel épisode de tuberculose.
|
Au mois 18 pour les nouveaux patients ; au mois 20 pour les patients en retraitement ; au mois 32 pour les patients résistants à la rifampicine
|
Résultats de la radiographie pulmonaire
Délai: A l'inscription
|
Une radiographie pulmonaire sera effectuée chez les participants à inscrire à Cotonou et à Porto-Novo, les 2 plus grandes cliniques antituberculeuses et où la radiographie est disponible.
|
A l'inscription
|
Culture positive
Délai: A l'inscription
|
Isolement de mycobactéries (croissance mycobactérienne in vitro) en culture
|
A l'inscription
|
Phénotypique Résistance ou sensibilité aux médicaments
Délai: A l'inscription (si culture positive)
|
Résistance aux médicaments déterminée à l'aide d'un test de sensibilité phénotypique aux médicaments antituberculeux de 1re et 2e ligne
|
A l'inscription (si culture positive)
|
Résistance génotypique à la rifampicine (GeneXpert)
Délai: A l'inscription
|
Résistance de Mycobacterium tuberculosis à la rifampicine déterminée à l'aide du test GeneXpert Mtb/Rif.
|
A l'inscription
|
(Phénotypique) Type de mycobactéries (tuberculeuses ou non tuberculeuses)
Délai: A l'inscription (si culture positive)
|
Groupe de mycobactéries (tuberculeuses ou non tuberculeuses) tel que déterminé par le résultat des tests phénotypiques de sensibilité aux médicaments sur l'acide para-nitro-benzoïque
|
A l'inscription (si culture positive)
|
(Mpt64's) Type de mycobactéries (tuberculeuses ou non tuberculeuses)
Délai: A l'inscription (si culture positive)
|
Groupe de mycobactéries (tuberculeuses ou non tuberculeuses) tel que déterminé à l'aide du test de l'antigène Mpt64
|
A l'inscription (si culture positive)
|
Autres mesures de résultats
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
---|---|---|
Résultat de la microcopie des bacilles acido-résistants
Délai: Un jour
|
Résultat de la microcopie des bacilles acido-résistants sur les crachats des patients déterminés à l'aide de la méthode de Ziehl-Neelsen ou de la méthode à l'auramine selon laquelle de ces méthodes est utilisée dans les différentes cliniques de tuberculose où les participants seront inscrits.
|
Un jour
|
Microcopie de bacilles acido-résistants sur crachats regroupés
Délai: A l'inscription
|
Résultat de la microcopie des bacilles acido-résistants sur les expectorations regroupées de chaque participant.
Les crachats regroupés résultent de l'ajout des 2 crachats de routine restants d'un participant au troisième crachat donné après consentement éclairé.
Cette microcopie de bacilles acido-résistants sur crachats groupés sera effectuée après expédition des crachats groupés au laboratoire de référence (LRM), en utilisant la méthode à l'auramine.
|
A l'inscription
|
Résistance ou sensibilité aux médicaments (nouveaux tests de diagnostic)
Délai: A l'inscription
|
Modèle de résistance aux médicaments pour les médicaments de 1ère et 2ème lignes à l'aide de nouveaux tests de diagnostic.
|
A l'inscription
|
Collaborateurs et enquêteurs
Collaborateurs
Les enquêteurs
- Chercheur principal: Dissou Affolabi, MD PhD Prof, Laboratoire de Référence des Mycobactéries, Benin
- Chercheur principal: Bouke de Jong, MD PhD Prof, Institute of Tropical Medicine, Belgium
Publications et liens utiles
Publications générales
- Affolabi D, Anyo G, Faihun F, Sanoussi N, Shamputa IC, Rigouts L, Kestens L, Anagonou S, Portaels F. First molecular epidemiological study of tuberculosis in Benin. Int J Tuberc Lung Dis. 2009 Mar;13(3):317-22.
- Brudey K, Driscoll JR, Rigouts L, Prodinger WM, Gori A, Al-Hajoj SA, Allix C, Aristimuno L, Arora J, Baumanis V, Binder L, Cafrune P, Cataldi A, Cheong S, Diel R, Ellermeier C, Evans JT, Fauville-Dufaux M, Ferdinand S, Garcia de Viedma D, Garzelli C, Gazzola L, Gomes HM, Guttierez MC, Hawkey PM, van Helden PD, Kadival GV, Kreiswirth BN, Kremer K, Kubin M, Kulkarni SP, Liens B, Lillebaek T, Ho ML, Martin C, Martin C, Mokrousov I, Narvskaia O, Ngeow YF, Naumann L, Niemann S, Parwati I, Rahim Z, Rasolofo-Razanamparany V, Rasolonavalona T, Rossetti ML, Rusch-Gerdes S, Sajduda A, Samper S, Shemyakin IG, Singh UB, Somoskovi A, Skuce RA, van Soolingen D, Streicher EM, Suffys PN, Tortoli E, Tracevska T, Vincent V, Victor TC, Warren RM, Yap SF, Zaman K, Portaels F, Rastogi N, Sola C. Mycobacterium tuberculosis complex genetic diversity: mining the fourth international spoligotyping database (SpolDB4) for classification, population genetics and epidemiology. BMC Microbiol. 2006 Mar 6;6:23. doi: 10.1186/1471-2180-6-23.
- de Jong BC, Antonio M, Gagneux S. Mycobacterium africanum--review of an important cause of human tuberculosis in West Africa. PLoS Negl Trop Dis. 2010 Sep 28;4(9):e744. doi: 10.1371/journal.pntd.0000744.
- de Jong BC, Hill PC, Aiken A, Awine T, Antonio M, Adetifa IM, Jackson-Sillah DJ, Fox A, Deriemer K, Gagneux S, Borgdorff MW, McAdam KP, Corrah T, Small PM, Adegbola RA. Progression to active tuberculosis, but not transmission, varies by Mycobacterium tuberculosis lineage in The Gambia. J Infect Dis. 2008 Oct 1;198(7):1037-43. doi: 10.1086/591504.
- de Jong BC, Hill PC, Brookes RH, Otu JK, Peterson KL, Small PM, Adegbola RA. Mycobacterium africanum: a new opportunistic pathogen in HIV infection? AIDS. 2005 Oct 14;19(15):1714-5. doi: 10.1097/01.aids.0000185991.54595.41. No abstract available.
- Gehre F, Antonio M, Faihun F, Odoun M, Uwizeye C, de Rijk P, de Jong BC, Affolabi D. The first phylogeographic population structure and analysis of transmission dynamics of M. africanum West African 1--combining molecular data from Benin, Nigeria and Sierra Leone. PLoS One. 2013 Oct 15;8(10):e77000. doi: 10.1371/journal.pone.0077000. eCollection 2013.
- Affolabi D, Faihun F, Sanoussi N, Anyo G, Shamputa IC, Rigouts L, Kestens L, Anagonou S, Portaels F. Possible outbreak of streptomycin-resistant Mycobacterium tuberculosis Beijing in Benin. Emerg Infect Dis. 2009 Jul;15(7):1123-5. doi: 10.3201/eid1507.080697.
- Kamerbeek J, Schouls L, Kolk A, van Agterveld M, van Soolingen D, Kuijper S, Bunschoten A, Molhuizen H, Shaw R, Goyal M, van Embden J. Simultaneous detection and strain differentiation of Mycobacterium tuberculosis for diagnosis and epidemiology. J Clin Microbiol. 1997 Apr;35(4):907-14. doi: 10.1128/jcm.35.4.907-914.1997.
- Gagneux S, Small PM. Global phylogeography of Mycobacterium tuberculosis and implications for tuberculosis product development. Lancet Infect Dis. 2007 May;7(5):328-37. doi: 10.1016/S1473-3099(07)70108-1.
- Castets M. [Mycobacterium africanum (author's transl)]. Med Trop (Mars). 1979 Mar-Apr;39(2):145-8. French.
- Parwati I, van Crevel R, van Soolingen D, van der Zanden A. Application of spoligotyping to noncultured Mycobacterium tuberculosis bacteria requires an optimized approach. J Clin Microbiol. 2003 Nov;41(11):5350-1. doi: 10.1128/JCM.41.11.5350-5351.2003. No abstract available.
- Asante-Poku A, Yeboah-Manu D, Otchere ID, Aboagye SY, Stucki D, Hattendorf J, Borrell S, Feldmann J, Danso E, Gagneux S. Mycobacterium africanum is associated with patient ethnicity in Ghana. PLoS Negl Trop Dis. 2015 Jan 8;9(1):e3370. doi: 10.1371/journal.pntd.0003370. eCollection 2015 Jan.
- Yin X, Zheng L, Lin L, Hu Y, Zheng F, Hu Y, Wang Q. Commercial MPT64-based tests for rapid identification of Mycobacterium tuberculosis complex: a meta-analysis. J Infect. 2013 Nov;67(5):369-77. doi: 10.1016/j.jinf.2013.06.009. Epub 2013 Jun 22.
- Sanoussi CN, de Jong BC, Affolabi D, Meehan CJ, Odoun M, Rigouts L. Storage of Sputum in Cetylpyridinium Chloride, OMNIgene.SPUTUM, and Ethanol Is Compatible with Molecular Tuberculosis Diagnostic Testing. J Clin Microbiol. 2019 Jun 25;57(7):e00275-19. doi: 10.1128/JCM.00275-19. Print 2019 Jul.
- Sanoussi CN, Affolabi D, Rigouts L, Anagonou S, de Jong B. Genotypic characterization directly applied to sputum improves the detection of Mycobacterium africanum West African 1, under-represented in positive cultures. PLoS Negl Trop Dis. 2017 Sep 1;11(9):e0005900. doi: 10.1371/journal.pntd.0005900. eCollection 2017 Sep.
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Réel)
Achèvement de l'étude (Réel)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Estimation)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Mots clés
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- LRM-N°030-15/12/2015
- CNERS N°030 of 15th/12/2015 (Autre identifiant: Comité National d'Ethique et de Recherche en Santé du Benin)
- ITM- N°1040/15 (Autre identifiant: IRB of Institute of Tropical Medicine Belgium)
- EC UZA 15/49/532 (Autre identifiant: University of Antwerp, Belgium; Ethics Committee)
- Belg registN°:B300201526865 (Autre identifiant: University of Antwerp, Belgium; Ethics Committee)
Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .
Essais cliniques sur Aucune intervention (étude observationnelle)
-
University of Maryland, BaltimoreBill and Melinda Gates FoundationComplété